• структурно-функциональная организация хромосом
• кластерная организация генов
• молекулярная организация гетерохроматина животных и растений
• разработка системы для внесения направленных модификаций в геном
• организация и эволюция хромосом и геномов позвоночных
• палеогеномика
• структура добавочных хромосом
• хромосомные системы определения пола
• функциональный и эволюционный анализ геномной компоненты иммунной системы

ПУБЛИКАЦИИ: 

2021

1. Pan Q, ..., Trifonov V, ..., Guiguen Y. The rise and fall of the ancient northern pike master sex determining gene. (doi: 10.7554/eLife.62858) eLife 10: e62858, 2021
   (IF = 7.080)

2. Lisachov A, Andreyushkova D, Davletshina G, Prokopov D, Romanenko S, Galkina S, Saifitdinova A, Simonov E, Borodin P, Trifonov V. Amplified fragments of an autosome-borne gene constitute a significant component of the W sex chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). (doi: 10.3390/genes12050779) Genes 12(5): 779, 2021
   (IF = 3.759)

3. Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Molodtseva AS, Perelman PL, Interesova EA, Beklemisheva VR, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolution of tandemly arranged repetitive DNAs in three species of Cyprinoidei with different ploidy levels. (doi: 10.1159/000513274) Cytogenet Genome Res 161: 32-42, 2021
   (IF = 1.423)

4. Побединцева МА, Решетникова СН, Сердюкова НА, Бишани А, Трифонов ВА, Интересова ЕА. Генетическая гетерогенность серебряного карася Carassius gibelio (Cyprinidae) в бассйне средней Оби. (doi: 10.31857/S0016675821040111) Генетика 57(4): 429-436, 2021
   (IF = 0.466)
    

2020

1. Du K, … Prokopov D, Makunin A, Kichigin I, … Trifonov V, … Schartl M. The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization. (doi: 10.1038/s41559-020-1166-x) Nat Ecol Evol 4: 841–852, 2020
   (IF = 12.541)

2. Yang C, Li F, Xiong Z, Koepfli K-P, Ryder O, Perelman P, Li Q, Zhang G. A draft genome assembly of spotted hyena, Crocuta crocuta. (doi: 10.1038/s41597-020-0468-9) Sci Data 7: 126, 2020
   (IF = 5.541)

3. Fofanov MV, Prokopov DY, Kuhl H, Schartl M, Trifonov VA. Evolution of microRNA biogenesis genes in the sterlet (Acipenser ruthenus) and other polyploid vertebrates. (doi: 10.3390/ijms21249562) Int J Mol Sci 21(24): 9562, 2020
   (IF = 4.556)

4. Levitsky VG, Zykova TYu, Moshkin YuM, Zhimulev IF. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in Drosophila interphase chromosomes. (doi: 10.3390/ijms21239282) Int J Mol Sci 21(23): 9282, 2020
   (IF = 4.556)

5. Kolesnikova TD, Kolodyazhnaya AV, Pokholkova GV, Schubert V, Dovgan VV, Romanenko SA, Prokopov DYu, Zhimulev IF. Effects of mutations in the Drosophila melanogaster Rif1 gene on the replication and underreplication of pericentromeric heterochromatin in salivary gland polytene chromosomes. (doi: 10.3390/cells9061501) Cells 9(6): 1501, 2020 
   (IF = 4.366)

6. Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism.(doi: 10.3390/genes11040374) Genes 11(4): 374, 2020
   (IF = 3.759)

7. Khoroshko VA, Pokholkova GV, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.3390/genes11040417) Genes 11(4): 417, 2020
   (IF = 3.759)

8. Biltueva LS, Prokopov DY, Romanenko SA, Interesova EA, Schartl M, Trifonov VA. Chromosome distribution of highly conserved tandemly arranged repetitive DNAs in the Siberian sturgeon (Acipenser baerii). (doi: 10.3390/genes11111375) Genes 11(11): 1375, 2020
   (IF = 3.759)

9. Ogienko AA, Andreyeva EN, Omelina ES, Oshchepkova AL, Pindyurin AV. Molecular and cytological analysis of widely-used Gal4 driver lines for Drosophila neurobiology. (doi: 10.1186/s12863-020-00895-7) BMC Genetics 21: 96, 2020
   (IF = 2.567)

10. Smagina AS, Kulemzin SV, Yusubalieva GM, Kedrova AG, Sanzharov AE, Ivanov YV, Matvienko DA, Kalsin VA, Gorchakov AA, Baklaushev VP, Taranin AV. VAV1‐overexpressing YT cells display improved cytotoxicity against malignant cells. Biotechnol Appl Biochem, 2020, doi: 10.1002/bab.2001
    (IF = 1.638)

11. Lisachov AP, Giovannotti M, Pereira JC, Andreyushkova DA, Romanenko SA, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Chromosome painting does not support a sex chromosome turnover in Lacerta agilis Linnaeus, 1758. (doi: 10.1159/000506321) Cytogenet Genome Res 160: 134-140, 2020
    (IF = 1.423)

12. Ellis THN, Vershinin AV. Retrotransposons and the evolution of genome size in Pisum. (doi: 10.3390/biotech9040024) BioTech 9(4): 24, 2020

13. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Решетов ИВ, Веряскина ЮА, Важенин АВ, Гостимский АВ, Ипполитов ЛИ, Рогова МО. Стратификация риска рецидива папиллярного рака щитовидной железы на основании результатов молекулярно-генетических исследований. (doi: 10.17650/2222-1468-2020-10-1-93-100) Опухоли головы и шеи 10(1): 93-100, 2020

Публикации за 2014-2019