Отдел разнообразия и эволюции геномов

Лаборатория цитогенетики животных

Графодатский Александр Сергеевич
Заведующий отделом
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-63

Curriculum vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Графодатский Александр Сергеевич зав. лаб. дбн   grafatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Романенко Светлана Анатольевна внс дбн rosaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Перельман Полина Львовна внс кбн perelmanpatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Беклемишева Виолетта Робертовна снс кбн beklatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Проскурякова Анастасия Андреевна снс кбн andrenaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лемская Наталья Анатольевна снс кбн lemnatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Молодцева Анна Сергеевна нс кбн radaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg   Куслий Мария Александровна нс кбн kusliy [dot] mariaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Сердюкова Наталья Алькуатовна нc   serdatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Уткин Ярослав Александрович мнс   utkin [dot] jaroslavatmcb [dot] nsc [dot] ru 
        Бутакова Юлия Викторовна инженер 1 кат.   butakovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Шаяхметова Лилия Шагитовна ст. лаб.-иссл.    
        Самарина Снежана Алексеевна ст. лаб.-иссл.    
        Маликов Дмитрий Геннадьевич нс совм. кг-мн  
  scopus_logo.jpg     Иванова Екатерина Сергеевна мнс совм.    
  scopus_logo.jpg     Тишакова Катерина Валерьевна мнс совм.    

Бывшие сотрудники:

Батурина Анастасия Константиновна
Воробьева Надежда Валентиновна, кбн
Гладких Ольга Леонидовна
Давлетшина Гузель Ильдаровна
Дьяконова Александра Тимофеевна		 Кичигин Илья Геннадьевич
Кулемзина Анастасия Игоревна, кбн
Макунин Алексей Игоревич, кбн
Прокопов Дмитрий Юрьевич, кбн
Фофанов Михаил Викторович

Направления исследований: 
  • Организация и эволюция хромосом и геномов позвоночных
  • Палеогеномика
G10K.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов Genome10K
vgp.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей большого международного консорциума по секвенированию и анализу геномов позвоночных
bat1k.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов летучих мышей
APP_logo.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов птиц
IMCB_DNA_Zoo.JPG

Сотрудники лаборатории составляют филиал международного консорциума DNA Zoo – DNA Zoo Novosibirsk. Задача консорциума - это сборка и исследование трехмерной организации геномов млекопитающих, птиц, рептилий и беспозвоночных

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Остекленевшие хромосомы мамонта
Происхождение домашней лошади
Сборка генома масайского жирафа
Эволюционное древо комодского варана
Как хищники стали травоядными
Секвенирование ДНК вымершей лошади
Расшифровка генома африканского гепарда
Птицы сэкономили на геноме
Где и когда появились первые собаки?

SB_RAS.jpg чл.-корр. РАН АС Графодатский. Выступление на заседании Президиума СО РАН 25.03.2022
Wikipedia_logo.png Genome diversity and karyotype evolution of mammals
video_icon.jpg дбн АС Графодатский рассуждает о науке и религии
MIR.jpg Интервью АС Дружковой о древней ДНК
you_tube.jpg Кито-парнокопытные в воде и на суше. Публичная лекция АА Проскуряковой 
you_tube.jpg Очень древняя ДНК. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Геномика псовых. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Зачем нужен зоопарк в бочонке. дбн АС Графодатский в проекте Эврика!

Публикации: 

  1. Pavlova SV, Romanenko SA, Matveevsky SN, Kuksin AN, Dvoyashov IA, Kovalskaya YuM, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Petrova TV.  Supernumerary chromosomes enhance karyotypic diversification of narrow-headed voles of the subgenus Stenocranius (Rodentia, Mammalia). J Exp Zool B Mol Dev Evol, 2024, doi: 10.1002/jez.b.23273

  2. Модина СА, Куслий МА, Маликов ДГ, Молодцева АС. Филогеография шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius) в Минусинской котловине на Юге Сибири в позднем плейстоцене. (doi: 10.18699/vjgb-24-63) Вавиловский журнал генетики и селекции 28(5): 571-577, 2024

