Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Ведущий научный сотрудник
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
        ФИО Должность Ученая
степень		 Контакты
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич внс / зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif       Терлецкий Александр Витальевич нс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна нс кбн  
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаборант    
        Титов Сергей Евгеньевич снс совместитель кбн  
        Иванов Михаил Константинович нс совместитель кбн  
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совместитель кбн  
        Гунбин Константин Владимирович нс совместитель кбн  
        Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совместитель кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совместитель    
        Сердюкова Ольга Станиславона ст. лаборант
совместитель		    
        Маслов Константин Анатольевич ст. лаборант совместитель    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Lyusikov OM, Gordei IA, Vershinin AV. Secalotriticum hybrids as a new model for studying the activity of genes encoding centromere-specific protein CENH3. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 45

  2. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Stepochkin PI, Vershinin AV. The CENH3 gene encoding centromere-specific histone H3: activity in Triticale. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 46

  3. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Shubert V, Houben A, Vershinin AV. Evolutionary dynamics of the centromeric histone CENH3 within the tribe Triticeae. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 20-21

  4. Ovsyannikova AK, Rymar OD, Ivanoshchuk DE, Mikhailova SV, Shakhtshneider EV, Orlov PS, Malakhina ES, Voevoda MI. A case of maturity onset diabetes of the young (MODY3) in a family with a novel HNF1A gene mutation in five generations. (doi: 10.1007/s13300-017-0350-8) Diabetes Ther 9(1): 413-420, 2018

  5. Ivanov MK, Titov SE, Glushkov SA, Dzyubenko VV, Malek AV, Arkhangelskaya PA, Samsonov RB, Mikhetko AA, Bakhidze EV, Berlev IV, Kolesnikov NN. Detection of high-grade neoplasia in air-dried cervical PAP smears by a microRNA-based classifier. (doi: 10.3892/or.2018.6214) Oncology Rep 39: 1099-1111, 2018 

  6. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Elisafenko EA, Vershinin AV. Chromosomal assignment of centromere-specific histone CENH3 genes in rye (Secale cereale L.) and their phylogeny. (doi: 10.3897/CompCytogen.v11i4.19953) Comp Cytogenet 11(4): 821-832, 2017

  7. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Houben A, Vershinin AV. Conserved molecular structure of the centromeric histone CENH3 in Secale and its phylogenetic relationships. (doi: 10.1038/s41598-017-17932-8) Sci Reports 7: 17628, 2017

  8. Гордей ИА, Люсиков ОМ, Гордей ИС, Шимко ВЕ, Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Липихина ЮА. Молекулярно-генетические основы создания нового генофонда ржи и ржано-пшеничных амфидиплоидов секалотрикум. Молекулярная и прикладная генетика 23: 26-39, 2017

  9. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Houben A, Vershinin AV. Characterization of the centromeric histone H3 (CENH3) in genus Secale and its phylogenetic relationships. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 214

  10. Архангельская ПА, Самсонов РБ, Штам ТА, Князева МС, Иванов МК, Титов СЕ, Колесников НН, Бахидзе ЕВ, Берлев ИВ, Михетько АА, Воробьев СЛ, Малек АВ. Оценка экспрессии 4 микроРНК в цитологических препаратах в качестве дополнительного метода диагностики рака шейки матки. Опухоли женской репродуктивной системы 13(3), 63-72, 2017

  11. Самсонов РБ, Бурдаков ВС, Штам ТА, Раджабова ЗА, Чебуркин ЮВ, Васильев ДА, Цырлина ЕВ, Титoв СЕ, Иванов МК, Филатов МВ, Берштейн ЛМ, Колесников НН, Малек АВ. Метод дифференциальной диагностики узловых заболеваний щитовидной железы: анализ комбинации микроРНК (миРНК-21, -181а и -146а). Опухоли головы и шеи 7(2): 16-24, 2017

