Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif       Терлецкий Александр Витальевич нс кбн terletskyatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаб.    
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Титов Сергей Евгеньевич снс совм. кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна нс совм. кбн juliaveratmcb [dot] nsc [dot] ru
        Гунбин Константин Владимирович нс совм. кбн  
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совм. кбн  
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Иванов Михаил Константинович нс совм. кбн  
        Ковынев Игорь Борисович нс совм. кбн  
        Поспелова Татьяна Ивановна мнс совм.    
      eLIBRARY_logo.png Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм. кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совм.    
      eLIBRARY_logo.png Сердюкова Ольга Станиславона ст. лаб. совм.    
        Маслов Константин Анатольевич ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Veryaskina YuA, Titov SE, Kometova VV, Rodionov VV, Zhimulev IF. Intratumoral heterogeneity of expression of 16 miRNA in luminal cancer of the mammary gland. (doi: 10.3390/ncrna6020016) Non-Coding RNA 6(2): 16, 2020

  2. Титов СЕ, Анищенко ВВ, Полоз ТЛ, Веряскина ЮА, Архипова АА, Устинов СН. Возможности дифференциальной диагностики рака желудка и предраковых изменений слизистой желудка с помощью анализа экспрессии шести микроРНК. (doi: 10.18821/0869-2084-2020-65-2-131-136) Клиническая лабораторная диагностика 65(2): 131-136, 2020

  3. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Решетов ИВ, Веряскина ЮА, Важенин АВ, Гостимский АВ, Ипполитов ЛИ, Рогова МО. Стратификация риска рецидива папиллярного рака щитовидной железы на основании результатов молекулярно-генетических исследований. (doi: 10.17650/2222-1468-2020-10-1-93-100) Опухоли головы и шеи 10(1): 93–100, 2020

  4. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Агакишиев ММ, Забела АВ, Селиванов ВС, Мелихов СП, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ, Жимулёв ИФ. Профилирование экспрессии микроРНК в клетках острого проимелоцитарного лейкоза при различном кариотипе. (doi: 10.31857/S0041377120050077) Цитология 62(4): 250-257, 2020

  5. Evtushenko EV, Lipikhina YuA, Stepochkin PI, Vershinin AV. Cytogenetic and molecular characteristics of rye genome in octoploid triticale (× Triticosecale Wittmack). (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i4.39576) Comp Cytogenet 13(4): 423-434, 2019

  6. Сергийко СВ, Лукьянов СА, Титов СЕ, Веряскина ЮА. Молекулярно-генетическое тестирование в дифференциальной диагностике узловых образований щитовидной железы с цитологическим заключением фолликулярная опухоль Bethesda IV. (doi: 10.32000/2072-1757-2019-4-149-152) Практическая медицина 17(4): 149-152, 2019

  7. Titov SE, Ivanov MK, Demenkov PS, Katanyan GA, Kozorezova ES, Malek AV, Veryaskina YuA, Zhimulev IF. Combined quantitation of HMGA2 mRNA, microRNAs, and mitochondrial-DNA content enables the identification and typing of thyroid tumors in fine-needle aspiration smears. (doi: 10.1186/s12885-019-6154-7) BMC Cancer 19: 1010, 2019

  8. Kolesnikov NN, Veryaskina YuA, Titov SE, Rodionov VV, Gening TP, Abakumova TV, Kometova VV, Torosyan MKh, Zhimulev IF. Expression of micrornas in molecular genetic breast cancer subtypes. (doi: 10.1016/j.ctarc.2016.08.006) Cancer Treat Res Commun 20: 100026, 2019

  9. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ, Евтушенко ЕВ. Кровепаразитарная инфекция как причина возникновения воспалительных реакций и доброкачественных образований щитовидной железы человека. (doi: 10.15789/2220-7619-2019-1-155-161) Инфекция и иммунитет 9(1): 155-161, 2019

  10. Gatzkaya SS, Evtushenko EV. Patterns of nucleotide diversity for different domains of centromeric histone H3 (CENH3) gene in Secale L. (doi: 10.18699/VJ19.472) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 135-139, 2019

  11. Коробкина ЕА, Князева МС, Киль ЮВ, Титов СЕ, Малек АВ. Сравнительный анализ методов детекции микроРНК с помощью метода обратной транскрипции и количественной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР). (doi: 10.18821/0869-2084-2018-63-11-722-728) Клиническая лабораторная диагностика 63(11): 722-728, 2018

  12. Сердюкова ОС, Титов СЕ, Малахина ЕС, Рымар ОД. МикроРНК – перспективные молекулярные мар-керы обнаружения рака в узлах щитовидной железы. (doi: 10.14341/ket9774) Клиническая и экспериментальная тиреоидология 14(3): 140-148, 2018

  13. Lipikhina YuA, Evtushenko EV, Lyusikov OM, Gordei IS, Gordei IA, Vershinin AV. Dynamics of the centromeric histone CENH3 structure in rye-wheat amphidiploids (Secalotriticum). (doi: 10.1155/2018/2097845) BioMed Res Int 2018: 2097845, 2018