  3. Librado P, ...  Kusliy MA, ... Graphodatsky AS, ... Orlando L. Widespread horse-based mobility arose around 2,200 BCE in Eurasia. (doi: 10.1038/s41586-024-07597-5) Nature 631 (8022): 819-825, 2024

  4. Malikov DG, Burova VV, Klementiev AM, Malikova EL. The distribution of the cave lion Panthera spelaea and the cave hyena Crocuta spelaea in the Late Pleistocene of Baikal-Yenisei Siberia. (doi: 10.15298/rusjtheriol.23.1.09) Rus J Theriol 231: 83-94, 2024

  5. Sandoval-Velasco M, ... Kusliy MA, Romanenko SA, Lemskaya NA, Serdyukova NA, Modina SA, Perelman PL, ... Graphodatsky AS, ... Aiden EL. Three-dimensional genome architecture persists in a 52,000-year-old woolly mammoth skin sample. (doi: 10.1016/j.cell.2024.06.002) Cell 187(14): 3541-3562.e51, 2024

  6. Bujnáková D, Lansink GMJ, Abramov AV, Bulyonkova T, Dokuchaev NE, Domanov T, Dvornikov MG, Graphodatsky A, Karabanina E, Kliver S, Korolev AN, Kozhechkin VV, Litvinov YuN, Mamaev N, Monakhov VG, Nanova O, Okhlopkov I, Saveljev AP, Schinov A, Shiriaeva E, Sidorov M, Tirronen KF, Zakharov ES, Zakharova NN, Aspi J, Kvist L. Expanding from local to continental scale—A genetic assessment of the Eurasian wolverine. (doi: 10.1111/ddi.13846) Divers Distrib 30(7): e13846, 2024 

  7. Куслий МА, Маликов ДГ, Аськеев ИВ, Клементьев АМ, Воробьева НВ, Графодатский АС, Молодцева АС. Определение вида древних и средневековых представителей рода Equus на основе генетических данных. (doi: 10.24852/2587-6112.2024.1.98.115) Археология Евразийских степей 1: 98-115, 2024

  8. Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian  Mansour, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. In: The Stability and Evolution of Genes and Genomes (eds. Viggiano L, Marsano RM), MDPI, Basel, Switzerland, 2024, pp 56-72 (doi: 10.3390/books978-3-0365-9802-4)

  9. Kononova Y, Adamenko L, Kazachkova E, Solomatina M, Romanenko S, Proskuryakova A, Utkin Y, Gulyaeva M, Spirina A, Kazachinskaia E, Palyanova N, Mishchenko O, Chepurnov A, Shestopalov A. Features of SARS-CoV-2 replication in various types of reptilian and fish cell cultures. (doi: 10.3390/v15122350) Viruses 15(12): 2350, 2023

  10. Romanenko SA, Kliver SF, Serdyukova NA, Perelman PL, Trifonov VA, Seluanov A, Gorbunova V, Azpurua J, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Integration of fluorescence in situ hybridization and chromosome-length genome assemblies revealed synteny map for guinea pig, naked mole-rat, and human. (doi: 10.1038/s41598-023-46595-x) Sci Rep 13: 21055, 2023

  11. Куслий МА, Графодатский АС, Тишкин АА. Генетические исследования древних и современных лошадей Алтая и сопредельных территорий. В сборнике: "Современные решения актуальных проблем евразийской археологии". Отв. редактор АА Тишкин, Барнаул 2023, с 70-78

  12. Lisachov A, Tishakova K, Romanenko S, Lisachova L, Davletshina G, Prokopov D, Kratochvíl L, O'Brien P, Ferguson-Smith M, Borodin P, Trifonov V. Robertsonian fusion triggers recombination suppression on sex chromosomes in Coleonyx geckos. (doi: 10.1038/s41598-023-39937-2) Sci Rep 13: 15502, 2023

  13. Kliver S, Houck ML, Perelman PL, Totikov A, Tomarovsky A, Dudchenko O, Omer AD, Colaric Z, Weisz D, Aiden EL, Chan S, Hastie A, Komissarov A, Ryder OA, Graphodatsky A, Johnson WE, Maldonado JE, Pukazhenthi BS, Marinari PE, Wildt DE, Koepfli K-P. Chromosome-length genome assembly and karyotype of the endangered black-footed ferret (Mustela nigripes). (doi: 10.1093/jhered/esad035) J Heredity 114(5): 539-548, 2023