  12. Stolyar M, Klimova O, Ivanov M, Gorbenko A, Titov S, Olkhovskiy I. JAK2 haplotype 46/1 (GGCC) has no effect on the primary risk of JAK2 V617F mutation, but it strongly potentiates the progression of grown allele burden in myeloproliferative neoplasms. Haematologica 102(s2): 539, 2017

  13. Malek A, Sleptsov I, Cheburkin Y, Samsonov R, Kolesnikov N. miRNA as potential tool for thyroid cancer diagnostics and follow up: practical considerations. JSM Thyroid Disord Manag 2(1): 1007, 2017

  14. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. (doi:  10.2174/1389202917666160512164913) Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

  15. Kolesnikov NN, Veryaskina YuA, Titov SE, Rodionov VV, Gening TP, Abakumova TV, Kometova VV, Torosyan MKh, Zhimulev IF. Expression of micrornas in molecular genetic breast cancer subtypes. Cancer Treatment and Research Communications, 2016, doi: 10.1016/j.ctarc.2016.08.006

  16. Stupak EV, Veryaskina YuA, Titov SE, Achmerova LG, Stupak VV, Ivanov MK, Zhimulev IF, Kolesnikov NN. MicroRNA profiling in the malignant progression of gliomas. AIP Conf Proc 1760, 020065, doi: 10.1063/1.4960284, 2016

  17. Evtushenko  EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. The molecular mechanisms of heterochromatin expansion in rye chromosomes. Cytogenet Genome Res 148: 91, 2016

  18. Полоз ТЛ, Титов СЕ, Изупова НЮ, Колесников НН. Использование молекулярных маркеров для дополнения цитологической диагностики узлов щитовидной железы. Описание наблюдения. Новости клинической цитологии России 20(1-2): 14-17, 2016

  19. Titov SE, Demenkov PS, Ivanov MK, Malakhina ES, Poloz TL, Tsivlikova EV, Ganzha MS, Shevchenko SP, Gulyaeva LF, Kolesnikov NN. Selection and validation of miRNAs as normalizers for profiling expression of microRNAs isolated from thyroid fine needle aspiration smears. (doi: 10.3892/or.2016.5113) Oncology Rep 36: 2501-2510, 2016

  20. Ступак ЕВ, Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Ступак ВВ, Мишинов СВ, Копорушко НА, Петрова ЮВ, Пустаханов ВВ, Иванов МК, Жимулев ИФ, Колесников НН. Значение профиля миРНК в диагностике злокачественных глиом головного мозга. Российский нейрохирургический журнал 8(2): 54-59, 2016

  21. Samsonov R, Burdakov V, Shtam T, Radzhabovа Z, Vasilyev D, Tsyrlina E, Titov S, Ivanov M, Berstein L, Filatov M, Kolesnikov N, Gil-Henn H, Malek A. Plasma exosomal miR-21 and miR-181a differentiates follicular from papillary thyroid cancer. (doi: 10.1007/s13277-016-5065-3) Tumor Biol 37: 12011-12021, 2016

  22. Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. The expansion of heterochromatin blocks in rye reflects the co-amplification of tandem repeats and adjacent transposable elements. (doi: 10.1186/s12864-016-2667-5) BMC Genomics 17(1): 337, 2016

  23. Titov SE, Ivanov MK, Karpinskaya EV, Tsivlikova EV, Shevchenko SP, Veryaskina YA, Akhmerova LG, Poloz TL, Klimova OA, Gulyaeva LF, Zhimulev IF, Kolesnikov NN. miRNA profiling, detection of BRAF V600E mutation and RET-PTC1 translocation in patients from Novosibirsk oblast (Russia) with different types of thyroid tumors. (doi: 10.1186/s12885-016-2240-2) BMC Cancer 16: 201, 2016

  24. Евтушенко ЕВ, Гаськов ДЮ, Гацкая СС, Вершинин АВ. Вариабельность структуры центромерного гистона H3 и филогения рода Secale. Цитология 58: 320-323, 2016

