Отдел разнообразия и эволюции геномов

Лаборатория цитогенетики животных

Графодатский Александр Сергеевич
Заведующий отделом
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-63

Curriculum vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Графодатский Александр Сергеевич зав. лаб. дбн grafatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Романенко Светлана Анатольевна внс дбн rosaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Перельман Полина Львовна внс кбн perelmanpatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Беклемишева Виолетта Робертовна снс кбн beklatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Проскурякова Анастасия Андреевна снс кбн andrenaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лемская Наталья Анатольевна снс кбн lemnatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кулемзина Анастасия Игоревна нс кбн zakalatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Молодцева Анна Сергеевна мнс кбн radaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg   Куслий Мария Александровна мнс кбн kusliy [dot] mariaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Сердюкова Наталья Алькуатовна нc   serdatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Бутакова Юлия Викторовна инженер 1 кат.   butakovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Иванова Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Маликов Дмитрий Геннадьевич нс совм.    
        Тишакова Катерина Валерьевна мнс совм.    

Бывшие сотрудники:

Батурина Анастасия Константиновна
Гладких Ольга Леонидовна
Давлетшина Гузель Ильдаровна
Кичигин Илья Геннадьевич		 Макунин Алексей Игоревич, кбн
Прокопов Дмитрий Юрьевич
Фофанов Михаил Викторович
 

Направления исследований: 
  • Организация и эволюция хромосом и геномов позвоночных
  • Палеогеномика
G10K.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов Genome10K
vgp.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей большого международного консорциума по секвенированию и анализу геномов позвоночных
bat1k.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов летучих мышей
APP_logo.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов птиц
IMCB_DNA_Zoo.JPG

Сотрудники лаборатории составляют филиал международного консорциума DNA Zoo – DNA Zoo Novosibirsk. Задача консорциума - это сборка и исследование трехмерной организации геномов млекопитающих, птиц, рептилий и беспозвоночных

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Сборка генома масайского жирафа
Эволюционное древо комодского варана
Как хищники стали травоядными
Хромосомная живопись: как увидеть эволюцию в геноме
Митохондриальная ДНК древнего медведя
Митохондриальная ДНК древней овцы
Секвенирование ДНК вымершей лошади
Цитогенетика ластоногих (нерпы, моржи, тюлени)
Геномика собаки
Расшифровка генома африканского гепарда
Гетерохроматин – хорошо забытая часть генома
Птицы сэкономили на геноме
Где и когда появились первые собаки?
Биология: от Линнея до "Атласа хромосом"
Секвенирование ДНК древней собаки
Геном древнейшей в Азии собаки
Генетики нашли в Америке "родственников" древнейшей алтайской собаки

SB_RAS.jpg чл.-корр. РАН АС Графодатский. Выступление на заседании Президиума СО РАН 25.03.2022
Wikipedia_logo.png Genome diversity and karyotype evolution of mammals
video_icon.jpg дбн АС Графодатский рассуждает о науке и религии
MIR.jpg Интервью АС Дружковой о древней ДНК
you_tube.jpg Кито-парнокопытные в воде и на суше. Публичная лекция АА Проскуряковой 
you_tube.jpg Очень древняя ДНК. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Геномика псовых. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Хромосомы, геномы и эволюция млекопитающих. Публичная лекция дбн АС Графодатского
you_tube.jpg Зачем нужен зоопарк в бочонке. дбн АС Графодатский в проекте Эврика!

Публикации: 

  1. Proskuryakova AA, Ivanova ES, Perelman PL, Ferguson-Smith MA, Yang F, Okhlopkov IM, Graphodatsky AS. Comparative studies of karyotypes in the Cervidae family. Cytogenet Genome Res, 2022, doi: 10.1159/000527349

  2. Yakupova A, Tomarovsky A, Totikov A, Beklemisheva V, Logacheva M, Perelman PL, Komissarov A, Dobrynin P, Krasheninnikova K, Tamazian G, Serdyukova NA, Rayko M, Bulyonkova T, Cherkasov N, Pylev V, Peterfeld V, Penin A, Balanovska E, Lapidus A, Consortium DZ, O'Brien SJ, Graphodatsky A, Koepfli K-P, Kliver S. Chromosome-length assembly of the Baikal seal (Pusa sibirica) genome reveals a historically large population prior to isolation in lake Baikal. (doi: 10.3390/genes14030619) Genes 14(3): 619, 2023

