Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной цитогенетики

Жимулев Игорь Федорович
Заведующий отделом
Заведующий лабораторией

Curriculum vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Жимулев Игорь Федорович зав. лаб. дбн zhimulevatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Похолкова Галина Витальевна внс дбн galinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Колесникова Татьяна Дмитриевна внс дбн kolesnikovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Демакова Ольга Викторовна внс кбн demakovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Коряков Дмитрий Евгеньевич внс кбн koryakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Зыкова Татьяна Юрьевна внс кбн vatolinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Антоненко Оксана Викторовна нс кбн ovantatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Хорошко Варвара Андреевна мнс кбн vicernaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Мальцева Мария Витальевна ст. лаб.-иссл.    
        Гатауллин Никита Константинович ст. лаб.-иссл.    
        Довгань Виктория Викторовна ст. лаб.   dovganatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Веселова Ольга Валерьевна ст. лаб.    
        Графодатская Виктория Евгеньевна ст. лаб.   vikaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Долбак Евгения Александровна ст. лаб.   eugenyatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Татаринов Михаил Васильевич инженер совм.    
        Сафонкина Мария Викторовна ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Беляева Елена Сергеевна, дбн
Гончаров Фёдор Павлович
Иванов Роман Артемович
Колодяжная Александра Владимировна
Макунин Игорь Васильевич, кбн
Мошкин Юрий Михайлович, кбн		 Нерушева (Кокоза) Елена Борисовна, кбн
Семешин Валерий Федорович, дбн
Скворцова Татьяна Эвальдовна
Шмакова Маргарита Алексеевна
Шулуткова Алена Евгеньевна
 

Направления исследований: 
  • Организация хроматина в интерфазных хромосомах
  • Гетерохроматин
  • Политенные хромосомы в питающих клетках ооцитов
BDGP_logo.jpg

Сотрудники лаборатории участвовали в создании Release 6 reference sequence of the Drosophila melanogaster genome

 

ПУБЛИЧНЫЕ ЛЕКЦИИ:

knowledge__logo.jpg Могу ли я изменить свой эпигенотип.
Лекция кбн Колесниковой ТД для Российского общества “Знание”
you_tube.jpg Борьба с эпидемиями в России.
Публичная лекция академика ИФ Жимулева
you_tube.jpg Эпигенетика и полифенизм насекомых.
Публичная лекция кбн ТД Колесниковой
you_tube.jpg Эпигенетика. Новая парадигма?
Публичная лекция кбн ТД Колесниковой

Публикации: 

  1. Романов СЕ, Шлома ВВ, Коряков ДЕ, Белякин СН, Лактионов ПП. Инсуляторный белок Cp190 регулирует экспрессию генов дифференцировки сперматоцитов в клетках мужского зародышевого пути Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0026898423010147) Молекулярная биология 57(1): 109-123, 2023
    Romanov SE, Shloma VV, Koryakov DE, Belyakin SN, Laktionov PP. Insulator protein CP190 regulates expression оf spermatocyte differentiation genes in Drosophila melanogaster male germline. Mol Biol, 2022, doi: 10.1134/S0026893323010120

  2. Kolesnikova TD, Pokholkova GV, Dovgan VV, Zhimulev IF, Schubert V. Super-resolution microscopy reveals stochastic initiation of replication in Drosophila polytene chromosomes. (doi: 10.1007/s10577-021-09679-w) Chromosome Res 30(4): 361-383, 2022

  3. Kolesnikova TD, Klenov MS, Nokhova AR, Lavrov SA, Pokholkova GV, Schubert V, Maltseva SV, Cook KR, Dixon MJ, Zhimulev IF. A spontaneous inversion of the X chromosome heterochromatin provides a tool for studying the structure and activity of the nucleolus in Drosophila melanogaster. (doi: 10.3390/cells11233872) Cells 11(23): 3872, 2022

  4. Veryaskina YA, Titov SE, Zhimulev IF. Reference genes for qPCR-based miRNA expression profiling in 14 human tissues. (doi: 10.1159/000524283) Med Princ Pract 31: 322-332, 2022

  5. Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF. The profile of microRNA expression in bone marrow in non-Hodgkin’s lymphomas. (doi: 10.3390/diagnostics12030629) Diagnostics 12(3): 629, 2022

  6. Veryaskina YuA, Titov SE, Ivanov MK, Ruzankin PS, Tarasenko AS, Shevchenko SP, Kovynev IB, Stupak EV, Pospelova TI, Zhimulev IF. Selection of reference genes for quantitative analysis of microRNA expression in three different types of cancer. (doi: 10.1371/journal.pone.0254304) PLoS ONE 17(2): e0254304, 2022