  25. Липихина ЮА, Евтушенко ЕВ, Гацкая СС, Стёпочкин ПИ, Люсиков ОМ, Гордей ИА, Вершинин АВ. Проявление активности гена центромерного гистона H3 у аллополиплоидных гибридов пшеницы и ржи. Цитология 58: 324-329, 2016

  26. Колесников НН, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Владимирова АВ, Самсонов РБ, Артемьева АС, Новик ВИ, Берштейн ЛМ, Жимулев ИФ, Mалек АВ. Повышение точности и информативности тонкоигольной аспирационной пункционной биопсии опухолей молочной железы путем анализа микроРНК в материале цитологического мазка. Успехи молекулярной онкологии 3(1): 44-52, 2016

  27. Колесников НН, Титов СЕ, Малахина ЕС, Полоз ТЛ, Иванов МК, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Шевченко СП, Журавлев ЕС, Жимулев ИФ. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. Новости клинической цитологии России 19(1-2): 43, 2015

  28. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Родионов ВВ, Генинг ТП, Абакумова ТВ, Кометова ВВ, Торосян МХ, Жимулев ИФ, Колесников НН. Экспрессия микроРНК в молекулярно-генетических подтипах рака молочной железы. Современные проблемы науки и образования 5, 2015

  29. Веряскина ЮА, Какурина ГВ, Журавлев ЕС, Титов СЕ, Кондакова ИВ, Черемисина ОВ, Шишкин ДА, Жимулев ИФ, Чойнзонов ЕЛ, Колесников НН. Экспрессионный профиль микроРНК при плоскоклеточном раке головы и шеи. Сибирский онкологический журнал 6: 33–38, 2015

  30. Королева АГ, Евтушенко ЕВ, Максимова НВ, Вершинин АВ, Ситникова ТЯ, Кирильчик СВ. Длина и структура теломерной ДНК у трех видов Байкальских брюхоногих моллюсков (Caenogastropoda: Hydrobioidea: Benedictiidae). Генетика 51: 362-370, 2015

  31. Колесников НН, Титов СЕ, Малахина ЕС, Полоз ТЛ, Иванов МК, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Шевченко СП, Журавлев ЕС, Жимулев ИФ. МикроРНК как клинические биомаркеры в диагностике онкологических заболеваний. Исследования и практика в медицине 1 (1): 55, 2015

  32. Shevchenko S, Mostovich L, Kolesnikov N, Gulyaeva L. Molecular biomarkers in preoperative diagnosis of thyroid cancer. Eur J Cancer Suppl 13(1): 52, 2015

  33. Vershinin AV, Evtushenko EV. What is the specificity of plant subtelomeres? In: "Subtelomeres" (Louis EJ, Becker MM, Eds), Springer-Verlag Berlin Heidelberg, pp 195-210, 2014 (doi: 10.1007/978-3-642-41566-1_11)

  34. Levitsky VG, Babenko VN, Vershinin AV. The roles of the monomer length and nucleotide context of plant tandem repeats in nucleosome positioning. (doi: 10.1080/07391102.2012.755796) J Biomol Struct Dyn 32: 115-126, 2014

  35. Chanyshev MD, Kosorotikov NI, Titov SE, Kolesnikov NN, Gulyaeva LF. Expression of microRNAs, CYP1A1 and CYP2B1 in the livers and ovaries of female rats treated with DDT and PAHs. (doi: 10.1016/j.lfs.2014.03.031) Life Sci 103: 95-100, 2014

  36. Гуляева ЛФ, Чанышев МД, Колмыков СК, Колесников НН. Биоинформатические и экспериментальные подходы к изучению роли микроРНК в видоспецифичной индукции цитохрома Р4502В. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина 12: 5-11, 2014

  37. Веряскина ЮА, Какурина ГВ, Титов СЕ, Колесников НН. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. Сибирский онкологический журнал, Приложение 1: 30, 2014

Публикации старше 5 лет

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2018-0007 Определение профилей экспрессии ряда микроРНК при развитии злокачественных новообразований щитовидной железы. Жимулев ИФ 

0310-2018-0010 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Жимулев ИФ

Гранты РФФИ

17-04-00748 (номер гос. регистрации АААА-А17-117042010012-9) Особенности молекулярной структуры центромерного гистона Н3 ржи, пшеницы и их аллополиплоидных гибридов. Вершинин АВ

18-54-00013 Динамика молекулярной организации центромер, индуцируемая стрессом отдаленной гибридизации у хлебных злаков. Вершинин АВ

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  3. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  4. Колесников НН. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. XI съезд ассоциации клинических цитологов России, 9-12 октября 2015, Звенигород, Московская обл.