  14. Proskuryakova AA, Ivanova ES, Makunin AI, Larkin DM, Ferguson-Smith MA, Yang F, Uphyrkina OV, Perelman PL, Graphodatsky AS. Comparative studies of X chromosomes in Cervidae family. (doi.org/10.1038/s41598-023-39088-4) Sci Rep 13: 11992, 2023

  15. Kusliy MA, Yurlova AA, Neumestova AI, Vorobieva NV, Gutorova NV, Molodtseva AS, Trifonov VA, Popova KO, Polosmak NV, Molodin VI, Vasiliev SK, Semibratov VP, Iderkhangai T-O, Kovalev AA, Erdenebaatar D, Graphodatsky AS, Tishkin AA. Genetic history of the Altai breed horses: from ancient times to modernity. (doi: 10.3390/genes14081523) Genes 14(8): 1523, 2023

  16. Biltueva LS, Vorobieva NV, Lemskya NA, Perelman PL, Trifonov VA, Panov VV, Abramov AV, Kawada S-i, Serdukova NA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of the Talpinae. (doi: 10.3390/genes14071472) Genes 14(7): 1472, 2023

  17. Томаровский АА, Тотиков АА, Якупова АР, Графодатский АС, Кливер СФ. Обзор способов визуализации гетерозиготности в контексте природоохранных исследований. (doi: 10.17816/ecogen609552) Экологическая генетика 21(4): 383-400, 2023

  18. Тотиков АА, Томаровский АА, Якупова АР, Графодатский АС, Кливер СФ. Обзор методов реконструкции демографической истории популяций в природоохранной биологии. (doi: 10.17816/ecogen120078) Экологическая генетика 21(1): 85-102, 2023

  19. Houck ML, ... Perelman PL, Beklemisheva V, Graphodatsky A, ... Dudchenko O. Chromosome-length genome assemblies and cytogenomic analyses of pangolins reveal remarkable chromosome counts and plasticity (doi: 10.1007/s10577-023-09722-y) Chromosome Res 31(2): 13, 2023

  20. Yakupova A, Tomarovsky A, Totikov A, Beklemisheva V, Logacheva M, Perelman PL, Komissarov A, Dobrynin P, Krasheninnikova K, Tamazian G, Serdyukova NA, Rayko M, Bulyonkova T, Cherkasov N, Pylev V, Peterfeld V, Penin A, Balanovska E, Lapidus A, Consortium DZ, O'Brien SJ, Graphodatsky A, Koepfli K-P, Kliver S. Chromosome-length assembly of the Baikal seal (Pusa sibirica) genome reveals a historically large population prior to isolation in lake Baikal. (doi: 10.3390/genes14030619) Genes 14(3): 619, 2023

  21. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DY, Perelman PL, Romanenko SA, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Utkin YA, Nie W, Ferguson-Smith MA, Fentang Y, Graphodatsky AS. Maps of constitutive-heterochromatin distribution for four martes species (Mustelidae, Carnivora, Mammalia) show the formative role of macrosatellite repeats in interspecific variation of chromosome structure. (doi: 10.3390/genes14020489) Genes 14(2): 489, 2023

  22. Lisachov A, Rumyantsev A, Prokopov D, Ferguson-Smith M, Trifonov V. Conservation of major satellite DNAs in snake heterochromatin. (doi: 10.3390/ani13030334) Animals 13(3): 334, 2023

  23. Mesentsev Y, Bondarenko N, Kamyshatskaya O, Nassonova E, Glotova A, Loiko S, Istigechev G, Kulemzina A, Abakumov E, Rayko M, Lapidus A, Smirnov A. Thecochaos is not a myth: study of the genus Thecochaos (Amoebozoa, Discosea) – a rediscovered group of lobose amoeba, with short SSU gene. (doi: 10.1007/s13127-022-00581-9) Org Divers Evol 23: 7-24, 2023

  24. Proskuryakova AA, Ivanova ES, Perelman PL, Ferguson-Smith MA, Yang F, Okhlopkov IM, Graphodatsky AS. Comparative studies of karyotypes in the Cervidae family. (doi: 10.1159/000527349) Cytogenet Genome Res 162(6): 312-322, 2022

