Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Терлецкий Александр Витальевич нс кбн terletskyatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна мнс    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаб.    
        Гришко Екатерина Олеговна ст. лаб.    
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Титов Сергей Евгеньевич снс совм. кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна нс совм. кбн juliaveratmcb [dot] nsc [dot] ru
        Гунбин Константин Владимирович нс совм. кбн  
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совм. кбн  
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Иванов Михаил Константинович нс совм. кбн  
        Ковынев Игорь Борисович нс совм. кбн  
      eLIBRARY_logo.png Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм. кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совм.    
      eLIBRARY_logo.png Сердюкова Ольга Станиславона ст. лаб. совм.    
        Маслов Константин Анатольевич ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Titov SE, Kozorezova ES, Demenkov PS, Veryaskina YA, Kuznetsova IV, Vorobyev SL, Chernikov RA, Sleptsov IV, Timofeeva NI, Ivanov MK. Preoperative typing of thyroid and parathyroid tumors with a combined molecular classifier. (doi: 10.3390/cancers13020237) Cancers 13(2): 237, 2021

  2. Ордиянц ИМ, Куулар АА, Ямурзина АА, Новгинов ДС, Титов СЕ, Гусейнова РГ, Груздева ЕО. Патогенетические механизмы развития гиперплазии эндометрия в репродуктивном возрасте. (doi: 10.20953/1726-1678-2020-5-44-50) Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии 19(5): 44–50, 2020

  3. Анищенко ВВ, Титов СЕ, Полоз ТЛ, Веряскина ЮА, Архипова АА, Бубнов ИВ. Динамический скрининг предраковых состояний пищевода с помощью молекулярно-генетического анализа. (doi: 10.21294/1814-4861-2020-19-6-38-45) Сибирский онкологический журнал 19(6): 38-45, 2020

  4. Титов СЕ, Катанян ГА, Полоз ТЛ, Измайлова ЛГ, Зенцова ОА, Дряева ЛГ, Анищенко ВВ. Дооперационное выявление метастазов папиллярного и медуллярного рака щитовидной железы в шейных лимфатических узлах с помощью молекулярного классификатора. (doi: org/10.17650/2222-1468-2020-10-4-50-59) Опухоли головы и шеи 10(4): 50-59, 2020

  5. Kovynev IB, Titov SE, Ruzankin PS, Agakishiev MM, Veryaskina YA, Nedel’ko VM, Pospelova TI, Zhimulev IF. Profiling 25 bone marrow microRNAs in acute leukemias and secondary nonleukemic hematopoietic conditions. (doi: 10.3390/biomedicines8120607) Biomedicines 8(12): 607, 2020

  6. Ellis THN, Vershinin AV. Retrotransposons and the evolution of genome size in Pisum. (doi: 10.3390/biotech9040024) BioTech 9(4): 24, 2020

  7. Titov S, Demenkov PS, Lukyanov SA, Sergiyko SV, Katanyan GA, Veryaskina YA, Ivanov MK. Preoperative detection of malignancy in fine-needle aspiration cytology (FNAC) smears with indeterminate cytology (Bethesda III, IV) by a combined molecular classifier. (doi: 10.1136/jclinpath-2020-206445) J Clin Pathol 73(11): 722-727, 2020

  8. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Веряскина ЮА. Перспективы использования молекулярно-генетических панелей в дооперационной дифференциальной диагностике узловых образований щитовидной железы. (doi: 10.18484/2305-0047.2020.3.284) Новости хирургии 28(3): 284-289, 2020

  9. Королева АГ, Евтушенко ЕВ, Вершинин АВ, Зайцева ЕП, Тимошкин ОА, Кирильчик СВ. Возрастная динамика длины теломерной ДНК у эндемичных планарий озера Байкал. (doi: 10.31857/S0026898420040072) Мол Биология 54(4): 616-625, 2020

  10. Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF. The miRNA profile in non-Hodgkin’s lymphoma patients with secondary myelodysplasia. (doi: 10.3390/cells9102318) Cells 9(10): 2318, 2020

  11. Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF. Prognostic markers of myelodysplastic syndromes. (doi: 10.3390/medicina56080376) Medicina 56(8): 376, 2020

  12. Бушманова ГМ, Зорина ИГ, Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. "Новый" клинический феномен XX–XXI вв. – первично хронический септический эндокардит – как аргумент против диагноза "ревматизм". (doi: 10.18565/therapy.2020.2.34-45) Терапия 2: 34-45, 2020

  13. Veryaskina YuA, Titov SE, Kometova VV, Rodionov VV, Zhimulev IF. Intratumoral heterogeneity of expression of 16 miRNA in luminal cancer of the mammary gland. (doi: 10.3390/ncrna6020016) Non-Coding RNA 6(2): 16, 2020

  14. Титов СЕ, Анищенко ВВ, Полоз ТЛ, Веряскина ЮА, Архипова АА, Устинов СН. Возможности дифференциальной диагностики рака желудка и предраковых изменений слизистой желудка с помощью анализа экспрессии шести микроРНК. (doi: 10.18821/0869-2084-2020-65-2-131-136) Клиническая лабораторная диагностика 65(2): 131-136, 2020

  15. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Решетов ИВ, Веряскина ЮА, Важенин АВ, Гостимский АВ, Ипполитов ЛИ, Рогова МО. Стратификация риска рецидива папиллярного рака щитовидной железы на основании результатов молекулярно-генетических исследований. (doi: 10.17650/2222-1468-2020-10-1-93-100) Опухоли головы и шеи 10(1): 93–100, 2020

