Лаборатория структурной, функциональной и сравнительной геномики

Лаборатория структурной, функциональной и сравнительной геномики создана в Новосибирском государственном университете в 2014 году и является частью Стратегической академической единицы Синтетическая биология

 

5-100_logo.jpgРеализуется в рамках проекта по повышению конкурентоспособности российских вузов 5-100

 
 
Жимулев Игорь Федорович
Заведующий лабораторией

Curriculum vitae

Сотрудники: 

thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Жимулев Игорь Федорович дбн zhimulevatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Графодатский Александр Сергеевич дбн grafatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Таранин Александр Владимирович дбн taraninatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Трифонов Владимир Александрович кбн vladatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Горчаков Андрей Александрович кбн gorchakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Романенко Светлана Анатольевна кбн rosaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Перельман Полина Львовна кбн perelmanpatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Коряков Дмитрий Евгеньевич кбн koryakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Шлома Виктор Владимирович кбн shlomaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Пиндюрин Алексей Валерьевич кбн a [dot] pindyurinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Белякин Степан Николаевич кбн belyakinatmcb [dot] nsc [dot] ru
Направления исследований: 

  • структурно-функциональная организация хромосом
  • кластерная организация генов
  • молекулярная организация гетерохроматина животных и растений
  • разработка системы для внесения направленных модификаций в геном
  • организация и эволюция хромосом и геномов позвоночных
  • палеогеномика
  • структура добавочных хромосом
  • хромосомные системы определения пола
  • функциональный и эволюционный анализ геномной компоненты иммунной системы

 

ПУБЛИКАЦИИ: 

2019

  1. Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman P, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks.  (doi: 10.1101/gr.239863.118) Genome Res 29(4): 576-589, 2019
    (IF = 10.101)

  2. Elbers JP, Rogers MF, Perelman PL, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Johnson WE, Horin P, Corander J, Murphy D, Burger PA. Improving Illumina assemblies with Hi‐C and long reads: an example with the North African dromedary. Mol Ecol Resour, 2019, doi: 10.1111/1755-0998.13020
    (IF = 7.059)

  3. Kulemzin SV, Matvienko DA, Sabirov AH, Sokratyan AM, Chernikova DS, Belovezhets TN, Chikaev AN, Taranin AV, Gorchakov AA. Design and analysis of stably integratedreporters for inducible transgeneexpression in human T cells and CAR NK-cell lines. (doi: 10.1186/s12920-019-0489-4) BMC Med Genom 12(Suppl 2): 44, 2019
    (IF = 3.317)

  4. Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TY, Goncharov FP, Larsson J, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogasterChromosoma, 2019, doi: 10.1007/s00412-019-00703-x
    (IF = 4.021)

  5. Pavlova GA, Razuvaeva AV, Popova JV, Andreyeva EN, Yarinich LA, Lebedev MO, Pellacani C, Bonaccorsi S, Somma MP, Gatti M, Pindyurin AV. The role of Patronin in Drosophila mitosis. (doi: 10.1186/s12860-019-0189-0) BMC Mol Cell Biol 20 (Suppl 1): 7, 2019
    (IF = 2.769)

  6. Kichigin IG, Lisachov AP, Giovannotti M, Makunin AI, Kabilov MR, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MF, Graphodatsky AS, Trifonov VA. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. (doi: 10.1007/s00438-018-1483-9) Mol Genet Genomics 294(1): 13-21, 2019  
    (IF = 2.734)

  7. Andreyeva EN, Ogienko AA, Dubatolova TD, Oshchepkova AL, Kozhevnikova EN, Ivankin AV, Pavlova GA, Kopyl SA, Pindyurin AV. A toolset to study functions of Cytosolic non-specific dipeptidase 2 (CNDP2) using Drosophila as a model organism. (doi: 10.1186/s12863-019-0726-z) BMC Genetics 20(Suppl 1): 31, 2019
    (IF = 2.469)

  8. Lisachov AP, Galkina SA, Saifitdinova AF, Romanenko SA, Andreyushkova DA, Trifonov VA, Borodin PM. Identification of sex chromosomes in Eremias velox (Lacertidae, Reptilia) using lampbrush chromosome analysis. (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i2.34116) Comp Cytogenet 13(2): 17-28, 2019
    (IF = 1.319)

  9. Pobedintseva MA, Makunin AI, Kichigin IG, Kulemzina AI, Serdyukova NA, Romanenko SA, Vorobieva NV, Interesova EA, Korentovich MA, Zaytsev VF, Mischenko AV, Zadelenov VA, Yurchenko AA, Sherbakov DYu, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Population genetic structure and phylogeography of sterlet (Acipenser ruthenus, Acipenseridae) in the Ob and Yenisei river basins. (doi: 10.1080/24701394.2018.1467409) Mitochondrial DNA Part A 30(1): 156-164, 2019
    (IF = 0.575)

  10. Khoroshko VA, Pokholkova GV, Zykova TYu, Osadchiy IS, Zhimulev IF. Gene dunce localization in the polytene chromosome of Drosophila melanogaster long span batch of adjacent chromosomal structures. (doi: 10.1134/S1607672919010137) Doklady Biochem Biophys 484(1): 55-58, 2019
    (IF = 0.610)

  11. Sidorenko DS, Zykova TYu, Khoroshko VA, Pokholkova GV, Demakov SA, Larsson J, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes reflect functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.18699/VJ19.474) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 148-153, 2019

  12. Andreyeva EN, Ogienko AA, Yushkova AA, Popova JV, Pavlova GA, Kozhevnikova EN, Ivankin AV, Gatti M, Pindyurin AV. Non3 is an essential Drosophila gene required for proper nucleolus assembly. (doi: 10.18699/VJ19.481) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 190-198, 2019

  13. Lebedev MO, Yarinich LA, Ivankin AV, Pindyurin AV. Generation of barcoded plasmid libraries for massively parallel analysis of chromatin position effects. (doi: 10.18699/VJ19.483) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 203-211, 2019

  14. Omelina ES, Pindyurin AV. Optogenetic regulation of endogenous gene transcription in mammals. (doi: 10.18699/VJ19.485) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 219-225, 2019

  15. Andreyenkova NG, Starikov IJ, Wink M, Karyakin IV, Andreyenkov OV, Zhimulev IF. The problems of genetic support of dividing the black kite (Milvus migrans) into subspecies. (doi: 10.18699/VJ19.486) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 226-231, 2019

Публикации за 2014-2018