  25. Dumas F, Perelman PL, Biltueva L, Roelke M. Retrotransposon mapping in spider monkey genomes of the family Atelidae (Platyrrhini, Primates) shows a high level of LINE-1 amplification. (doi: 10.4081/jbr.2022.10725) J Biol Res 95(2): 10725, 2022

  26. Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA. New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri. (doi: 10.1134/S003294522206011X) J Ichthyol 62(7): 1230-1236, 2022

  27. Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA. Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania). (doi: 10.3390/ijms232415838) Int J Mol Sci 23(24): 15838, 2022

  28. Уфыркина ОВ, Беклемишева ВР, Гончарук МС, Керли Л, Графодатский АС, Перельман ПЛ. О необходимости внесения дальневосточного лесного кота Prionailurus bengalensis euptilura в Красные книги Приморского Края и Российской Федерации. (doi: 10.25221/2782-1978_2022_3_3) Биота и среда природных территорий 10(3): 21-35, 2022

  29. Тиунов МП, Проскурякова АА, Батурина АК, Перельман ПЛ, Графодатский АС. Новый вид летучей мыши Eptesicus pachyomus (Chiroptera, Vespertilionidae) в фауне России. (doi: 10.31857/S004451342212011X) Зоологический журнал 101(12): 1424-1428, 2022

  30. Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs. (doi: 10.3390/ijms232113063) Int J Mol Sci 23(21): 13063, 2022

  31. Romanenko S, Trifonov V. Chapter 3. Generation of microdissection-derived painting probes from single copy chromosomes. In: Liehr T (ed.) Cytogenetics and Molecular Cytogenetics, CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 2022, pp 27-34 (doi: 10.1201/9781003223658)

  32. Milioto V, Perelman PL, Paglia LL, Biltueva L, Roelke M, Dumas F. Mapping retrotransposon LINE-1 sequences into two Cebidae species and Homo sapiens genomes and a short review on primates. (doi: 10.3390/genes13101742) Genes 13(10): 1742, 2022

  33. de Ferran V, ..., Kliver S, Serdyukova N, ..., Eizirik E. Phylogenomics of the world’s otters. (doi: 10.1016/j.cub.2022.06.036) Curr Biol 32(16): 3650-3658.e4, 2022

  34. Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА. Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири. (doi: 10.35885/1996-1499-15-2-38-42) Российский журнал биологических инвазий 15(2): 38-42, 2022

  35. Molodtseva AS, Makunin AI, Salomashkina VV, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov GG, Mamaev N, Okhlopkov IM, Kryukov AP, Lyapunova EA, Kholodova MV, Seryodkin IV, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Phylogeography of ancient and modern brown bears from eastern Eurasia. (doi: 10.1093/biolinnean/blac009) Biol J Linn Soc 135(4): 722-733, 2022

  36. Suchan T, Kusliy MA, Khan N, Chauvey L, Tonasso-Calvière L, Schiavinato S, Southon J, Keller M, Kitagawa K, Krause J, Bessudnov AN, Bessudnov AA, Graphodatsky AS, Lamas SV, Wilczyński J, Pospuła S, Tunia K, Nowak M, Moskal-delHoyo M, Tishkin AA, Pryor AJ, Outram AK, Orlando L. Performance and automation of ancient DNA capture with RNA hyRAD probes. (doi: 10.1111/1755-0998.13518) Mol Ecol Resour 22(3): 891-907, 2022

  37. Rajičić M, Makunin A, Adnađević T, Trifonov V, Vujošević M, Blagojević J. B chromosomes’ sequences in yellow-necked mice Apodemus flavicollis — exploring the transcription. (doi: 10.3390/life12010050) Life 12(1): 50, 2022

​Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0015 (122011800125-7) Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Гранты РНФ

23-74-10060 Популяционная история мамонтовой фауны Юга Сибири. Молодцева АС

23-74-01016 Хромосомная организация геномов птиц фауны России и сопредельных стран. Проскурякова АА 

