Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Ведущий научный сотрудник
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич внс / зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif       Терлецкий Александр Витальевич нс кбн terletskyatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаб.    
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Титов Сергей Евгеньевич снс совм. кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна нс совм. кбн juliaveratmcb [dot] nsc [dot] ru
        Гунбин Константин Владимирович нс совм. кбн  
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совм. кбн  
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Иванов Михаил Константинович нс совм. кбн  
        Ковынев Игорь Борисович нс совм. кбн  
        Поспелова Татьяна Ивановна мнс совм.    
      eLIBRARY_logo.png Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм. кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совм.    
      eLIBRARY_logo.png Сердюкова Ольга Станиславона ст. лаб. совм.    
        Маслов Константин Анатольевич ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Titov SE, Ivanov MK, Demenkov PS, Katanyan GA, Kozorezova ES, Malek AV, Veryaskina YuA, Zhimulev IF. Combined quantitation of HMGA2 mRNA, microRNAs, and mitochondrial-DNA content enables the identification and typing of thyroid tumors in fine-needle aspiration smears. (doi: 10.1186/s12885-019-6154-7) BMC Cancer 19: 1010, 2019

  2. Kolesnikov NN, Veryaskina YuA, Titov SE, Rodionov VV, Gening TP, Abakumova TV, Kometova VV, Torosyan MKh, Zhimulev IF. Expression of micrornas in molecular genetic breast cancer subtypes. (doi: 10.1016/j.ctarc.2016.08.006) Cancer Treat Res Commun 20: 100026, 2019

  3. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ, Евтушенко ЕВ. Кровепаразитарная инфекция как причина возникновения воспалительных реакций и доброкачественных образований щитовидной железы человека. (doi: 10.15789/2220-7619-2019-1-155-161) Инфекция и иммунитет 9(1): 155-161, 2019

  4. Gatzkaya SS, Evtushenko EV. Patterns of nucleotide diversity for different domains of centromeric histone H3 (CENH3) gene in Secale L. (doi: 10.18699/VJ19.472) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 135-139, 2019

  5. Коробкина ЕА, Князева МС, Киль ЮВ, Титов СЕ, Малек АВ. Сравнительный анализ методов детекции микроРНК с помощью метода обратной транскрипции и количественной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР). (doi: 10.18821/0869-2084-2018-63-11-722-728) Клиническая лабораторная диагностика 63(11): 722-728, 2018

  6. Сердюкова ОС, Титов СЕ, Малахина ЕС, Рымар ОД. МикроРНК – перспективные молекулярные мар-керы обнаружения рака в узлах щитовидной железы. (doi: 10.14341/ket9774) Клиническая и экспериментальная тиреоидология 14(3): 140-148, 2018

  7. Lipikhina YuA, Evtushenko EV, Lyusikov OM, Gordei IS, Gordei IA, Vershinin AV. Dynamics of the centromeric histone CENH3 structure in rye-wheat amphidiploids (Secalotriticum). (doi: 10.1155/2018/2097845) BioMed Res Int 2018: 2097845, 2018

  8. Липихина ЮА, Евтушенко ЕВ, Люсиков ОМ, Гордей ИС, Гордей ИА, Вершинин АВ. Ржано-пшеничные амфидиплоиды секалотритикум — новая модель для изучения активности генов центромерного белка CENH3. Молекулярная и прикладная генетика 25: 15-23, 2018

  9. Ovsyannikova AK, Rymar OD, Ivanoshchuk DE, Mikhailova SV, Shakhtshneider EV, Orlov PS, Malakhina ES, Voevoda MI. A case of maturity onset diabetes of the young (MODY3) in a family with a novel HNF1A gene mutation in five generations. (doi: 10.1007/s13300-017-0350-8) Diabetes Ther 9(1): 413-420, 2018