  3. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DY, Perelman PL, Romanenko SA, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Utkin YA, Nie W, Ferguson-Smith MA, Fentang Y, Graphodatsky AS. Maps of constitutive-heterochromatin distribution for four martes species (Mustelidae, Carnivora, Mammalia) show the formative role of macrosatellite repeats in interspecific variation of chromosome structure. (doi: 10.3390/genes14020489) Genes 14(2): 489, 2023

  4. Mesentsev Y, Bondarenko N, Kamyshatskaya O, Nassonova E, Glotova A, Loiko S, Istigechev G, Kulemzina A, Abakumov E, Rayko M, Lapidus A, Smirnov A. Thecochaos is not a myth: study of the genus Thecochaos (Amoebozoa, Discosea) – a rediscovered group of lobose amoeba, with short SSU gene. (doi: 10.1007/s13127-022-00581-9) Org Divers Evol 23: 7-24, 2023

  5. Dumas F, Perelman PL, Biltueva L, Roelke M. Retrotransposon mapping in spider monkey genomes of the family Atelidae (Platyrrhini, Primates) shows a high level of LINE-1 amplification. (doi: 10.4081/jbr.2022.10725) J Biol Res 95(2): 10725, 2022

  6. Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA. New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri. (doi: 10.1134/S003294522206011X) J Ichthyol 62(7): 1230-1236, 2022

  7. Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA. Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania). (doi: 10.3390/ijms232415838) Int J Mol Sci 23(24): 15838, 2022

  8. Уфыркина ОВ, Беклемишева ВР, Гончарук МС, Керли Л, Графодатский АС, Перельман ПЛ. О необходимости внесения дальневосточного лесного кота Prionailurus bengalensis euptilura в Красные книги Приморского Края и Российской Федерации. (doi: 10.25221/2782-1978_2022_3_3) Биота и среда природных территорий 10(3): 21-35, 2022

  9. Тиунов МП, Проскурякова АА, Батурина АК, Перельман ПЛ, Графодатский АС. Новый вид летучей мыши Eptesicus pachyomus (Chiroptera, Vespertilionidae) в фауне России. (doi: 10.31857/S004451342212011X) Зоологический журнал 101(12): 1424-1428, 2022

  10. Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs. (doi: 10.3390/ijms232113063) Int J Mol Sci 23(21): 13063, 2022

  11. Romanenko S, Trifonov V. Chapter 3. Generation of microdissection-derived painting probes from single copy chromosomes. In: Liehr T (ed.) Cytogenetics and Molecular Cytogenetics, CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 2022, pp 27-34 (doi: 10.1201/9781003223658)

  12. Milioto V, Perelman PL, Paglia LL, Biltueva L, Roelke M, Dumas F. Mapping retrotransposon LINE-1 sequences into two Cebidae species and Homo sapiens genomes and a short review on primates. (doi: 10.3390/genes13101742) Genes 13(10): 1742, 2022

  13. de Ferran V, ..., Kliver S, Serdyukova N, ..., Eizirik E. Phylogenomics of the world’s otters. (doi: 10.1016/j.cub.2022.06.036) Curr Biol 32(16): 3650-3658.e4, 2022

  14. Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА. Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири. (doi: 10.35885/1996-1499-15-2-38-42) Российский журнал биологических инвазий 15(2): 38-42, 2022

  15. Molodtseva AS, Makunin AI, Salomashkina VV, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov GG, Mamaev N, Okhlopkov IM, Kryukov AP, Lyapunova EA, Kholodova MV, Seryodkin IV, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Phylogeography of ancient and modern brown bears from eastern Eurasia. (doi: 10.1093/biolinnean/blac009) Biol J Linn Soc 135(4): 722-733, 2022

  16. Suchan T, Kusliy MA, Khan N, Chauvey L, Tonasso-Calvière L, Schiavinato S, Southon J, Keller M, Kitagawa K, Krause J, Bessudnov AN, Bessudnov AA, Graphodatsky AS, Lamas SV, Wilczyński J, Pospuła S, Tunia K, Nowak M, Moskal-delHoyo M, Tishkin AA, Pryor AJ, Outram AK, Orlando L. Performance and automation of ancient DNA capture with RNA hyRAD probes. (doi: 10.1111/1755-0998.13518) Mol Ecol Resour 22(3): 891-907, 2022

  17. Rajičić M, Makunin A, Adnađević T, Trifonov V, Vujošević M, Blagojević J. B chromosomes’ sequences in yellow-necked mice Apodemus flavicollis — exploring the transcription. (doi: 10.3390/life12010050) Life 12(1): 50, 2022