  7. Das S, Caballero M, Kolesnikova T, Zhimulev I, Koren A, Nordman J. Replication timing analysis in polyploid cells reveals Rif1 uses multiple mechanisms to promote underreplication in Drosophila. (doi: 10.1093/genetics/iyab147) Genetics 219(3): iyab147, 2021

  8. Andreyenkova NG, Karyakin IV, Starikov IJ, Sauer-Gürth H, Literák I, Andreyenkov OV, Shnayder EP, Bekmansurov RH, Alexeyenko MN, Wink M, Zhimulev IF. Phylogeography and demographic history of the black kite Milvus migrans, a widespread raptor in Eurasia, Australia and Africa. (doi: 10.1111/jav.02822) J Avian Biol 52(10): e02822, 2021 

  9. Zykova T, Maltseva M, Goncharov F, Boldyreva L, Pokholkova G, Kolesnikova T, Zhimulev I. The organization of pericentromeric heterochromatin in polytene chromosome 3 of the Drosophila melanogaster line with the Rif11; SuURES Su(var)3-906 mutations suppressing underreplication. (doi: 10.3390/cells10112809) Cells 10(11): 2809, 2021

  10. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ковынев ИБ, Федорова СС, Поспелова ТИ, Жимулёв ИФ. микроРНК при миелодиспластическом синдроме. (doi: 10.32607/actanaturae.11209) Acta Naturae 13(2): 4-15, 2021

  11. de Jong TV, Guryev V, Moshkin YM. Estimates of gene ensemble noise highlight critical pathways and predict disease severity in H1N1, COVID-19 and mortality in sepsis patients. (doi: 10.1038/s41598-021-90192-9) Sci Rep 11: 10793, 2021

  12. Sabirov M, Kyrchanova O, Pokholkova GV, Bonchuk A, Klimenko N, Belova E, Zhimulev IF, Maksimenko O, Georgiev P. Mechanism and functional role of the interaction between CP190 and the architectural protein Pita in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1186/s13072-021-00391-x) Epigenetics Chromatin 14: 16, 2021

  13. Kalashnikova DA, Maksimov DA, Romanov SE, Laktionov PP, Koryakov DE. SetDB1 and Su(var)3-9 play non-overlapping roles in somatic cell chromosomes of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1242/jcs.253096) J Cell Sci 134(2): jcs253096, 2021

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0014 (122011400181-7) Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Гранты РНФ

19-14-00051-П (продление на 2022-2023) Функционирование генома в составе интерфазных хромосом дрозофилы и ржи. Жимулев ИФ

23-24-00114 (123020400041-5) Гистон метилтрансферазы дрозофилы Su(var)3-9 и SetDB1 в процессах развития и дифференцировки. Коряков ДЕ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Жимулев ИФ, Зыкова ТЮ, Левицкий ВГ, Цуканов АВ. Развитие идеи Н.К. Кольцова о структуре междисков политенных хромосом Drosophila. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 43-44

  2. Демаков СА, Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Шварц МБ, Тихомиров СА, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Применение систем направленного редактирования генома в изучении структурнофункциональной организации интерфазных хромосом Drosophila. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 39

  3. Зыкова ТЮ, Мальцева МВ, Похолкова ГВ, Веряскина ЮА, Лаврик ОИ, Жимулев ИФ. Продукты генов «домашнего хозяйства» участвуют в формировании черных дисков политенных хромосом Drosophila. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 48

  4. Колесникова ТД, Довгань ВВ, Похолкова ГВ, Шуберт Ф. Взаимосвязь между особенностями инициации репликации и транскрипционной активностью в политенных хромосомах Drosophila melanogaster. III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. Научные труды. Том 2. с. 11. ISBN 978-5-00189-678-4 М.: Издательство "Перо", 2021, 313 с. 

  5. Kolesnikova TD, Schubert V, Pokholkova GV, Dovgan VV. Structured illumination microscopy reveals the replication initiation dynamics in Drosophila polytene chromosomes. 62nd A Dros Res Conf 2021. 226A. USA (online) 

  6. Шальнова МА, Андреенкова НГ, Карякин ИВ, Шнайдер ЕП, Жимулев ИФ. Разработка морфометрических формул для полевого определения пола птенцов некоторых хищных птиц в Алтае-Саянском регионе. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 108-111. ISBN: 978-5-907349-09-4

  7. Андреенкова НГ, Андреенков ОВ, Карякин ИВ, Стариков ИЮ, Литерак И, Винк М, Жимулев ИФ. Распространение и демографическая история подвидов черного коршуна. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 126-129. ISBN: 978-5-907349-09-4

