Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

oogle Scholar Citations

thomson_logo.gif ResearcherID

eLIBRARY_logo.pngLIBRARY.RU

Состав лаборатории: 
      ФИО Должность Ученая
степень
Контакты
thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Колесников Николай Николаевич гнс дбн kolesnikovnnatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif   Терлецкий Александр Витальевич нс кбн  
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна мнс кбн  
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Липихина Юлия Алексеевна ст. лаб.-иссл.   lipikhinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
      Трунин Сергей Алексеевич ст. лаборант    
      Сердюкова Ольга Станиславона ст. лаборант    
      Титов Сергей Евгеньевич ст. лаб.-иссл. совместитель кбн  
      Иванов Михаил Константинович ст. лаб.-иссл. совместитель кбн  
      Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совместитель кмн  
      Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совместитель    
      Маслов Константин Анатольевич ст. лаборант совместитель    

Бывшие сотрудники

Гаськов Дмитрий Юрьевич

Направления исследований: 
  1. Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  2. Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  3. Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

Научно-популярное изложение результатов исследований:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации за последние 5 лет: 

  1. Kolesnikov NN, Veryaskina YuA, Titov SE, Rodionov VV, Gening TP, Abakumova TV, Kometova VV, Torosyan MKh, Zhimulev IF. Expression of micrornas in molecular genetic breast cancer subtypes. Cancer Treatment and Research Communications, 2016, doi: 10.1016/j.ctarc.2016.08.006

  2. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. Curr Genomics, 18(2): 214-226, 2017

  3. Evtushenko  EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. The molecular mechanisms of heterochromatin expansion in rye chromosomes. Cytogenet Genome Res 148: 91, 2016

  4. Полоз ТЛ, Титов СЕ, Изупова НЮ, Колесников НН. Использование молекулярных маркеров для дополнения цитологической диагностики узлов щитовидной железы. Описание наблюдения. Новости клинической цитологии России 20(1-2): 14-17, 2016

  5. Titov SE, Demenkov PS, Ivanov MK, Malakhina ES, Poloz TL, Tsivlikova EV, Ganzha MS, Shevchenko SP, Gulyaeva LF, Kolesnikov NN. Selection and validation of miRNAs as normalizers for profiling expression of microRNAs isolated from thyroid fine needle aspiration smears. Oncology Rep 36: 2501-2510, 2016

  6. Ступак ЕВ, Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Ступак ВВ, Мишинов СВ, Копорушко НА, Петрова ЮВ, Пустаханов ВВ, Иванов МК, Жимулев ИФ, Колесников НН. Значение профиля миРНК в диагностике злокачественных глиом головного мозга. Российский нейрохирургический журнал 8(2): 54-59, 2016

  7. Samsonov R, Burdakov V, Shtam T, Radzhabovа Z, Vasilyev D, Tsyrlina E, Titov S, Ivanov M, Berstein L, Filatov M, Kolesnikov N, Gil-Henn H, Malek A. Plasma exosomal miR-21 and miR-181a differentiates follicular from papillary thyroid cancer. Tumor Biol 37: 12011-12021, 2016

  8. Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. The expansion of heterochromatin blocks in rye reflects the co-amplification of tandem repeats and adjacent transposable elements. BMC Genomics 17(1): 337, 2016

  9. Titov SE, Ivanov MK, Karpinskaya EV, Tsivlikova EV, Shevchenko SP, Veryaskina YA, Akhmerova LG, Poloz TL, Klimova OA, Gulyaeva LF, Zhimulev IF, Kolesnikov NN. miRNA profiling, detection of BRAF V600E mutation and RET-PTC1 translocation in patients from Novosibirsk oblast (Russia) with different types of thyroid tumors. BMC Cancer 16: 201, 2016

  10. Евтушенко ЕВ, Гаськов ДЮ, Гацкая СС, Вершинин АВ. Вариабельность структуры центромерного гистона H3 и филогения рода Secale. Цитология 58: 320-323, 2016

  11. Липихина ЮА, Евтушенко ЕВ, Гацкая СС, Стёпочкин ПИ, Люсиков ОМ, Гордей ИА, Вершинин АВ. Проявление активности гена центромерного гистона H3 у аллополиплоидных гибридов пшеницы и ржи. Цитология 58: 324-329, 2016

  12. Колесников НН, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Владимирова АВ, Самсонов РБ, Артемьева АС, Новик ВИ, Берштейн ЛМ, Жимулев ИФ, Mалек АВ. Повышение точности и информативности тонкоигольной аспирационной пункционной биопсии опухолей молочной железы путем анализа микроРНК в материале цитологического мазка. Успехи молекулярной онкологии 3(1): 44-52, 2016

