Технологическая платформа для экстренного создания антител

ПРОЕКТ
Технологическая платформа экстренного создания средств профилактики и терапии вирусных инфекций на примере SARS-CoV-2-нейтрализующих антител

Реализуется в рамках
Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы

Для финансирования Проекта на период 2021 – 2023 выделен грант Минобрнауки №075-15-2021-1086 (ЕГИСУ НИОКТР №122031000036-2)

Руководитель Проекта
Таранин Александр Владимирович
дбн
ИМКБ СО РАН

Для реализации Проекта создан консорциум в составе:

Головная ораганизация

IMCB_logo_small.jpg ИМКБ СО РАН
(Новосибирск)

Исполнители

IMB_logo.jpg Институт молекулярной биологии 
им. ВА Энгельгардта РАН (Москва)
immuno_logo.jpg ГНЦ Институт иммунологии 
ФМБА России (Москва)
imgen_logo.jpg ООО "Имген+"
(Новосибирск)
SPb_med_logo.jpg Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика ИП Павлова Минздрава России (Санкт-Петербург)
FNKC_logo.jpg Федеральный научно-клинический центр 
специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий
ФМБА России (Москва)

Исполнители Проекта имеют прочную практическую базу и набор необходимых компетенций для его реализации. В 2020 году ИМКБ СО РАН первым в РФ получил эффективные блокирующие антитела против коронавируса SARS-CoV-2

stopcovid_logo.jpg Блокирующие антитела против коронавируса stopcovid_logo.jpg Эффективность блокирующих антител против коронавируса проверена на животных

Результаты работы по получению и исследованию этих антител совместно с другими исполнителями Проекта опубликованы:

Gorchakov AA, Kulemzin SV, Guselnikov SV, Baranov KO, Belovezhets TN, Mechetina LV, Volkova OYu, Najakshin AM, Chikaev NA, Chikaev AN, Solodkov PP, Larichev VF, Gulyaeva MA, Markhaev AG, Kononova YuV, Alekseyev AYu, Shestopalov AM, Yusubalieva GM, Klypa TV, Ivanov AV, Valuev-Elliston VT, Baklaushev VP, Taranin AV.
Isolation of a panel of ultra-potent human antibodies neutralizing SARS-CoV-2 and viral variants of concern.
(doi: 10.1038/s41421-021-00340-8Cell Discov 7: 96, 2021


Проект включает в себя

  • Выполнение исследовательской программы
  • Подготовку кадров и развитие кадрового потенциала
  • Создание лабораторий, центров коллективного пользования и объектов информационной инфраструктуры в области генетических технологий

Исследовательская программа состоит из пяти основных блоков: 

  • Создание клеточной платформы для промышленной продукции антител с использованием методов геномного редактирования
  • Создание молекулярных и клеточных инструментов для селекции и оценки функциональных свойств противовирусных антител
  • Оптимизация технологии получения нейтрализующих моноклональных антител человека
  • Оптимизация технологии получения терапевтических средств на основе однодоменных антител верблюжьих
  • Доклинические испытания безопасности и эффективности двух ранее охарактеризованных высокопотентных SARS-CoV-2-специфичных нейтрализующих моноклональных антител

РЕАЛИЗАЦИЯ ПРОЕКТА:

Выполнение исследовательской программы

2021 IMCB_logo_small.jpg Сформированы когорты доноров с различной историей заболеваний COVID-19 и вакцинации;
Создана панель генетических конструкций, кодирующих рекомбинантные белки (более 20), в том числе – различные варианты S-белка вируса SARS-CoV-2;
Необходимые растворимые белки-реагенты наработаны в эукариотической системе;
Создана клеточная линия для использования в псевдовирусной системе;
Созданы фаговые библиотеки, кодирующие наноантитела против RBD;
Создана коллекция вирусной РНК;
Составлен план доклинических исследований нейтрализующих моноклональных антител;
Отлажены необходимые методики:
- Использование антител для профилактики и терапии COVID-19 на модельных животных;
- Оценка нейтрализующей активности антител с использованием псевдовирусов (2 варианта);
- Экспресс-оценка нейтрализующей активности антител с использованием суррогатного цитометрического метода;
- Экспресс-оценка нейтрализующей активности антител с использованием планшетного теста и растворимого АСЕ2;

Подготовка кадров и развитие кадрового потенциала

2021 SPb_med_logo.jpg Разработана образовательная программа мультидисциплинарного межкафедрального цикла “Современные аспекты лечения тяжелой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2”

 