  18. Ceraulo S, Perelman PL, Dumas F. Massive LINE-1 retrotransposon enrichment in tamarins of the Cebidae family (Platyrrhini, Primates) and its significance for genome evolution. (doi: 10.1111/jzs.12536) J Zool Syst Evol Res 59(8): 2553-2561, 2021 

  19. Beklemisheva VR, Belokopytova PS, Fishman VS, Menzorov AG. Derivation of ringed seal (Phoca hispida) induced multipotent stem cells. (doi: 10.1089/cell.2021.0037) Cell Reprogram 23(6): 326-335, 2021

  20. Gridina MM, Shitik EM, Lemskaya NA, Minina JM, Grishchenko IV, Dolskiy AA, Shorina AR, Maksimova YV, Yudkin DV. Derivation of iPS cell line (ICGi032-A) from a patient affected with fragile X syndrome. (doi: 10.1016/j.scr.2021.102615) Stem Cell Res 57: 102615, 2021

  21. Никитин СВ, Князев СП, Трифонов ВА, Проскурякова АА, Шмидт ЮД, Шатохин КС, Запорожец ВИ, Башур ДС, Коршунова ЕВ, Ермолаев ВИ. Необычная врожденная полидактилия мини-свиней селекционной группы ИЦиГ СО РАН. (doi: 10.18699/VJ21.074) Вавиловский журнал генетики и селекции 25(6): 652-660, 2021

  22. Tamazian G, Dobrynin P, Zhuk A, Zhernakova DV, Perelman PL, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Komissarov A, Kliver S, Cherkasov N, Scott AF, Mohr DW, Koepfli K-P, O’Brien SJ, Krasheninnikova K. Draft de novo genome assembly of the elusive jaguarundi, Puma yagouaroundi. (doi: 10.1093/jhered/esab036) J Heredity 112(6): 540-548, 2021

  23. Librado P, ... Kusliy MA, ... Graphodatsky AS, ... Orlando L. The origins and spread of domestic horses from the Western Eurasian steppes. (doi: 10.1038/s41586-021-04018-9) Nature 598: 634-640, 2021

  24. Lemskaya NA, Romanenko SA, Rezakova MA, Filimonova EA, Prokopov DY, Dolskiy AA, Perelman PL, Maksimova YV, Shorina AR, Yudkin DV. A rare familial rearrangement of chromosomes 9 and 15 associated with intellectual disability: a clinical and molecular study. (doi: 10.1186/s13039-021-00565-y) Mol Cytogenet 14: 47, 2021

  25. Ceraulo S, Perelman PL, Mazzoleni S, Rovatsos M, Dumas F. Repetitive sequence distribution on Saguinus, Leontocebus and Leontopithecus tamarins (Platyrrhine, Primates) by mapping telomeric (TTAGGG) motifs and rDNA loci. (doi: 10.3390/biology10090844) Biology 10(9): 844, 2021

  26. Totikov A, Tomarovsky A, Prokopov D, Yakupova A, Bulyonkova T, Derezanin L, Rasskazov D, Wolfsberger WW, Koepfli K-P, Oleksyk TK, Kliver S. Chromosome-level genome assemblies expand capabilities of genomics for conservation biology. (doi: 10.3390/genes12091336) Genes 12(9): 1336, 2021

  27. Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 193-209 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  28. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 211-224 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  29. Buggiotti L, Yurchenko AA, Yudin NS, Vander Jagt CJ, Vorobieva NV, Kusliy MA, Vasiliev SK, Rodionov AN, Boronetskaya OI, Zinovieva NA, Graphodatsky AS, Daetwyler HD, Larkin DM. Demographic history, adaptation, and NRAP convergent evolution at amino acid residue 100 in the world northernmost cattle from Siberia. (doi: 10.1093/molbev/msab078) Mol Biol Evol 38(8): 3093-3110, 2021

  30. Lisachov AP, Tishakova KV, Romanenko SA, Molodtseva AS, Prokopov DYu, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Whole-chromosome fusions in the karyotype evolution of Sceloporus (Iguania, Reptilia) are more frequent in sex chromosomes than autosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0099) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1833): 20200099, 2021

  31. Kuhl H, ... Prokopov D, ... Stöck M. A 180 Myr-old female-specific genome region in sturgeon reveals the oldest known vertebrate sex determining system with undifferentiated sex chromosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0089) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1832): 20200089, 2021