  13. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Родионов ВВ, Генинг ТП, Абакумова ТВ, Кометова ВВ, Торосян МХ, Жимулев ИФ, Колесников НН. Экспрессия микроРНК в молекулярно-генетических подтипах рака молочной железы. Современные проблемы науки и образования 5, 2015

  14. Веряскина ЮА, Какурина ГВ, Журавлев ЕС, Титов СЕ, Кондакова ИВ, Черемисина ОВ, Шишкин ДА, Жимулев ИФ, Чойнзонов ЕЛ, Колесников НН. Экспрессионный профиль микроРНК при плоскоклеточном раке головы и шеи. Сибирский онкологический журнал 6: 33–38, 2015

  15. Королева АГ, Евтушенко ЕВ, Максимова НВ, Вершинин АВ, Ситникова ТЯ, Кирильчик СВ. Длина и структура теломерной ДНК у трех видов Байкальских брюхоногих моллюсков (Caenogastropoda: Hydrobioidea: Benedictiidae). Генетика 51: 362-370, 2015

  16. Колесников НН, Титов СЕ, Малахина ЕС, Полоз ТЛ, Иванов МК, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Шевченко СП, Журавлев ЕС, Жимулев ИФ. МикроРНК как клинические биомаркеры в диагностике онкологических заболеваний. Исследования и практика в медицине 1 (1): 55, 2015

  17. Shevchenko S, Mostovich L, Kolesnikov N, Gulyaeva L. Molecular biomarkers in preoperative diagnosis of thyroid cancer. Eur J Cancer Suppl 13(1): 52, 2015

  18. Vershinin AV, Evtushenko EV. What is the specificity of plant subtelomeres? In: "Subtelomeres" (Louis EJ, Becker MM, Eds), Springer-Verlag Berlin Heidelberg, pp 195-210, 2014

  19. Levitsky VG, Babenko VN, Vershinin AV. The roles of the monomer length and nucleotide context of plant tandem repeats in nucleosome positioning. J Biomol Struct Dyn 32: 115-126, 2014

  20. Chanyshev MD, Kosorotikov NI, Titov SE, Kolesnikov NN, Gulyaeva LF. Expression of microRNAs, CYP1A1 and CYP2B1 in the livers and ovaries of female rats treated with DDT and PAHs. Life Sci 103: 95-100, 2014

  21. Гуляева ЛФ, Чанышев МД, Колмыков СК, Колесников НН. Биоинформатические и экспериментальные подходы к изучению роли микроРНК в видоспецифичной индукции цитохрома Р4502В. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина 12: 5-11, 2014

  22. Веряскина ЮА, Какурина ГВ, Титов СЕ, Колесников НН. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. Сибирский онкологический журнал, Приложение 1: 30, 2014 

  23. Королева АГ, Евтушенко ЕВ, Тимошкин ОА, Вершинин АВ, Кирильчик СВ. Длина теломерной ДНК и филогения байкальских и сибирских планарий (Turbellaria, Tricladida). Цитология 55: 247-251, 2013

  24. Евтушенко ЕВ, Елисафенко ЕА, Вершинин АВ. Организация и эволюция субтеломерных районов хромосом ржи. Цитология 55: 230-233, 2013

  25. Колесников НН, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Карпинская ЕВ, Шевченко CП, Ахмерова ЛГ, Иванов МК, Козлов ВВ, Елисафенко ЕА, Гуляева ЛФ, Жимулев ИФ. МикроРНК, эволюция и рак. Цитология 55: 159–164, 2013

  26. Колесников НН, Титов СЕ, Жимулев ИФ. МикроРНК в диагностике рака. Наука в России 6: 27-33, 2013

  27. Gulyaeva LF, Chanyshev MD, Kosorotikov NI, Kolesnikov NN. miRNA in post-transcriptional regulation of tissue-specific cytochrom P450 activity in female Wistar rats. Protein Sci 22(S1): 225, 2013

  28. Елисафенко ЕА, Колесников НН, Шевченко АИ, Закиян СМ. Эволюция процесса инактивации Х-хромосомы. В кн: ред. Закиян СМ, Власов ВВ, Дементьева ЕВ. Эпигенетика. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2012, С. 419-432

  29. Козлов ВВ, Веряскина ЮА, Ахмерова ЛГ, Буренкова НН, Титов СЕ, Иванов МК, Войцицский ВЕ, Сидоров СВ, Гуляева ЛФ, Колесников НН, Жимулев ИФ. Изменение экспрессии и структурно-функциональная организация генов микроРНК, участвующих в онкогенезе молочной железы человека. Злокачественные опухоли 2(2): 132-133, 2012

