Отдел разнообразия и эволюции геномов

Лаборатория цитогенетики животных

Графодатский Александр Сергеевич
Заведующий отделом
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-63

Curriculum vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Графодатский Александр Сергеевич зав. лаб. дбн grafatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Перельман Полина Львовна внс кбн perelmanpatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Романенко Светлана Анатольевна снс дбн rosaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Беклемишева Виолетта Робертовна снс кбн beklatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кулемзина Анастасия Игоревна нс кбн zakalatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лемская Наталья Анатольевна нс кбн lemnatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Сердюкова Наталья Алькуатовна нc   serdatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Макунин Алексей Игоревич мнс кбн alexatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Проскурякова Анастасия Андреевна мнс кбн andrenaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Молодцева (Дружкова)
Анна Сергеевна
мнс   radaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg   Прокопов Дмитрий Юрьевич мнс   dprokopovatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg   Куслий Мария Александровна мнс   kusliy [dot] mariaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Фофанов Михаил Викторович мнс    
        Бутакова Юлия Викторовна инженер 1 кат.   butakovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Иванова Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Жибурт Анастасия Константиновна ст. лаб.    
        Маликов Дмитрий Геннадьевич нс совм.    
        Тишакова Катерина Валерьевна мнс совм.    
        Давлетшина Гузель Ильдаровна мнс совм.    
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кичигин Илья Геннадьевич ст. лаб.-иссл. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гладких Ольга Леонидовна

Направления исследований: 
  • Организация и эволюция хромосом и геномов позвоночных
  • Палеогеномика
G10K.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов Genome10K

vgp.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей большого международного консорциума по секвенированию и анализу геномов позвоночных

bat1k.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов летучих мышей

APP_logo.jpg

Сотрудники лаборатории входят в число исполнителей международного консорциума по секвенированию и анализу геномов птиц

IMCB_DNA_Zoo.JPG

Сотрудники лаборатории составляют филиал международного консорциума DNA Zoo – DNA Zoo Novosibirsk. Задача консорциума - это сборка и исследование трехмерной организации геномов млекопитающих, птиц, рептилий и беспозвоночных

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ И ПУБЛИЧНЫЕ ЛЕКЦИИ:

Сборка генома масайского жирафа
Эволюционное древо комодского варана
Как хищники стали травоядными
Хромосомная живопись: как увидеть эволюцию в геноме
Митохондриальная ДНК древнего медведя
Митохондриальная ДНК древней овцы
Секвенирование ДНК вымершей лошади
Цитогенетика ластоногих (нерпы, моржи, тюлени)
Геномика собаки
Расшифровка генома африканского гепарда
Гетерохроматин – хорошо забытая часть генома
Птицы сэкономили на геноме
Где и когда появились первые собаки?
Биология: от Линнея до "Атласа хромосом"
Секвенирование ДНК древней собаки
Геном древнейшей в Азии собаки
Генетики нашли в Америке "родственников" древнейшей алтайской собаки

Wikipedia_logo.png Genome diversity and karyotype evolution of mammals
video_icon.jpg дбн АС Графодатский рассуждает о науке и религии
MIR.jpg Интервью АС Дружковой о древней ДНК
you_tube.jpg Очень древняя ДНК. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Геномика псовых. Публичная лекция АС Дружковой
you_tube.jpg Хромосомы, геномы и эволюция млекопитающих. Публичная лекция дбн АС Графодатского
you_tube.jpg Зачем нужен зоопарк в бочонке. дбн АС Графодатский в проекте Эврика!

Публикации: 

  1. Tamazian G, Dobrynin P, Zhuk A, Zhernakova DV, Perelman PL, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Komissarov A, Kliver S, Cherkasov N, Scott AF, Mohr DW, Koepfli K-P, O’Brien SJ, Krasheninnikova K. Draft de novo genome assembly of the elusive jaguarundi, Puma yagouaroundi. J Heredity, 2021, doi: 10.1093/jhered/esab036
  2. Ceraulo S, Perelman PL, Mazzoleni S, Rovatsos M, Dumas F. Repetitive sequence distribution on Saguinus, Leontocebus and Leontopithecus tamarins (Platyrrhine, Primates) by mapping telomeric (TTAGGG) motifs and rDNA loci. (doi: 10.3390/biology10090844) Biology 10(9): 844, 2021