  32. Karamysheva T, Romanenko S, Makunin A, Rajičić M, Bogdanov A, Trifonov V, Blagojević J, Vujošević M, Orishchenko K, Rubtsov N. New data on organization and spatial localization of B-chromosomes in cell nuclei of the yellow-necked mouse Apodemus flavicollis. (doi: 10.3390/cells10071819) Cells 10(7): 1819, 2021

  33. Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian M, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. (doi: 10.3390/genes12070964) Genes 12(7): 964, 2021

  34. Höhne C, Prokopov D, Kuhl H, Du K, Klopp C, Wuertz S, Trifonov V, Stöck M. The immune system of sturgeons and paddlefish (Acipenseriformes): a review with new data from a chromosome‐scale sturgeon genome. (doi: org/10.1111/raq.12542) Rev Aquacult 13(3): 1709-1729, 2021

  35. Lisachov A, Andreyushkova D, Davletshina G, Prokopov D, Romanenko S, Galkina S, Saifitdinova A, Simonov E, Borodin P, Trifonov V. Amplified fragments of an autosome-borne gene constitute a significant component of the W sex chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). (doi: 10.3390/genes12050779) Genes 12(5): 779, 2021

  36. Romanenko SA, Lebedev VS, Bannikova AA, Pavlova SV, Serdyukova NA, Feoktistova NYu, Jiapeng Q, Yuehua S, Surov AV, Graphodatsky AS. Karyotypic and molecular evidence supports the endemic Tibetan hamsters as a separate divergent lineage of Cricetinae. (doi: 10.1038/s41598-021-89890-1) Sci Rep 11: 10557, 2021

  37. Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Molodtseva AS, Perelman PL, Interesova EA, Beklemisheva VR, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolution of tandemly arranged repetitive DNAs in three species of Cyprinoidei with different ploidy levels. (doi: 10.1159/000513274) Cytogenet Genome Res 161: 32-42, 2021

  38. Mordvinov VA, Minkova GA, Kovner AV, Ponomarev DV, Lvova MN, Zaparina O, Romanenko SA, Shilov AG, Pakharukova MY. A tumorigenic cell line derived from a hamster cholangiocarcinoma associated with Opisthorchis felineus liver fluke infection. (doi: 10.1016/j.lfs.2021.119494) Life Sci 277: 119494, 2021

  39. Lemskaya NA, Romanenko SA, Maksimova YV, Shorina AR, Yudkin DV. Identification of satellited markers by microdissection and fluorescence in situ hybridization: a clinical case of isodicentric chromosome 22. (doi: 10.1186/s43042-021-00146-z) Egypt J Med Hum Genet 22: 24, 2021

  40. Трифонов ВА Шаймуратова ДН, Асылгараева ГШ, Монахов СП, Молодцева АС, Аськеев АО, Аськеев ИВ, Аськеев ОВ. Археогеномика доместикации животных Евразии. (doi: 10.24852/pa2021.1.35.179.186) Поволжская Археология 1(35): 179-186, 2021

  41. Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron age mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. In: 
    eds. Caramelli D, Lari M, Vai S (eds) Ancient and Archaic Genomes, MDPI, Switzerland, 2021, pp 5-19

  42. Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron Age Mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. (doi: 10.3390/genes12030412) Genes 12(3): 412, 2021

  43. Побединцева МА, Решетникова СН, Сердюкова НА, Бишани А, Трифонов ВА, Интересова ЕА. Генетическая гетерогенность серебряного карася Carassius gibelio (Cyprinidae) в бассйне средней Оби. (doi: 10.31857/S0016675821040111) Генетика 57(4): 429-436, 2021

  44. Evdokimov A., Popov A., Ryabchikova E., Koval O., Romanenko S., Trifonov V., Petruseva I., Lavrik I., Lavrik O. Uncovering molecular mechanisms of regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.18632/aging.202577) Aging (Albany NY) 13(3): 3239-3253, 2021

  45. Iannucci A, Makunin AI, Lisachov AP, Ciofi C, Stanyon R, Svartman M, Trifonov VA. Bridging the gap between vertebrate cytogenetics and genomics with single-chromosome sequencing (ChromSeq). (doi: 10.3390/genes12010124) Genes 12(1): 124, 2021

  46. Dolskiy AA, Yarushkin AA, Grishchenko IV, Lemskaya NA, Pindyurin AV, Boldyreva LV, Pustylnyak VO, Yudkin DV. miRNA expression and interaction with the 3′UTR of FMR1 in FRAXopathy pathogenesis. (doi: 10.1016/j.ncrna.2020.11.006) Non-coding RNA Res 6(1): 1-7, 2021

​Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0015 (122011800125-7) Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Гранты РНФ

19-14-00034-П (продление на 2022-2023) Аутосомы, половые и добавочные хромосомы позвоночных. Организация и эволюция. Графодатский АС

22-24-01076 Сравнительная геномика: анализ эволюционных изменений синтенных блоков хромосом (отряды Хищных и Китопарнокопытных) на основе карт Hi-C. Перельман ПЛ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Трифонов ВА, Фофанов МВ. Паттерны редиплоидизации после полногеномных дупликаций у животных. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 85

  2. Fofanov MV, Prokopov DYu, Trifonov VA, Beklemisheva VR, Khan R, Aiden E, Graphodatsky AS, Perelman PL. Comparative bioinformatic analysis of Hi-C chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 113-114

  3. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DYu, Romanenko SA, Serdyukova NA, Utkin YaA, Graphodatsky AS. Detailed analysis of distribution of repetitive sequences across genomes of Martes (Mustelidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 137-138

  4. Proskuryakova AA. Chromosome evolution in Ruminantia. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 165

  5. Romanenko SA, Proskuryakova AA, Prokopov DYu, Davletshina GI, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 167-168

  6. Tishakova K, Prokopov D, Davletshina G, O’Brien P, Ferguson-Smith M, Giovannotti M, Trifonov V. Composition of sex chromosomes of veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Squamata) reveals new insights into sex chromosome evolution of iguanian lizards. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 179

  7. Minina JM, Karamysheva TV, Serdyukova NA, Serov OL. Quantitative estimation of trisomy on chromosome 6 in embryonic fibroblasts of mice carrying duplications obtained using CRISPR/Cas9 technology. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 672-673

  8. Buggiotti L, Romashov G, Yurchenko A, Yudin NS, Zinovieva NA, Graphodatsky A, Larkin D. Does an extreme climate make domestic and wild animals evolve similarly? #43462, Abstract book. XXIX Conference "Plant and Animal Genome", January 8-12, 2022, San Diego, CA, USA

  9. Куслий МА, Тишкин АА, Воробьева НВ, Семибратов ВП, Кирюшин КЮ, Ковалев АА, Эрдэнэбаатар Д, Графодатский АС. Палеогенетические определения мастей и пола у лошадей из древних памятников Алтая. С. 323-328. В кн.: Материалы XI Международной научной конференции "Древние культуры Монголии, Южной Сибири и Северного Китая" (doi: 10.31600/978-5-907298-19-4.323-328). Абакан, 2021

  10. Popov A, Evdokimov A, Ryabchikova E, Koval O, Romanenko S, Trifonov V, Petruseva I, Lavrik I, Lavrik O. Regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 466 (P-08.4-13), 2021

  11. Rayko M, Kulemzina A, Abakumov E, Istigechev G, Andronov E, Lashchinsky N, Lapidus A. Metagenomic analysis of the soil microbiota associated with plant gigantism of the unique Siberian Chernevaya Taiga. Selected abstracts of “Bioinformatics: from Algorithms to Applications 2020” conference. (doi: 10.1186/s12859-020-03838-2) BMC Bioinformatics 21(Suppl 20): P4, 2020 

  12. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторенной ДНК в геномах осетрообразных. Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов 2020", М.: МАКС Пресс, 2020, ISBN 978-5-317-06417-4

  13. Tishakova K, Prokopov D, Kichigin I, Molodtseva A, Kratochvil L, Lisachov A, Trifonov V. Analysis of sequenced chromosome-specific libraries of gekkonids sheds light to large scale genome reshuffling in reptiles. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-164) Novosibirsk, 2020, p. 260

  14. Popov A, Evdokimov A, Petruseva I, Romanenko S, Trifonov V, Koval O, Lavrik I, Ryabchikova E, Lavrik O. Regulated cell death in Hetherocephalus glaber. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-365) Novosibirsk, 2020, p. 597

  15. Davletshina G, Kliver S, Prokopov D, Interesova E, Trifonov V. Application of ITS1 and ITS2 for population genetic studies of sturgeons (Acipenseridae). The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-133) Novosibirsk, 2020, p. 209