  16. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Агакишиев ММ, Забела АВ, Селиванов ВС, Мелихов СП, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ, Жимулёв ИФ. Профилирование экспрессии микроРНК в клетках острого проимелоцитарного лейкоза при различном кариотипе. (doi: 10.31857/S0041377120050077) Цитология 62(4): 250-257, 2020

  17. Evtushenko EV, Lipikhina YuA, Stepochkin PI, Vershinin AV. Cytogenetic and molecular characteristics of rye genome in octoploid triticale (× Triticosecale Wittmack). (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i4.39576) Comp Cytogenet 13(4): 423-434, 2019

  18. Сергийко СВ, Лукьянов СА, Титов СЕ, Веряскина ЮА. Молекулярно-генетическое тестирование в дифференциальной диагностике узловых образований щитовидной железы с цитологическим заключением фолликулярная опухоль Bethesda IV. (doi: 10.32000/2072-1757-2019-4-149-152) Практическая медицина 17(4): 149-152, 2019

  19. Titov SE, Ivanov MK, Demenkov PS, Katanyan GA, Kozorezova ES, Malek AV, Veryaskina YuA, Zhimulev IF. Combined quantitation of HMGA2 mRNA, microRNAs, and mitochondrial-DNA content enables the identification and typing of thyroid tumors in fine-needle aspiration smears. (doi: 10.1186/s12885-019-6154-7) BMC Cancer 19: 1010, 2019

  20. Kolesnikov NN, Veryaskina YuA, Titov SE, Rodionov VV, Gening TP, Abakumova TV, Kometova VV, Torosyan MKh, Zhimulev IF. Expression of micrornas in molecular genetic breast cancer subtypes. (doi: 10.1016/j.ctarc.2016.08.006) Cancer Treat Res Commun 20: 100026, 2019

  21. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ, Евтушенко ЕВ. Кровепаразитарная инфекция как причина возникновения воспалительных реакций и доброкачественных образований щитовидной железы человека. (doi: 10.15789/2220-7619-2019-1-155-161) Инфекция и иммунитет 9(1): 155-161, 2019

  22. Gatzkaya SS, Evtushenko EV. Patterns of nucleotide diversity for different domains of centromeric histone H3 (CENH3) gene in Secale L. (doi: 10.18699/VJ19.472) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 135-139, 2019

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0246-2021-0014 Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Гранты РФФИ

20-04-00699 (АААА-А20-120013090069-3) Нуклеосомная организация центромерного хроматина злаков: кооперация различных форм гистона Н3. Вершинин АВ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Титов СЕ, Иванов МК, Веряскина ЮА, Деменков ПС, Шевченко СП, Катанян ГА, Лукьянов СА. Выявление злокачественных опухолей щитовидной железы в мазках с неопределенным цитологическим заключением с помощью молекулярного классификатора. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 112

  2. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Воронцова ЕВ, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 270

  3. Gatzkaya SS, Evtushenko EV, Vershinin AV. Expression profile of two CENH3 genes in different tissues of the Secale cereale. (doi: 10.18699/ICG-PlantGen2019-78) Proceedings of the Fifth International Scientific Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology”, 24–29 June, 2019, Novosibirsk, pp. 238-240

  4. Evtushenko EV, Lipikhina YuA, Stepochkin PI, Vershinin AV. Chromosome constitution and activity of the centromeric histone H3 (CENH3) variants in octoploid triticale lines. (doi: 10.18699/ICG-PlantGen2019-79) Proceedings of the Fifth International Scientific Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology”, 24–29 June, 2019, Novosibirsk, pp. 241-243

  5. Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Елисафенко ЕА, Гацкая СС. Структура и эволюция центромерного гистона CENH3 у видов трибы Triticeae. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 680

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Веряскина ЮА. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020", 25-28 июня 2020, Санкт-Петербург

  2. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Вершинин АВ. Структура центромер и эволюция. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  4. Титов СЕ. МикроРНК - молекулярные маркеры онкологических заболеваний. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  5. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  6. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  7. Колесников НН. Молекулярные технологии в цитологической диагностике материала пункционной биопсии узловых образований щитовидной железы. XI съезд ассоциации клинических цитологов России, 9-12 октября 2015, Звенигород, Московская обл.

  8. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  9. Евтушенко ЕВ. The molecular structure and interspecies variation of CENH3 genes in the Secale genus. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  10. Веряскина ЮА. МикроРНК – тканеспецифичный маркер процессов метастазирования. Всероссийская конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 22 мая 2015, Томск

  11. Липихина ЮА. Определение хромосомной локализации гена центромерного варианта гистона H3 в геноме ржи (Secale cereale L.). III (V) Всероссийская молодежная научно-практическая конференция "Перспективы развития и проблемы современной ботаники", 10–14 ноября 2014, Новосибирск

  12. Веряскина ЮА. Профилирование экспрессии микроРНК в диагностике плоскоклеточного рака головы и шеи. IX конференция молодых ученых-онкологов "Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии", 25 апреля 2014, Томск

  13. Вершинин АВ. Молекулярная эволюция: есть ли у случая логика? Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  14. Колесников НН. Геном раковой клетки. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

  • John Innes Centre, Norwich, UK
    Мобильные элементы гороха

Патенты: 

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Памятный знак "За труд на благо города"

Вершинин АВ (2013)

Отдел регуляции генетических процессов