  3. Totikov A, Tomarovsky A, Prokopov D, Yakupova A, Bulyonkova T, Derezanin L, Rasskazov D, Wolfsberger WW, Koepfli K-P, Oleksyk TK, Kliver S. Chromosome-level genome assemblies expand capabilities of genomics for conservation biology. (doi: 10.3390/genes12091336Genes 12(9): 1336, 2021

  4. Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 193-209 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  5. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 211-224 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  6. Buggiotti L, Yurchenko AA, Yudin NS, Vander Jagt CJ, Vorobieva NV, Kusliy MA, Vasiliev SK, Rodionov AN, Boronetskaya OI, Zinovieva NA, Graphodatsky AS, Daetwyler HD, Larkin DM. Demographic history, adaptation, and NRAP convergent evolution at amino acid residue 100 in the world northernmost cattle from Siberia. (doi: 10.1093/molbev/msab078) Mol Biol Evol 38(8): 3093-3110, 2021

  7. Lisachov AP, Tishakova KV, Romanenko SA, Molodtseva AS, Prokopov DYu, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Whole-chromosome fusions in the karyotype evolution of Sceloporus (Iguania, Reptilia) are more frequent in sex chromosomes than autosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0099) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1833): 20200099, 2021

  8. Kuhl H, ... Prokopov D, ... Stöck M. A 180 Myr-old female-specific genome region in sturgeon reveals the oldest known vertebrate sex determining system with undifferentiated sex chromosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0089) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1832): 20200089, 2021

  9. Karamysheva T, Romanenko S, Makunin A, Rajičić M, Bogdanov A, Trifonov V, Blagojević J, Vujošević M, Orishchenko K, Rubtsov N. New data on organization and spatial localization of B-chromosomes in cell nuclei of the yellow-necked mouse Apodemus flavicollis. (doi: 10.3390/cells10071819) Cells 10(7): 1819, 2021

  10. Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian M, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. (doi: 10.3390/genes12070964) Genes 12(7): 964, 2021

  11. Höhne C, Prokopov D, Kuhl H, Du K, Klopp C, Wuertz S, Trifonov V, Stöck M. The immune system of sturgeons and paddlefish (Acipenseriformes): a review with new data from a chromosome‐scale sturgeon genome. (doi: org/10.1111/raq.12542) Rev Aquacult 13(3): 1709-1729, 2021

  12. Lisachov A, Andreyushkova D, Davletshina G, Prokopov D, Romanenko S, Galkina S, Saifitdinova A, Simonov E, Borodin P, Trifonov V. Amplified fragments of an autosome-borne gene constitute a significant component of the W sex chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). (doi: 10.3390/genes12050779) Genes 12(5): 779, 2021

  13. Romanenko SA, Lebedev VS, Bannikova AA, Pavlova SV, Serdyukova NA, Feoktistova NYu, Jiapeng Q, Yuehua S, Surov AV, Graphodatsky AS. Karyotypic and molecular evidence supports the endemic Tibetan hamsters as a separate divergent lineage of Cricetinae. (doi: 10.1038/s41598-021-89890-1) Sci Rep 11: 10557, 2021

  14. Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Molodtseva AS, Perelman PL, Interesova EA, Beklemisheva VR, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolution of tandemly arranged repetitive DNAs in three species of Cyprinoidei with different ploidy levels. (doi: 10.1159/000513274Cytogenet Genome Res 161: 32-42, 2021

  15. Mordvinov VA, Minkova GA, Kovner AV, Ponomarev DV, Lvova MN, Zaparina O, Romanenko SA, Shilov AG, Pakharukova MY. A tumorigenic cell line derived from a hamster cholangiocarcinoma associated with Opisthorchis felineus liver fluke infection. (doi: 10.1016/j.lfs.2021.119494) Life Sci 277: 119494, 2021

  16. Lemskaya NA, Romanenko SA, Maksimova YV, Shorina AR, Yudkin DV. Identification of satellited markers by microdissection and fluorescence in situ hybridization: a clinical case of isodicentric chromosome 22. (doi: 10.1186/s43042-021-00146-z) Egypt J Med Hum Genet 22: 24, 2021