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Kusliy MA, Vorobieva NV, Fedorova YuE, Shpansky AV, Malikov DG, Kosintsev PA, Gimranov DO, Graphodatsky AS, Molodtseva AS. High mitogenome diversity of cave lions (Panthera spelaea Goldfuss, 1810) in Siberia. Boof of Abstracts, VII Congress of the Serbian Genetic Society, ISBN 978-86-87109-18-6, p. 55

  2. Samarina SA, Kusliy MA, Malikov DG, Klementiev AM, Lurje PB, Serdyukova NA, Beklemisheva VR, Molodtseva AS. Phylogenetic reconstructions for ancient and recent representatives of canids (Canidae) of Siberia and Tajikistan territory based on mtDNA sequences. Boof of Abstracts, VII Congress of the Serbian Genetic Society, ISBN 978-86-87109-18-6, p. 57

  3. Modina S, Kusliy M, Malikov D, Pavlova N, Pavlov I, Protopopov A, Molodtseva A. Phylogeography of Late Pleistocene woolly mammoths (Mammuthus primigenius) from geographically isolated areas of southern and eastern Siberia. Boof of Abstracts, VII Congress of the Serbian Genetic Society, ISBN 978-86-87109-18-6, p. 58

  4. Yakovlev AV, Molodtseva AS, Malikov DG, Shnaider SV, Kusliy MA. Phylogenetic analysis of the Late Pleistocene-Holocene representatives of several species (Bovidae family) from Central Asia. Boof of Abstracts, VII Congress of the Serbian Genetic Society, ISBN 978-86-87109-18-6, p. 60

  5. Rajičić M, Proskurjakova AA, Bajić B, Budinski I, Miljević M, Rončević A, Romanenko SA, Blagojević J. Origin of the B chromosomes in two mammalian species Nyctalus leisleri and Apodemus flavicollis. Boof of Abstracts, VII Congress of the Serbian Genetic Society, ISBN 978-86-87109-18-6, p. 61

  6. Романенко С, Беклемишева В, Перельман П, Андреюшкова Д, Марченко С, Лемская Н, Билтуева Л, Кливер С, Трифонов В, Графодатский А.  Актуальность интеграции данных цитогенетики и сборок геномов хромосомного уровня на примере различных групп позвоночных. (doi: 10.18699/bgrs2024-1.1-07) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 23-28

  7. Тотиков A, Томаровский А, Перельман П, Бульонкова Т, Панов В, Консорциум DNA Zoo, Графодатский А, Кливер С. Сборка генома обыкновенной ласки (Mustela nivalis) на уровне C-скаффолдов хромосомной длины. (doi: 10.18699/bgrs2024-1.3-06) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 180-185

  8. Модина С, Куслий М, Маликов Д, Павлова Н, Павлов И, Протопопов А, Молодцева А. Филогеография шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius) на географически изолированных территориях Восточной Сибири в позднем плейстоцене. (doi: 10.18699/bgrs2024-5.1-08) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 884-887

  9. Томаровский A, Тотиков А, Беклемишева В, Перельман П, Сердюкова Н, Бульонкова Т, Сидоров М, Мамаев Н, Охлопков И, Мухачева А, Коняева К, Абрамов А, Графодатский А, Кливер С. Полногеномные данные подтверждают присутствие кроссинговера у гибридов соболя (M. zibellina) и лесной куницы (M. martes). (doi: 10.18699/bgrs2024-5.1-10) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 891-896

  10. Шаяхметова Л, Батурина А, Маслов А, Графодатский А, Проскурякова А. Генетическая гетерогенность восточной ночницы (Myotis petax, Hollister 1912). (doi: 10.18699/bgrs2024-5.1-12) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 902-904

  11. Иванова Е, Беклемишева В, Галкина С, О’Коннор Б, Гриффин Д, Графодатский А, Проскурякова А. Описание кариотипа и сравнительный анализ генома глухаря обыкновенного (Tetrao urogallus). (doi: 10.18699/bgrs2024-7.1-05) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1205-1208

  12. Иванова Е, Янг Ф, Фергюсон-Смит М, Ларкин Д, Графодатский А, Проскурякова А. Кариотип хохлатого оленя (Elaphodus cephalophus): описание и сравнительная геномика. (doi: 10.18699/bgrs2024-7.1-06) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1209-1212