  5. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  6. Евтушенко ЕВ. The molecular structure and interspecies variation of CENH3 genes in the Secale genus. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  7. Веряскина ЮА. МикроРНК – тканеспецифичный маркер процессов метастазирования. Всероссийская конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 22 мая 2015, Томск

  8. Липихина ЮА. Определение хромосомной локализации гена центромерного варианта гистона H3 в геноме ржи (Secale cereale L.). III (V) Всероссийская молодежная научно-практическая конференция "Перспективы развития и проблемы современной ботаники", 10–14 ноября 2014, Новосибирск

  9. Веряскина ЮА. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. IX конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 25 апреля 2014, Томск

  10. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  11. Колесников НН. Геном раковой клетки. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  12. Vershinin AV. Intensive recombinations have led to tandem repeat expansion and enlargement of rye subtelomeric heterochromatin. The 19th International Chromosome Conference. 2-6 September 2013, Bologna, Italy

  13. Колесников НН. Рак и микроРНК. VI Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых с международным участием "Цивьяновские чтения", 29-30 ноября 2013, Новосибирск

  14. Колесников НН. Разработка методов диагностики и типирования опухолей головного мозга на основе микроРНК. II Международный Форум "Инновации в медицине: основные проблемы и пути их решения. Высокотехнологичная медицина как элемент инновационной экономики", 22-23 марта 2013, Новосибирск

  15. Колесников НН. Дифференциальная экспрессия онкомикроРНК в опухолях головного мозга у человека. Международная конференция "Фундаментальные науки – медицине", 16-20 сентября 2013, Новосибирск

  16. Колесников НН. Рак, микроРНК и эволюция. Международная конференция Хромосома-2012,
    2-7 сентября 2012, Новосибирск

  17. Евтушенко ЕВ. Геномика и нуклеосомная организация субтеломерных районов хромосом ржи. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  18. Vershinin AV. Genomics of rye subtelomeric heterochromatin. 11th Gatersleben Research Conference "Chromosome biology, genome evolution, and speciation" 23-25 April 2012, Gatersleben, Germany

  19. Колесников НН. Эволюция половых хромосом и регуляторный потенциал Х-хромосомы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  20. Вершинин АВ. Молекулярная структура центромер. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  21. Vershinin AV. The genomics of the most abundant tandem repeat DNA families in the rye heterochromatin. Annual Main Meeting of the Society for Experimental Biology. Chromosome Organization and Cytogenomics, 30 June - 3 July 2010, Prague, Czech Republic

  22. Вершинин АВ. ЦУП (Центр Управления Поведением) хромосом: структурная организация и эволюция. Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных, 16-20 августа 2010, Новосибирск

  23. Евтушенко ЕВ. Молекулярная структура субтеломерного гетерохроматина ржи.
    I Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа - 6 сентября 2009, Новосибирск

  24. Колесников НН. Некодирующие регуляторные РНК Х-хромосомы млекопитающих. Происхождение и эволюция. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа - 6 сентября 2009, Новосибирск

  25. Kolesnikov NN. X-chromosome inactivation, mobile elements and ncRNA genes. 6th International Conference
    on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 22-28 June 2008, Novosibirsk, Russia

  26. Kolesnikov NN. Evolution of the structure of the XIST locus in mammals. 5th International Conference
    on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 16-22 July 2006, Novosibirsk, Russia

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

Патенты: 

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Отдел регуляции генетических процессов