  17. Трифонов ВА Шаймуратова ДН, Асылгараева ГШ, Монахов СП, Молодцева АС, Аськеев АО, Аськеев ИВ, Аськеев ОВ. Археогеномика доместикации животных Евразии. (doi: 10.24852/pa2021.1.35.179.186) Поволжская Археология 1(35): 179-186, 2021

  18. Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron Age Mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. (doi: 10.3390/genes12030412) Genes 12(3): 412, 2021

  19. Побединцева МА, Решетникова СН, Сердюкова НА, Бишани А, Трифонов ВА, Интересова ЕА. Генетическая гетерогенность серебряного карася Carassius gibelio (Cyprinidae) в бассйне средней Оби. (doi: 10.31857/S0016675821040111) Генетика 57(4): 429-436, 2021

  20. Evdokimov A., Popov A., Ryabchikova E., Koval O., Romanenko S., Trifonov V., Petruseva I., Lavrik I., Lavrik O. Uncovering molecular mechanisms of regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.18632/aging.202577) Aging (Albany NY) 13(3): 3239-3253, 2021

  21. Iannucci A, Makunin AI, Lisachov AP, Ciofi C, Stanyon R, Svartman M, Trifonov VA. Bridging the gap between vertebrate cytogenetics and genomics with single-chromosome sequencing (ChromSeq). (doi: 10.3390/genes12010124) Genes 12(1): 124, 2021

  22. Dolskiy AA, Yarushkin AA, Grishchenko IV, Lemskaya NA, Pindyurin AV, Boldyreva LV, Pustylnyak VO, Yudkin DV. miRNA expression and interaction with the 3′UTR of FMR1 in FRAXopathy pathogenesis. (doi: 10.1016/j.ncrna.2020.11.006) Non-coding RNA Res 6(1): 1-7, 2021

  23. Mamani C, Gutiérrez Reynoso GA, Perelman P, Johnson WE, de León Bravo FAP. Use of the high-density bovine microarray for the generation of an alpaca (Vicugna pacos) single nucleotide polymorphism physical map. (doi: 10.15381/RIVEP.V31I3.18725) Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru 31(3): e18725, 2020

  24. Fofanov MV, Prokopov DY, Kuhl H, Schartl M, Trifonov VA. Evolution of microRNA biogenesis genes in the sterlet (Acipenser ruthenus) and other polyploid vertebrates. (doi: 10.3390/ijms21249562) Int J Mol Sci 21(24): 9562, 2020

  25. Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Burkanov VN, Gorshunov MB, Ryder O, Thompson M, Lento G, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Karyotype evolution in 10 pinniped species: variability of heterochromatin versus high conservatism of euchromatin as revealed by comparative molecular cytogenetics. (doi: 10.3390/genes11121485) Genes 11(12): 1485, 2020

  26. Biltueva LS, Prokopov DY, Romanenko SA, Interesova EA, Schartl M, Trifonov VA. Chromosome distribution of highly conserved tandemly arranged repetitive DNAs in the Siberian sturgeon (Acipenser baerii). (doi: 10.3390/genes11111375) Genes 11(11): 1375, 2020

  27. Vorobieva NV, Makunin AI, Druzhkova AS, Kusliy MA, Trifonov VA, Popova KO, Polosmak NV, Molodin VI, Vasiliev SK, Shunkov MV, Graphodatsky AS. High genetic diversity of ancient horses from the Ukok Plateau. (doi: 10.1371/journal.pone.0241997) PLoS ONE 15(11): e0241997, 2020

  28. Gridina MM, Orlova PA, Minina JM, Shitik EM, Lemskaya NA, Grishchenko IV, Dolskiy AA, Shorina AR, Maksimova YV, Yudkin DV, Serov OL. Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi026-A) from peripheral blood mononuclear cells of a patient with fragile X syndrome. (doi: 10.1016/j.scr.2020.102070) Stem Cell Res 49: 102070, 2020

  29. Графодатский АС. Разнообразие и эволюция геномов. (doi: 10.22204/2410-4639-2020-106-02-38-49) Вестник РФФИ 2(106): 38-49, 2020