  13. Проскурякова А, Беклемишева В, Тишакова К, Романенко С, Андреюшкова Д, Юдкин В, Интересова Е, Янг Ф, Фергюсон-Смит М, Графодатский А. Сравнительная геномика трех видов уток (шилохвость, кряква и обыкновенный гоголь) и эволюция кариотипов у представителей семейства Anatidae (Anseriformes, Aves). (doi: 10.18699/bgrs2024-7.1-11) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1232-1235

  14. Евдокимов А, Кутузов М, Петрусева И, Попов А, Романенко С, Перельман П, Прокопов Д, Селуанов А, Горбунова В, Графодатский А, Трифонов В, Ходырева С, Рябчикова Е, Коваль О, Лаврик И, Лаврик О. Голый землекоп демонстрирует повышенную эффективность репарации ДНК и устойчивость к генотоксическим воздействиям. (doi: 10.18699/bgrs2024-13-09) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 2243-2245

  15. Romanenko S, Lemskaya N, Kusliy M, Serdyukova N, Modina C, Tishakova K, Proskuryakova A, Trifonov V, Pavlov I, Pavlova N, Plotnikov V, Protopopov A, Perelman P, Graphodatsky A. Mammoth nuclei isolation for Hi-C and molecular cytogenetics. The Plant and Animal Genome Conference, 20-22 September 2023, The Westin Perth, Australia. Abstract #51346

  16. Ivanova ES, Proskuryakova AA, Larkin DM, Ferguson-Smith MA, Yang F, Uphyrkina OV, Perelman PL, Graphodatsky AS. The X-chromosome evolution in Cervidae (Artiodactyla, Mammalia). Материалы международной конференции "Хромосома 2023". c. 21-22. Новосибирск, 2023

  17. Pavlova SV, Romanenko SA, Matveevsky SN, Kuksin AN, Dvoyashov IA, Kovalskaya YuM, Petrova TV. Karyotype diversity and B chromosome polymorphism within cryptic species of the subgenus Stenocranius (Cricetidae, Rodentia). Материалы международной конференции "Хромосома 2023". c. 36-37. Новосибирск, 2023

  18. Беклемишева ВР, Лемская НА, Прокопов ДЮ, Перельман ПЛ, Романенко СА, Проскурякова АА, Сердюкова НА, Уткин ЯА, Графодатский АС. Изучение конститутивного гетерохроматина и сравнительные хромосомные карты куниц рода Martes (Mustelidae, Carnivora, Mammalia): использование биоинформатического анализа и методов молекулярной цитогенетики. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с.68-69. Новосибирск, 2023

  19. Куслий МА, Графодатский АС, Тишкин АА. Генетическое разнообразие лошадей саргаринско-алексеевской культуры Обь-Иртышья Западной Сибири. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 132. Новосибирск, 2023

  20. Лемская НА, Беклемишева ВР, Романенко СА, Билтуева ЛС, Проскурякова АА, Павлова СВ, Перельман ПЛ, Графодатский АС. Дифференциальное окрашивание гетерохроматина методом CDAG. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 134. Новосибирск, 2023

  21. Лисачева ЛС, Лисачев АП, Романенко СА, Андреюшкова ДА, Давлетшина ГИ, Назаров РА, Трифонов ВА. Эволюция сателлитной ДНК у ящурок (Eremias, Lacertidae). Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 137. Новосибирск, 2023

  22. Модина СА, Куслий МА, Молодцева АС, Маликов ДГ. Филогеография шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius) Восточной Сибири в позднем плейстоцене. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с.145. Новосибирск, 2023

  23. Молодцева АС, Модина СА, Яковлев АВ, Алишер кызы С, Абдыканова А, Чаргынов Т, Шнайдер СА. Видовое определение млекопитающих сопровождающих человека на стоянках в горных районах Центральной Азии. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 146-147. Новосибирск, 2023

  24. Проскурякова АА. Хромосомная эволюция в подотряде жвачные (Artiodactyla, Ruminantia). Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 165. Новосибирск, 2023

  25. Романенко СА, Лемская НА, Филонова ВА, Графодатский АС. Конститутивный гетерохроматин у грызунов (Rodentia, Mammalia). Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 169. Новосибирск, 2023