  16. Куслий МА, Хан Н, Тишкин АА, Кирюши КЮ, Фаж А, Воробьева НВ, Графодатский АС, Орландо Л. Предварительные результаты молекулярно-генетического анализа остеологических материалов от древних лошадей из поселений Новоильинеп-III и VI (Кулундинская степь). Труды VI (XXII) Всероссийского археологического съезда в Самаре. В 3-х томах. Том. III. с. 253-255. Самара, 2020, ISBN: 978-5-8428-1171-7

  17. Куслий МА, ..., Графодатский АС, Орландо Л. Предварительный анализ древней ДНК 170 остеологических образцов от лошадей, обитавших в Азии. C. 182-187. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  18. Куслий МА, Тишкин АА, Фаж А, Либрадо П, Хан Н, Боковенко НА, Идэрхангай Т-О, Чугунов КВ, Графодатский АС, Орландо Л. Особенности селекции лошадей в аржано-майэмирское время на Алтае, в  Туве И Монголии. C. 188-192. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  19. Воробьева НВ, Куслий МА, Дружкова АС, Макунин АИ, Попова КО, Трифонов ВА, Графодатский АС, Васильев СК, Полосьмак НВ, Молодин ВИ. Филогеография древних лошадей из курганов плато Укок. C. 232-235. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

​Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Фофанов М. Comparative bioinformatic analysis of HiC chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск 

  2. Проскурякова А. Chromosome evolution in Ruminantia. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  3. Романенко С. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  4. Фофанов М. Application of hi-c genome scaffolding to improve cytogenetic chromosome maps and detect genomic rearrangements. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  5. Давлетшина Г. Секвенирование полных митохондриальных геномов белуг из археологических раскопок Поволжья. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  6. Романенко С. Хромосомные перестройки в эволюции генома нильского крокодила (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia). III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  7. Тишакова Е. Идентификация предковых синтенных блоков и половых  хромосом у йеменского хамелеона (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Reptilia). III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  8. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторённой ДНК в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  9. Кичигин ИГ. Изучение генетического состава половых и добавочных хромосом чешуйчатых (Squamata, Reptilia) с помощью секвенирования изолированных хромосом. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  10. Grafodatsky AS. From 2n to VGP. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  11. Druzhkova AS. The phylogeographical history of the brown bear (Ursus arctos Linnaeus) in Northeast Eurasia. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск 

  12. Proskuryakova AA. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  13. Makunin AI. Summary of mammalian B chromosome sequencing. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  14. Romanenko SA. Intrachromosomal rearrangements within evolutionarily conserved syntenic blocks. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  15. Beklemisheva V. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  16. Proskuryakova A. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  17. Прокопов ДЮ. Происхождение и эволюция половых и добавочных хромосом копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus). XXV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов", 9-13 апреля 2018, Москва

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics, University of Cambridge, UK
    Эволюция кариотипов и половых хромосом рептилий

  • National Cancer Institute at Frederick, MD, USA
    Сравнительная геномика млекопитающих

  • Cornell University, Ithaca, NY, USA
    Сравнительная геномика

  • University of North Carolina at Chapel Hill, NC, USA
    Сравнительная геномика

  • Institut für Humangenetik, Jena, Germany
    Сравнительная геномика

  • Muséum national d'histoire naturelle, Paris, France
    Сравнительная геномика

  • Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Toulouse, France
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Firenze, Florence, Italy
    Сравнительная геномика

  • Kunming Institute of Zoology, China
    Сравнительная геномика

  • Universidade de São Paulo, Câmpus de Rio Claro, Brasil
    Цитогенетика неотропических рыб

  • University of Illinois at Urbana, Champaign, IL, USA
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Palermo, Italy
    Сравнительная геномика

Награды: 

Премия СО АН СССР

Графодатский АС (1986)

Премия РАН им. АА Баева

Графодатский АС (1995)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Перельман ПЛ (2003)
Проскурякова АА (2020)

Звание “Лучший аспирант РАН”

Романенко СА (2007)

Гранты Президента РФ для молодых кандидатов наук

Романенко СА (2010)

Национальная премия Л'Ореаль-ЮНЕСКО при поддержке РАН “Для женщин в науке”

Романенко СА (2012)

Юбилейная медаль “80 лет Новосибирской области”

Графодатский АС (2017)

Именная стипендия Правительства Новосибирской области

Прокопов ДЮ (2021)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Романенко СА (2018)
Лемская НА (2018)
Проскурякова АА (2019)

Памятный знак "За труд на благо города"

Беклемишева ВР, Графодатский АС, Сердюкова НА (2013)

Почетная грамота СО РАН

Графодатский АС (2021)

Отдел регуляции генетических процессов