  30. Romanenko SA, Fedorova YuE, Serdyukova NA, Zaccaroni M, Stanyon  R, Graphodatsky AS. Evolutionary rearrangements of X chromosomes in voles (Arvicolinae, Rodentia). (doi: 10.1038/s41598-020-70226-4) Sci Reports 10: 13235, 2020

  31. Kolesnikova TD, Kolodyazhnaya AV, Pokholkova GV, Schubert V, Dovgan VV, Romanenko SA, Prokopov DYu, Zhimulev IF. Effects of mutations in the Drosophila melanogaster Rif1 gene on the replication and underreplication of pericentromeric heterochromatin in salivary gland polytene chromosomes. (doi: 10.3390/cells9061501Cells 9(6): 1501, 2020 

  32. Du K, … Prokopov D, Makunin A, Kichigin I, … Trifonov V, … Schartl M. The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization. (doi: 10.1038/s41559-020-1166-x) Nat Ecol Evol 4: 841–852, 2020

  33. Grishchenko IV, Purvinsh YV, Yudkin DV. Mystery of expansion: DNA metabolism and unstable repeats. In: Zharkov D. (eds) Mechanisms of Genome Protection and Repair. Advances in Experimental Medicine and Biology, vol 1241, 2020, pp 101-124 (doi: 10.1007/978-3-030-41283-8_7)

  34. Yang C, Li F, Xiong Z, Koepfli K-P, Ryder O, Perelman P, Li Q, Zhang G. A draft genome assembly of spotted hyena, Crocuta crocuta. (doi: 10.1038/s41597-020-0468-9) Sci Data 7: 126, 2020

  35. Lisachov AP, Giovannotti M, Pereira JC, Andreyushkova DA, Romanenko SA, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Chromosome painting does not support a sex chromosome turnover in Lacerta agilis Linnaeus, 1758. (doi: 10.1159/000506321Cytogenet Genome Res 160: 134-140, 2020

  36. Билтуева ЛС, Перельман ПЛ, Проскурякова АА, Лемская НА, Сердюкова НА, Графодатский АС. Хромосомы индийского мунтжака (Muntiacus muntjak). Возвращение. (doi: 10.31857/S0041377120050016) Цитология 62(5): 316–321, 2020

  37. Atlas of mammalian chromosomes (2nd edition). eds. Graphodatsky AS, Perelman PL, O’Brien SJ. Wiley-Blackwell, USA, 2020, 1008 p

  38. Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism.(doi: 10.3390/genes11040374) Genes 11(4): 374, 2020

  39. Scardino R, Milioto V, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Perelman PL, Dumas F. Evolution of the human chromosome 13 synteny: evolutionary rearrangements, plasticity, human disease genes and cancer breakpoints. (doi: 10.3390/genes11040383) Genes 11(4): 383, 2020

  40. Графодатский АС, Трифонов ВА. Родиться баобабом. Наука из первых рук 85(5/6): 16-31, 2019

  41. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. (doi: 10.3390/genes10110857) Genes 10(11): 857, 2019

  42. Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YuV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes. Chapter 10 in Top 10 Contributions on Genetics. 2nd ed. Avid Science, India. 2019

  43. Romanenko SA, Lyapunova EA, Saidov AS, O’Brien PCM, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Bakloushinskaya I. Chromosome translocations as a driver of diversification in mole voles Ellobius (Rodentia, Mammalia). (doi: 10.3390/ijms20184466) Int J Mol Sci 20(18): 4466, 2019

  44. Картавцева ИВ, Васильева ТВ, Шереметьева ИН, Лемская НА, Моролдоев ИВ, Голенищев ФН. Генетическая изменчивость трех изолированных популяций Муйской полевки Alexandromys mujanensis Orlov et Kovalskaja, 1978 (Rodentia, Arvicolinae). (doi: 10.1134/S0016675819080071) Генетика 55(8): 920-935, 2019

  45. Lewin HA, Graves JAM, Ryder OA, Graphodatsky AS, O'Brien SJ. Precision nomenclature for the new genomics. (doi: 10.1093/gigascience/giz086) GigaScience 8(8): giz086, 2019

  46. Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe (Giraffa camelopardalis tippelskirchi). (doi: 10.1093/gigascience/giz090) GigaScience 8(8): giz090, 2019