  26. Томаровский АА, Тотиков АА, Перельман ПЛ, Беклемишева ВР, Сердюкова НА, Бульонкова ТМ, Сидоров М, Мамаев Н, Охлопков И, Мухачева А, Коняева К, Абрамов АВ, Графодатский АС, Кливер СФ. Оценка уровня гетерозиготности соболя (Martes zibellina), лесной куницы (Martes martes) и их гибридов. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 198-199. Новосибирск, 2023

  27. Тотиков АА, Томаровский АА, Перельман ПЛ, Беклемишева ВР, Сердюкова НА, Бульонкова ТМ, Панов ВВ, Мухачева АС, Абрамов АВ, Графодатский АС, Кливер СФ. Оценка уровня гетерозиготности представителей рода Mustela. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с. 200-201. Новосибирск, 2023

  28. Трифонов ВА, Фофанов МВ. Паттерны редиплоидизации после полногеномных дупликаций у животных. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 85

  29. Fofanov MV, Prokopov DYu, Trifonov VA, Beklemisheva VR, Khan R, Aiden E, Graphodatsky AS, Perelman PL. Comparative bioinformatic analysis of Hi-C chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 113-114

  30. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DYu, Romanenko SA, Serdyukova NA, Utkin YaA, Graphodatsky AS. Detailed analysis of distribution of repetitive sequences across genomes of Martes (Mustelidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 137-138

  31. Proskuryakova AA. Chromosome evolution in Ruminantia. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 165

  32. Romanenko SA, Proskuryakova AA, Prokopov DYu, Davletshina GI, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 167-168

  33. Tishakova K, Prokopov D, Davletshina G, O’Brien P, Ferguson-Smith M, Giovannotti M, Trifonov V. Composition of sex chromosomes of veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Squamata) reveals new insights into sex chromosome evolution of iguanian lizards. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 179

  34. Minina JM, Karamysheva TV, Serdyukova NA, Serov OL. Quantitative estimation of trisomy on chromosome 6 in embryonic fibroblasts of mice carrying duplications obtained using CRISPR/Cas9 technology. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 672-673

  35. Buggiotti L, Romashov G, Yurchenko A, Yudin NS, Zinovieva NA, Graphodatsky A, Larkin D. Does an extreme climate make domestic and wild animals evolve similarly? #43462, Abstract book. XXIX Conference "Plant and Animal Genome", January 8-12, 2022, San Diego, CA, USA

​Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Kusliy MA. High mitogenome diversity of cave lions (Panthera spelaea Goldfuss, 1810) in Siberia. VII Congress of the Serbian Genetic Society, 2-5 October 2024, Zlatibor, Serbia

  2. Samarina S. Phylogenetic reconstructions for ancient and recent representatives of canids (Canidae) of Siberia and Tajikistan territory based on mtDNA sequences. VII Congress of the Serbian Genetic Society, 2-5 October 2024, Zlatibor, Serbia

  3. Романенко С. Актуальность интеграции данных цитогенетики и сборок геномов хромосомного уровня на примере различных групп позвоночных. 14-я Международная Мультиконференция “Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология” BGRS/SB-2024, Симпозиум "Геномика, транскриптомика и биоинформатика", 5-10 августа 2024, Новосибирск
    видео

  4. Kusliy MA. Preliminary results of determining the mitochondrial genetic diversity of Ovodov horses in Southern Siberia. 14-я Международная Мультиконференция “Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология” BGRS/SB-2024, Симпозиум "Эволюционная, популяционная геномика/генетика и молекулярная филогения: компьютерные и экспериментальные подходы", 5-10 августа 2024, Новосибирск
    видео

  5. Иванова Е. Описание кариотипа и сравнительный анализ генома глухаря обыкновенного (Tetrao urogallus). Международная Мультиконференция “Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология” BGRS/SB-2024, Симпозиум "Генетика/геномика, биоинформатика и системная биология животных", 5-10 августа 2024, Новосибирск

  6. Grafodatsky A. Mammoth nuclei isolation for Hi-C and molecular cytogenetics. International Plant and Animal Genome Conference, 20-22 September 2023, The Westin Perth, Australia

  7. Graphodatsky AS. AA Prokofyeva-Belgovskaya – 120 years on the background of a chromosome. Международная конференция Хромосома 2023, 5-10 сентября 2023, Новосибирск