  8. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулев ИФ, Урусов ЛВ. Гнездование соколообразных и совообразных в искусственных гнездовьях в Новосибирской области. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 283-287. ISBN: 978-5-907349-09-4

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Жимулев ИФ. Развитие идеи НК Кольцова о структуре междисков политенных хромосом Drosophila. Юбилейная конференция "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века". 3-8 октября 2022, Москва 

  2. Зыкова ТЮ. Продукты генов “домашнего хозяйства” участвуют в формировании черных дисков политенных хромосом Drosophila. Юбилейная конференция "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века". 3-8 октября 2022, Москва

  3. Колесникова ТД. Взаимосвязь между особенностями инициации репликации и транскрипционной активностью в политенных хромосомах Drosophila melanogaster. III Объединенный научный форум/ VII Съезд биохимиков, молекулярных биологов и физиологов России, 3-7 октября 2022, Сочи

  4. Колесникова ТД. Исследование репликационной динамики в политенных хромосомах слюнных желез при помощи микроскопии сверхвысокого разрешения. Международная конференция "Дрозофила в генетике и медицине", 30 сентября – 2 октября 2020, Гатчина, Ленинградская область

  5. Kolesnikova T. The organization of replication in Drosophila polytene chromosomes. 14th International conference on Drosophila heterochromatin, 9-15 June 2019, Spoleto, Italy

  6. Kolesnikova T. Ultrastructural investigation of early replication in Drosophila polytene chromosomes. 26th Wilhelm Bernhard Workshop, 20-23 May 2019, Dijon, France

  7. Zhimulev IF. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  8. Kolesnikova TD. Spatial-temporal organization of replication in polytene chromosomes of Drosophila. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  9. Koryakov DE. Genome-wide analysis of Su(var)3-9 distribution in chromosomes of Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

Доклады за предыдущие годы ​

Международное сотрудничество: 

  • The University of California, Berkeley, CA, USA
    Исследование прицентромерного гетерохроматина дрозофилы

  • Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов

  • Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Halle, Germany
    Исследование прицентромерного гетерохроматина дрозофилы

  • Università di Roma “Sapienza”, Italy
    Исследование прицентромерного гетерохроматина дрозофилы

  • Universidad Autónoma de Madrid, Spain
    Исследование прицентромерного гетерохроматина дрозофилы

  • Harvard University, Boston, MA, USA
    Исследование системы дозовой компенсации дрозофилы

  • Department of Molecular Biology, Umeå University, Umeå, Sweden
    Молекулярная организация хромосомы 4 дрозофилы

  • University of Veterinary and Pharmaceutical Science, Brno, Czech Republic
    Молекулярная генетика птиц

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Микроскопия сверхвысокого разрешения

Патенты: 

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Гончаров ФП, Болдырева ЛВ, Демакова ОВ, Жимулев ИФ. Программа для ЭВМ HMM4Band. Свидетельство №2014618888. Зарегистрирована в Государственном реестре программ для ЭВМ 01.09.2014

Награды: 

Государственные награды

Медаль ордена “За заслуги перед Отечеством” I степени

Жимулев ИФ (2022)

Медаль ордена “За заслуги перед Отечеством” II степени

Беляева ЕС (1999)

Жимулев ИФ (2008)

Звание “Заслуженный деятель науки Российской Федерации”

Беляева ЕС (2007)

Государственная премия Российской Федерации

Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Семешин ВФ (2002)

Премия РАН имени НК Кольцова

Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Семешин ВФ (2000)

Похолкова ГВ (2021)

Премия Президиума СО АН СССР

Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Семешин ВФ (1984)

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Коряков ДЕ (2002)

Колесникова ТД (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Коряков ДЕ (1999)

Колесникова ТД (2008)

Зыкова ТЮ (2012)

Императорский и Царский Орден Святого Станислава 3 степени

Жимулев ИФ (2012) (фото) (фото)

Медаль Минобрнауки РФ
“За безупречный труд и отличие” III степени 

Коряков ДЕ (2021)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Зыкова ТЮ (2012)

Памятная медаль в честь 60-летия СО РАН

Жимулев ИФ (2017)

Юбилейная медаль “80 лет Новосибирской области”

Жимулев ИФ, Беляева ЕС (2017)

Памятный знак "За труд на благо города"

Беляева ЕС (2013)

Жимулев ИФ (2003, 2013)

Коряков ДЕ (2003, 2023)

Похолкова ГВ (2013)

Семешин ВФ (2013)

Шмакова МА (2013)

Почетная грамота СО РАН

Коряков ДЕ (2007)

Отдел регуляции генетических процессов