  47. Lind AL,... Kichigin IG, Makunin AI,... Trifonov VA,... Bruneau BG. Genome of the Komodo dragon reveals adaptations in the cardiovascular and chemosensory systems of monitor lizards. (doi: 10.1038/s41559-019-0945-8) Nature Ecol Evol 3 (8): 1241-1252, 2019

  48. Lisachov AP, Makunin AI, Giovannotti M, Pereira JC, Druzhkova AS, Barucchi VC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. Genetic content of the neo-sex chromosomes in Ctenonotus and Norops (Squamata, Dactyloidae) and degeneration of the Y chromosome as revealed by high-throughput sequencing of individual chromosomes. (doi: 10.1159/000497091) Cytogenet Genome Res 157(1-2): 115-122, 2019

  49. Bakloushinskaya I, Lyapunova EA, Saidov AS, Romanenko SA, O'Brien PCM, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Matveevsky S, Bogdanov AS. Rapid chromosomal evolution in enigmatic mammal with XX in both sexes, the Alay mole vole Ellobius alaicus Vorontsov et al., 1969 (Mammalia, Rodentia). (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i2.34224) Comp Cytogenet 13(2): 147-177, 2019

  50. Richardson MF, Munyard K, Croft LJ, Allnutt TR, Jackling F, Alshanbari F, Jevit M, Wright GA, Cransberg R, Tibary A, Perelman P, Appleton B, Raudsepp T. Chromosome-level alpaca reference genome VicPac3.1 improves genomic insight into the biology of New World camelids. (doi: 10.3389/fgene.2019.00586) Front Genet 10: 586, 2019

  51. Elbers JP, Rogers MF, Perelman PL, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Johnson WE, Horin P, Corander J, Murphy D, Burger PA. Improving Illumina assemblies with Hi‐C and long reads: an example with the North African dromedary. (doi: 10.1111/1755-0998.13020Mol Ecol Resour 19(4): 1015-1026, 2019

  52. Kosova AA, Kutuzov MM, Evdokimov AN, Ilina ES, Belousova EA, Romanenko SA, Trifonov VA, Khodyreva SN, Lavrik OI. Poly(ADP-ribosyl)ation and DNA repair synthesis in the extracts of naked mole rat, mouse, and human cells. (doi: 10.18632/aging.101959) Aging 11(9): 2852-2873, 2019

  53. Lisachov AP, Galkina SA, Saifitdinova AF, Romanenko SA, Andreyushkova DA, Trifonov VA, Borodin PM. Identification of sex chromosomes in Eremias velox (Lacertidae, Reptilia) using lampbrush chromosome analysis. (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i2.34116Comp Cytogenet 13(2): 121-132, 2019

  54. Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman P, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks. (doi: 10.1101/gr.239863.118) Genome Res 29(4): 576-589, 2019

  55. Kichigin IG, Lisachov AP, Giovannotti M, Makunin AI, Kabilov MR, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MF, Graphodatsky AS, Trifonov VA. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. (doi: 10.1007/s00438-018-1483-9Mol Genet Genomics 294(1): 13-21, 2019 

  56. Pobedintseva MA, Makunin AI, Kichigin IG, Kulemzina AI, Serdyukova NA, Romanenko SA, Vorobieva NV, Interesova EA, Korentovich MA, Zaytsev VF, Mischenko AV, Zadelenov VA, Yurchenko AA, Sherbakov DYu, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Population genetic structure and phylogeography of sterlet (Acipenser ruthenus, Acipenseridae) in the Ob and Yenisei river basins. (doi: 10.1080/24701394.2018.1467409Mitochondrial DNA Part A 30(1): 156-164, 2019

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0246-2021-0015 Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Гранты РНФ

19-14-00034 (АААА-А19-119070590012-1) Аутосомы, половые и добавочные хромосомы позвоночных. Организация и эволюция.
Графодатский АС

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Куслий МА, Тишкин АА, Воробьева НВ, Семибратов ВП, Кирюшин КЮ, Ковалев АА, Эрдэнэбаатар Д, Графодатский АС. Палеогенетические определения мастей и пола у лошадей из древних памятников Алтая. С. 323-328. В кн.: Материалы XI Международной научной конференции "Древние культуры Монголии, Южной Сибири и Северного Китая" (doi: 10.31600/978-5-907298-19-4.323-328). Абакан, 2021