  8. Proskuryakova AA. Chromosome evolution in Ruminantia. Международная конференция Хромосома 2023, 5-10 сентября 2023, Новосибирск

  9. Romanenko SA. Constitutive heterochromatin in rodents (Rodentia, Mammalia). Международная конференция Хромосома 2023, 5-10 сентября 2023, Новосибирск

  10. Куслий МА. Генетические исследования древних и современных лошадей Алтая и сопредельных территорий. III Международная научная конференция "Современные решения актуальных проблем евразийской археологии", 4-8 сентября 2023, Барнаул

  11. Фофанов М. Comparative bioinformatic analysis of HiC chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск 

  12. Проскурякова А. Chromosome evolution in Ruminantia. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  13. Романенко С. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  14. Фофанов М. Application of hi-c genome scaffolding to improve cytogenetic chromosome maps and detect genomic rearrangements. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  15. Давлетшина Г. Секвенирование полных митохондриальных геномов белуг из археологических раскопок Поволжья. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  16. Романенко С. Хромосомные перестройки в эволюции генома нильского крокодила (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia). III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  17. Тишакова Е. Идентификация предковых синтенных блоков и половых  хромосом у йеменского хамелеона (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Reptilia). III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022, Новосибирск

  18. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторённой ДНК в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  19. Кичигин ИГ. Изучение генетического состава половых и добавочных хромосом чешуйчатых (Squamata, Reptilia) с помощью секвенирования изолированных хромосом. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  20. Grafodatsky AS. From 2n to VGP. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  21. Druzhkova AS. The phylogeographical history of the brown bear (Ursus arctos Linnaeus) in Northeast Eurasia. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск 

  22. Proskuryakova AA. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  23. Makunin AI. Summary of mammalian B chromosome sequencing. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  24. Romanenko SA. Intrachromosomal rearrangements within evolutionarily conserved syntenic blocks. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  25. Beklemisheva V. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  26. Proskuryakova A. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  27. Прокопов ДЮ. Происхождение и эволюция половых и добавочных хромосом копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus). XXV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов", 9-13 апреля 2018, Москва

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics, University of Cambridge, UK
    Эволюция кариотипов и половых хромосом рептилий

  • National Cancer Institute at Frederick, MD, USA
    Сравнительная геномика млекопитающих

  • Cornell University, Ithaca, NY, USA
    Сравнительная геномика

  • University of North Carolina at Chapel Hill, NC, USA
    Сравнительная геномика

  • Institut für Humangenetik, Jena, Germany
    Сравнительная геномика

  • Muséum national d'histoire naturelle, Paris, France
    Сравнительная геномика

  • Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Toulouse, France
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Firenze, Florence, Italy
    Сравнительная геномика

  • Kunming Institute of Zoology, China
    Сравнительная геномика

  • Universidade de São Paulo, Câmpus de Rio Claro, Brasil
    Цитогенетика неотропических рыб

  • University of Illinois at Urbana, Champaign, IL, USA
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Palermo, Italy
    Сравнительная геномика

Награды: 

Премия СО АН СССР

Графодатский АС (1986)

Премия РАН им. АА Баева

Графодатский АС (1995)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Перельман ПЛ (2003)
Проскурякова АА (2020)
Куслий МА (2024)

Звание “Лучший аспирант РАН”

Романенко СА (2007)

Гранты Президента РФ для молодых кандидатов наук

Романенко СА (2010)

Национальная премия Л'Ореаль-ЮНЕСКО при поддержке РАН “Для женщин в науке”

Романенко СА (2012)

Юбилейная медаль “300 лет Российской академии наук”

Графодатский АС (2024)

Юбилейная медаль “80 лет Новосибирской области”

Графодатский АС (2017)

Именная стипендия Правительства Новосибирской области

Прокопов ДЮ (2021)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Романенко СА (2018)
Лемская НА (2018)
Проскурякова АА (2019)

Памятный знак "За труд на благо города"

Беклемишева ВР, Графодатский АС, Сердюкова НА (2013)

Почетная грамота СО РАН

Графодатский АС (2021)

Отдел регуляции генетических процессов

Служебные ссылки