Создание лабораторий, ЦКП и объектов информационной инфраструктуры

2021 IMCB_logo_small.jpg Лаборатория инженерии антител (Приказ директора ИМКБ №36 от 30.09.2021)
Центр коллективного пользования “Дизайн рекомбинантных антител” (Приказ директора ИМКБ №45 от 15.11.2021)

 

Организация конференций

2022 IMCB_logo_small.jpg ИМКБ СО РАН организовал школу-конференцию "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител"

 

Публикации по теме Проекта

  • Kulemzin SV, Sergeeva MV, Baranov KO, Gorchakov AA, Guselnikov SV, Belovezhets TN, Volkova OY, Najakshin AM, Chikaev NA, Danilenko DM, Taranin AV. VH3-53/66-Class RBD-specific human monoclonal antibody iB20 displays cross-neutralizing activity against emerging SARS-CoV-2 lineages. (doi: 10.3390/jpm12060895J Pers Med 12(6): 895, 2022

  • Stanevich OV, Fomina DS, Bakulin IG, Galeev SI, Bakin EA, Belash VA, Kulikov AN, Lebedeva AA, Lioznov DA, Polushin YuS, Shlyk IV, Vorobyev EA, Vorobyeva SV, Surovceva TV, Bakulina NV, Lysenko MA, Moiseev IS. Ruxolitinib versus dexamethasone in hospitalized adults with COVID-19: multicenter matched cohort study. (doi: 10.1186/s12879-021-06982-z) BMC Infect Dis 21: 1277, 2021

 

Доклады по теме Проекта

video_icon.jpg
Видео доклада
  • Кулемзин СВ (ИМКБ СО РАН, Новосибирск). Получение SARS-CoV-2 нейтрализующих антител. Научно-практическая конференция "Лечение осложнений COVID-19". НИИ ДОГиТ им. РМ Горбачевой, 15-16 апреля 2022, Санкт-Петербург

  • Баклаушев ВП (ФНКЦ ФМБА России, Москва). Рациональная стратегия выработки и поддержания защитного иммунитета к новым штаммам SARS-CoV2. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Попова МО (ПСПГМУ им. акад. ИП Павлова Минздрава России, Санкт-Петербург). Особенности  СOVID-19 у онкогематологических пациентов: течение, лечение, ответ и профилактика. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Сергеева МВ (НИИ гриппа им. АА Смородинцева Минздрава России, Санкт-Петербург). Изменение гуморального иммунного ответа у вакцинированных против COVID-19 в течение года после иммунизации. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Иванов АВ (ИМБ им. ВА Энгельгарта РАН, Москва). Плазма-подобные среды для исследования метаболизма и вирусных инфекций. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Астахова ЕА (ИИ ФМБА России, Москва). Применение антигенной картографии для оценки широты вирус-нейтрализующего гуморального иммунитета против COVID-19. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Беловежец ТН (ИМКБ СО РАН, Новосибирск). Cистема для оценки аффинности взаимодействия вариантов Spike-белка SARS-CoV-2 с моноклональными антителами или радуга в пробирке. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Тиллиб СВ (ИБГ РАН, ИМБ им. ВА Энгельгардта РАН, Москва). Создание специфических однодоменных антител и их производных с целью эффективной борьбы с инфекционными заболеваниями. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Солодков ПП (ИМКБ СО РАН, Новосибирск). Наноантитела ламы против S-белка SARS-CoV-2 и его мутантных вариантов. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Новосибирск

  • Шершнева ДС. Создание мультиплексной системы для оценки аффинности взаимодействия вариантов Spike-белка SARS-COV-2 с моноклональными антителами. OpenBio-2022, 27-30 сентября 2022, наукоград Кольцово, Новосибирская область

 

Стажировки и рабочие поездки

Астахова ЕА
Институт иммунологии ФМБА России (Москва)  ИМКБ СО РАН, август-сентябрь 2022

кмн Лепик КВ
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика ИП Павлова  ИМКБ СО РАН, сентябрь 2022

кмн Попова МО
Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика ИП Павлова  ИМКБ СО РАН, сентябрь 2022

Беловежец ТН
ИМКБ СО РАН  Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика ИП Павлова, сентябрь 2022

Юрина АА
ИМКБ СО РАН  ФНКЦ ФМБА России (Москва), сентябрь-октябрь 2022

 

Публикации в СМИ

Сотрудники ИМКБ, которые участвуют в проекте, подробно рассказывают в СМИ о коронавирусе SARS-CoV-2, вакцинации, антителах и иммунитете. Подборку материалов на эти темы можно увидеть здесь