  2. Popov A, Evdokimov A, Ryabchikova E, Koval O, Romanenko S, Trifonov V, Petruseva I, Lavrik I, Lavrik O. Regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 466 (P-08.4-13), 2021

  3. Rayko M, Kulemzina A, Abakumov E, Istigechev G, Andronov E, Lashchinsky N, Lapidus A. Metagenomic analysis of the soil microbiota associated with plant gigantism of the unique Siberian Chernevaya Taiga. Selected abstracts of “Bioinformatics: from Algorithms to Applications 2020” conference. (doi: 10.1186/s12859-020-03838-2BMC Bioinformatics 21(Suppl 20): P4, 2020 

  4. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторенной ДНК в геномах осетрообразных. Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов 2020", М.: МАКС Пресс, 2020, ISBN 978-5-317-06417-4

  5. Tishakova K, Prokopov D, Kichigin I, Molodtseva A, Kratochvil L, Lisachov A, Trifonov V. Analysis of sequenced chromosome-specific libraries of gekkonids sheds light to large scale genome reshuffling in reptiles. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-164) Novosibirsk, 2020, p. 260

  6. Popov A, Evdokimov A, Petruseva I, Romanenko S, Trifonov V, Koval O, Lavrik I, Ryabchikova E, Lavrik O. Regulated cell death in Hetherocephalus glaber. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-365) Novosibirsk, 2020, p. 597

  7. Davletshina G, Kliver S, Prokopov D, Interesova E, Trifonov V. Application of ITS1 and ITS2 for population genetic studies of sturgeons (Acipenseridae). The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-133) Novosibirsk, 2020, p. 209

  8. Куслий МА, ..., Графодатский АС, Орландо Л. Предварительный анализ древней ДНК 170 остеологических образцов от лошадей, обитавших в Азии. C. 182-187. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  9. Куслий МА, Тишкин АА, Фаж А, Либрадо П, Хан Н, Боковенко НА, Идэрхангай Т-О, Чугунов КВ, Графодатский АС, Орландо Л. Особенности селекции лошадей в аржано-майэмирское время на Алтае, в  Туве И Монголии. C. 188-192. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  10. Воробьева НВ, Куслий МА, Дружкова АС, Макунин АИ, Попова КО, Трифонов ВА, Графодатский АС, Васильев СК, Полосьмак НВ, Молодин ВИ. Филогеография древних лошадей из курганов плато Укок. C. 232-235. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  11. Andreyushkova DA, Lisachov AP, Romanenko SA, Giovannotti M, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Investigation of Lacerta agilis sex chromosomes origin using Lacerta strigata flow-sorted fluorescence probes. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 21-22

  12. Biltueva LS, Prokopov DYu, Romanenko SA, Schartl Manfred, Trifonov VA. Chromosomal organization and physical mapping of Siberian sturgeon genome (Acipenser baerii). International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 24

  13. Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Druzhkova AS, Interesova EA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Repetitive DNA characterization in cyprinid species with different ploidy level. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 25

  14. Tishakova KV, Lisachov AP, Galkina SA, Saifitdinova AF, Romanenko SA, Andreyushkova DA, Davletshina GI, Trifonov VA. An autosome-borne gene is extensively amplified in the W chromosome of Eremias velox (Lacertidae, Reptilia). International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 34-35

  15. Лемская НА, Романенко СА, Дольский АА, Прокопов ДЮ, Шорина АР, Максимова ЮВ. Методы молекулярной цитогенетики в описании кариотипической патологии. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 805

  16. Мензоров АГ, Беклемишева ВР. Сравнительный анализ трансдукции фибробластов ластоногих интегративными и неинтегративными вирусными векторами. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 970

  17. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторённой ДНК в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2019". М: МАКС Пресс, 2019. ISBN 978‐5‐317‐06100‐5

  18. Кичигин ИГ. Изучение генетического состава половых и добавочных хромосом чешуйчатых (Squamata, Reptilia) с помощью секвенирования изолированных хромосом. Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2019". М: МАКС Пресс, 2019. ISBN 978‐5‐317‐06100‐5

​Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторённой ДНК в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  2. Кичигин ИГ. Изучение генетического состава половых и добавочных хромосом чешуйчатых (Squamata, Reptilia) с помощью секвенирования изолированных хромосом. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2019", 8-12 апреля 2019, Москва

  3. Grafodatsky AS. From 2n to VGP. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Druzhkova AS. The phylogeographical history of the brown bear (Ursus arctos Linnaeus) in Northeast Eurasia. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск 

  5. Proskuryakova AA. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  6. Makunin AI. Summary of mammalian B chromosome sequencing. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  7. Romanenko SA. Intrachromosomal rearrangements within evolutionarily conserved syntenic blocks. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  8. Beklemisheva V. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  9. Proskuryakova A. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  10. Прокопов ДЮ. Происхождение и эволюция половых и добавочных хромосом копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus). XXV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов", 9-13 апреля 2018, Москва

  11. Графодатский АС. Эволюция хромосом и геномов млекопитающих. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  12. Макунин АИ. Древняя ДНК. Крупные млекопитающие Западной Сибири. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  13. Графодатский АС. Хромосомы и геномы домашних, пушных и промысловых млекопитающих. Международная конференция "Беляевские чтения", 7-10 августа 2017, Новосибирск

  14. Графодатский А. Разнообразие геномов млекопитающих на хромосомном уровне. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  15. Дружкова А. Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  16. Куслий М. Генотипирование древних лошадей археологического памятника Яломан-II. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  17. Макунин А. Высокопроизводительное секвенирование отдельных хромосом. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  18. Макунин А. Сборка полного митохондриального генома лошади Оводова (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  19. Прокопов Д. Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  20. Прокопов ДЮ. Разработка молекулярно-цитогенетических маркеров для идентификации хромосом осетровых. Международная конференция "Водные экосистемы Сибири и перспективы их использования", 22-24 ноября 2016, Томск

  21. Beklemisheva V. Refinement of the ancestral carnivore karyotype based on the comparative chromosome painting of pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). 21st International Chromosome Conference. 10-13 July 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  22. Romanenko S. A review on cytogenetic studies in mammals. 22nd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics. July 2-5, 2016, Toulouse, France

  23. Proskuryakova AA. Chromosome organization features of the grey whale (Cetacea). 22nd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics. July 2-5, 2016, Toulouse, France

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics, University of Cambridge, UK
    Эволюция кариотипов и половых хромосом рептилий

  • National Cancer Institute at Frederick, MD, USA
    Сравнительная геномика млекопитающих

  • Cornell University, Ithaca, NY, USA
    Сравнительная геномика

  • University of North Carolina at Chapel Hill, NC, USA
    Сравнительная геномика

  • Institut für Humangenetik, Jena, Germany
    Сравнительная геномика

  • Muséum national d'histoire naturelle, Paris, France
    Сравнительная геномика

  • Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Toulouse, France
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Firenze, Florence, Italy
    Сравнительная геномика

  • Kunming Institute of Zoology, China
    Сравнительная геномика

  • Universidade de São Paulo, Câmpus de Rio Claro, Brasil
    Цитогенетика неотропических рыб

  • University of Illinois at Urbana, Champaign, IL, USA
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Palermo, Italy
    Сравнительная геномика

Награды: 

Премия СО АН СССР

Графодатский АС (1986)

Премия РАН им. АА Баева

Графодатский АС (1995)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Перельман ПЛ (2003)
Проскурякова АА (2020)

Звание “Лучший аспирант РАН”

Романенко СА (2007)

Гранты Президента РФ для молодых кандидатов наук

Романенко СА (2010)

Национальная премия Л'Ореаль-ЮНЕСКО при поддержке РАН “Для женщин в науке”

Романенко СА (2012)

Юбилейная медаль “80 лет Новосибирской области”

Графодатский АС (2017)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Романенко СА (2018)
Лемская НА (2018)
Проскурякова АА (2019)

Памятный знак "За труд на благо города"

Беклемишева ВР, Графодатский АС, Сердюкова НА (2013)

Экспертный совет Российского Фонда Фундаментальных Исследований в 2017 году признал лучшими результаты, полученные при выполнении проекта №15-29-02384 (руководитель дбн АС Графодатский). Глава РФФИ академик ВЯ Панченко представил эти результаты в отчете для Правительства РФ