  10. Ivanov MK, Titov SE, Glushkov SA, Dzyubenko VV, Malek AV, Arkhangelskaya PA, Samsonov RB, Mikhetko AA, Bakhidze EV, Berlev IV, Kolesnikov NN. Detection of high-grade neoplasia in air-dried cervical PAP smears by a microRNA-based classifier. (doi: 10.3892/or.2018.6214) Oncology Rep 39: 1099-1111, 2018 

  11. Торосян МХ, Родионов ВВ, Веряскина ЮА, Кометова ВВ, Шарафутдинов МГ. Значение изменения микро-РНК (Mir) в прогнозе рецедива рака молочной железы. (doi: 10.23648/UMBJ.2018.29.11362) Ульяновский медико-биологический журнал 1: 71-79, 2018

  12. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Elisafenko EA, Vershinin AV. Chromosomal assignment of centromere-specific histone CENH3 genes in rye (Secale cereale L.) and their phylogeny. (doi: 10.3897/CompCytogen.v11i4.19953) Comp Cytogenet 11(4): 821-832, 2017

  13. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Houben A, Vershinin AV. Conserved molecular structure of the centromeric histone CENH3 in Secale and its phylogenetic relationships. (doi: 10.1038/s41598-017-17932-8) Sci Reports 7: 17628, 2017

  14. Гордей ИА, Люсиков ОМ, Гордей ИС, Шимко ВЕ, Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Липихина ЮА. Молекулярно-генетические основы создания нового генофонда ржи и ржано-пшеничных амфидиплоидов секалотрикум. Молекулярная и прикладная генетика, Сборник научных трудов Института генетики и цитологии НАН Беларуси 23: 26-39, 2017

  15. Архангельская ПА, Самсонов РБ, Штам ТА, Князева МС, Иванов МК, Титов СЕ, Колесников НН, Бахидзе ЕВ, Берлев ИВ, Михетько АА, Воробьев СЛ, Малек АВ. Оценка экспрессии 4 микроРНК в цитологических препаратах в качестве дополнительного метода диагностики рака шейки матки. Опухоли женской репродуктивной системы 13(3), 63-72, 2017

  16. Самсонов РБ, Бурдаков ВС, Штам ТА, Раджабова ЗА, Чебуркин ЮВ, Васильев ДА, Цырлина ЕВ, Титoв СЕ, Иванов МК, Филатов МВ, Берштейн ЛМ, Колесников НН, Малек АВ. Метод дифференциальной диагностики узловых заболеваний щитовидной железы: анализ комбинации микроРНК (миРНК-21, -181а и -146а). Опухоли головы и шеи 7(2): 16-24, 2017

  17. Malek A, Sleptsov I, Cheburkin Y, Samsonov R, Kolesnikov N. miRNA as potential tool for thyroid cancer diagnostics and follow up: practical considerations. JSM Thyroid Disord Manag 2(1): 1007, 2017

  18. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. (doi:  10.2174/1389202917666160512164913) Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2019-0003 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Жимулев ИФ

Гранты РФФИ

17-04-00748 (АААА-А17-117042010012-9) Особенности молекулярной структуры центромерного гистона Н3 ржи, пшеницы и их аллополиплоидных гибридов. Вершинин АВ

18-54-00013 Динамика молекулярной организации центромер, индуцируемая стрессом отдаленной гибридизации у хлебных злаков. Вершинин АВ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Елисафенко ЕА, Гацкая СС. Структура и эволюция центромерного гистона CENH3 у видов трибы Triticeae. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 680

  2. Serdyukova OS, Veryaskina YA, Titov SE, Malakhina ES, Rymar OD. MicroRNAs - molecular markers for detecting cancer in thyroid nodules. (doi: 10.29256/v.02.02.2018.escbm67) Biological Markers in Fundamental and Clinical Medicine 2(2): 77, 2018

  3. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Lyusikov OM, Gordei IA, Vershinin AV. Secalotriticum hybrids as a new model for studying the activity of genes encoding centromere-specific protein CENH3. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 45