  14. Липихина ЮА, Евтушенко ЕВ, Люсиков ОМ, Гордей ИС, Гордей ИА, Вершинин АВ. Ржано-пшеничные амфидиплоиды секалотритикум — новая модель для изучения активности генов центромерного белка CENH3. Молекулярная и прикладная генетика 25: 15-23, 2018

  15. Ovsyannikova AK, Rymar OD, Ivanoshchuk DE, Mikhailova SV, Shakhtshneider EV, Orlov PS, Malakhina ES, Voevoda MI. A case of maturity onset diabetes of the young (MODY3) in a family with a novel HNF1A gene mutation in five generations. (doi: 10.1007/s13300-017-0350-8) Diabetes Ther 9(1): 413-420, 2018

  16. Ivanov MK, Titov SE, Glushkov SA, Dzyubenko VV, Malek AV, Arkhangelskaya PA, Samsonov RB, Mikhetko AA, Bakhidze EV, Berlev IV, Kolesnikov NN. Detection of high-grade neoplasia in air-dried cervical PAP smears by a microRNA-based classifier. (doi: 10.3892/or.2018.6214) Oncology Rep 39: 1099-1111, 2018 

  17. Торосян МХ, Родионов ВВ, Веряскина ЮА, Кометова ВВ, Шарафутдинов МГ. Значение изменения микро-РНК (Mir) в прогнозе рецедива рака молочной железы. (doi: 10.23648/UMBJ.2018.29.11362) Ульяновский медико-биологический журнал 1: 71-79, 2018

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2019-0003 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Жимулев ИФ

Гранты РФФИ

20-04-00699 (АААА-А20-120013090069-3) Нуклеосомная организация центромерного хроматина злаков: кооперация различных форм гистона Н3. Вершинин АВ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Gatzkaya SS, Evtushenko EV, Vershinin AV. Expression profile of two CENH3 genes in different tissues of the Secale cereale. (doi: 10.18699/ICG-PlantGen2019-78) Proceedings of the Fifth International Scientific Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology”, 24–29 June, 2019, Novosibirsk, pp. 238-240

  2. Evtushenko EV, Lipikhina YuA, Stepochkin PI, Vershinin AV. Chromosome constitution and activity of the centromeric histone H3 (CENH3) variants in octoploid triticale lines. (doi: 10.18699/ICG-PlantGen2019-79) Proceedings of the Fifth International Scientific Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology”, 24–29 June, 2019, Novosibirsk, pp. 241-243

  3. Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Елисафенко ЕА, Гацкая СС. Структура и эволюция центромерного гистона CENH3 у видов трибы Triticeae. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 680

  4. Serdyukova OS, Veryaskina YA, Titov SE, Malakhina ES, Rymar OD. MicroRNAs - molecular markers for detecting cancer in thyroid nodules. (doi: 10.29256/v.02.02.2018.escbm67) Biological Markers in Fundamental and Clinical Medicine 2(2): 77, 2018

  5. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Lyusikov OM, Gordei IA, Vershinin AV. Secalotriticum hybrids as a new model for studying the activity of genes encoding centromere-specific protein CENH3. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 45

  6. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Stepochkin PI, Vershinin AV. The CENH3 gene encoding centromere-specific histone H3: activity in Triticale. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 46

  7. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Shubert V, Houben A, Vershinin AV. Evolutionary dynamics of the centromeric histone CENH3 within the tribe Triticeae. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 20-21

  8. Ступак ЕВ, Титов СЕ, Ступак ВВ, Веряскина ЮА, Ахмерова ЛГ, Иванов МК, Жилулев ИФ, Колесников НН, Рабинович СС. МикроРНК как генетические маркеры в диагностике глиом головного мозга. Российский нейрохирургический журнал им. профессора АЛ Поленова X(S): 235, 2018

  9. Веряскина ЮА, Катанян ГА, Жимулев ИФ, Титов СЕ, Малек АВ, Козорезова ЕС, Шевченко СП, Иванов МК. Молекулярно-генетический анализ смывов с цитологических препаратов узлов щитовидной железы для повышения точности и информативности дооперационной диагностики. Материалы IV Петербургского международного онкологического форума. 2018, с. 173, ISBN 978-5-9908557-7-9

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  3. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  4. Колесников НН. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. XI съезд ассоциации клинических цитологов России, 9-12 октября 2015, Звенигород, Московская обл.

  5. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  6. Евтушенко ЕВ. The molecular structure and interspecies variation of CENH3 genes in the Secale genus. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  7. Веряскина ЮА. МикроРНК – тканеспецифичный маркер процессов метастазирования. Всероссийская конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 22 мая 2015, Томск

  8. Липихина ЮА. Определение хромосомной локализации гена центромерного варианта гистона H3 в геноме ржи (Secale cereale L.). III (V) Всероссийская молодежная научно-практическая конференция "Перспективы развития и проблемы современной ботаники", 10–14 ноября 2014, Новосибирск

  9. Веряскина ЮА. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. IX конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 25 апреля 2014, Томск

  10. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  11. Колесников НН. Геном раковой клетки. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

Патенты: 

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Памятный знак "За труд на благо города"

Вершинин АВ (2013)

Отдел регуляции генетических процессов