Публикации старше 5 лет

Действующие гранты: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2016-0005 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Вершинин АВ

0310-2016-0008 Разработка тест-систем на основе профилирования микроРНК и генотипирования для дифференциальной диагностики доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Колесников НН

0310-2016-0009
Тема 3. Ранняя диагностика и прогнозирование онкологических заболеваний человека на основе профилирования микроРНК. Колесников НН

Гранты РФФИ

17-04-00748 (номер гос. регистрации АААА-А17-117042010012-9) Особенности молекулярной структуры центромерного гистона Н3 ржи, пшеницы и их аллополиплоидных гибридов. Вершинин АВ

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  2. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  3. Колесников НН. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. XI съезд ассоциации клинических цитологов России, 9-12 октября 2015, Звенигород, Московская обл.

  4. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  5. Евтушенко ЕВ. The molecular structure and interspecies variation of CENH3 genes in the Secale genus. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  6. Веряскина ЮА. МикроРНК – тканеспецифичный маркер процессов метастазирования. Всероссийская конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 22 мая 2015, Томск

  7. Липихина ЮА. Определение хромосомной локализации гена центромерного варианта гистона H3 в геноме ржи (Secale cereale L.). III (V) Всероссийская молодежная научно-практическая конференция "Перспективы развития и проблемы современной ботаники", 10–14 ноября 2014, Новосибирск

  8. Веряскина ЮА. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. IX конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 25 апреля 2014, Томск

  9. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  10. Колесников НН. Геном раковой клетки. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  11. Vershinin AV. Intensive recombinations have led to tandem repeat expansion and enlargement of rye subtelomeric heterochromatin. The 19th International Chromosome Conference. 2-6 September 2013, Bologna, Italy

  12. Колесников НН. Рак и микроРНК. VI Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых с международным участием "Цивьяновские чтения", 29-30 ноября 2013, Новосибирск

  13. Колесников НН. Разработка методов диагностики и типирования опухолей головного мозга на основе микроРНК. II Международный Форум "Инновации в медицине: основные проблемы и пути их решения. Высокотехнологичная медицина как элемент инновационной экономики", 22-23 марта 2013, Новосибирск

  14. Колесников НН. Дифференциальная экспрессия онкомикроРНК в опухолях головного мозга у человека. Международная конференция "Фундаментальные науки – медицине", 16-20 сентября 2013, Новосибирск

  15. Колесников НН. Рак, микроРНК и эволюция. Международная конференция Хромосома-2012,
    2-7 сентября 2012, Новосибирск

  16. Евтушенко ЕВ. Геномика и нуклеосомная организация субтеломерных районов хромосом ржи. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  17. Vershinin AV. Genomics of rye subtelomeric heterochromatin. 11th Gatersleben Research Conference "Chromosome biology, genome evolution, and speciation" 23-25 April 2012, Gatersleben, Germany

  18. Колесников НН. Эволюция половых хромосом и регуляторный потенциал Х-хромосомы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  19. Вершинин АВ. Молекулярная структура центромер. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  20. Vershinin AV. The genomics of the most abundant tandem repeat DNA families in the rye heterochromatin. Annual Main Meeting of the Society for Experimental Biology. Chromosome Organization and Cytogenomics, 30 June - 3 July 2010, Prague, Czech Republic

  21. Вершинин АВ. ЦУП (Центр Управления Поведением) хромосом: структурная организация и эволюция. Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных, 16-20 августа 2010, Новосибирск

  22. Евтушенко ЕВ. Молекулярная структура субтеломерного гетерохроматина ржи.
    I Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа - 6 сентября 2009, Новосибирск

  23. Колесников НН. Некодирующие регуляторные РНК Х-хромосомы млекопитающих. Происхождение и эволюция. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа - 6 сентября 2009, Новосибирск

  24. Kolesnikov NN. X-chromosome inactivation, mobile elements and ncRNA genes. 6th International Conference
    on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 22-28 June 2008, Novosibirsk, Russia

  25. Kolesnikov NN. Evolution of the structure of the XIST locus in mammals. 5th International Conference
    on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, 16-22 July 2006, Novosibirsk, Russia

Международное сотрудничество: 

  1. Институт генетики и селекции растений им. Лейбница, Гатерслебен, ФРГ
    Структура центромер у различных видов злаков

  2. Институт экспериментальной ботаники, Оломоуц, Чехия
    Структура центромер у различных видов злаков

Патенты: 

  1. Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  2. Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  3. Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  4. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  5. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)