  4. Lipikhina YA, Evtushenko EV, Stepochkin PI, Vershinin AV. The CENH3 gene encoding centromere-specific histone H3: activity in Triticale. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 46

  5. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Shubert V, Houben A, Vershinin AV. Evolutionary dynamics of the centromeric histone CENH3 within the tribe Triticeae. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 20-21

  6. Ступак ЕВ, Титов СЕ, Ступак ВВ, Веряскина ЮА, Ахмерова ЛГ, Иванов МК, Жилулев ИФ, Колесников НН, Рабинович СС. МикроРНК как генетические маркеры в диагностике глиом головного мозга. Российский нейрохирургический журнал им. профессора АЛ Поленова X(S): 235, 2018

  7. Веряскина ЮА, Катанян ГА, Жимулев ИФ, Титов СЕ, Малек АВ, Козорезова ЕС, Шевченко СП, Иванов МК. Молекулярно-генетический анализ смывов с цитологических препаратов узлов щитовидной железы для повышения точности и информативности дооперационной диагностики. Материалы IV Петербургского международного онкологического форума. 2018, с. 173, ISBN 978-5-9908557-7-9

  8. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Lipikhina YA, Houben A, Vershinin AV. Characterization of the centromeric histone H3 (CENH3) in genus Secale and its phylogenetic relationships. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 214

  9. Stolyar M, Klimova O, Ivanov M, Gorbenko A, Titov S, Olkhovskiy I. JAK2 haplotype 46/1 (GGCC) has no effect on the primary risk of JAK2 V617F mutation, but it strongly potentiates the progression of grown allele burden in myeloproliferative neoplasms. Haematologica 102 (s2): 539, 2017

  10. Stupak EV, Veryaskina YA, Titov SE, Achmerova LG, Stupak VV, Dolzhenko DA, Rabinovich SS, Narodov AA, Ivanov MK, Zhimulev IF, Kolesnikov NN. Studying the MicroRNA role as a survival predictor and revealing its part in malignancy level determination in patients with supratentorial gliomas of brain. (doi: 10.1063/1.5001652) AIP Conf Proc 1882: 020073, 2017

  11. Ступак ЕВ, Титов СЕ, Ступак ВВ, Веряскина ЮА, Ахмерова ЛГ, Иванов МК, Жимулев ИФ, Пустаханов ВВ, Петрова ЮВ, Колесников НН. Исследование микроРНК как прогностических маркеров типирования глиом головного мозга человека и степени их злокачественности. Российский нейрохирургический журнал им. профессора АЛ Поленова IX(S): 236, 2017

  12. Сердюкова ОС, Веряскина ЮА. Молекулярно-генетический анализ в диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. Актуальные вопросы фундаментальной и клинической онкологии, Томск, с. 114-116, 2017, ISBN 978-5-7511-2483-0

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  3. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  4. Колесников НН. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. XI съезд ассоциации клинических цитологов России, 9-12 октября 2015, Звенигород, Московская обл.

  5. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  6. Евтушенко ЕВ. The molecular structure and interspecies variation of CENH3 genes in the Secale genus. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  7. Веряскина ЮА. МикроРНК – тканеспецифичный маркер процессов метастазирования. Всероссийская конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 22 мая 2015, Томск

  8. Липихина ЮА. Определение хромосомной локализации гена центромерного варианта гистона H3 в геноме ржи (Secale cereale L.). III (V) Всероссийская молодежная научно-практическая конференция "Перспективы развития и проблемы современной ботаники", 10–14 ноября 2014, Новосибирск

  9. Веряскина ЮА. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. IX конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 25 апреля 2014, Томск

  10. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  11. Колесников НН. Геном раковой клетки. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

Патенты: 

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Памятный знак "За труд на благо города"

Вершинин АВ (2013)

Отдел регуляции генетических процессов