Лаборатория клеточного деления

Пиндюрин Алексей Валерьевич
Заведующий лабораторией

Curriculum vitae

thomson_logo.gif ResearcherID
scopus_logo.jpg Scopus
Google Scholar
eLIBRARY_logo.png eLIBRARY.RU

Состав лаборатории: 

Лаборатория клеточного деления была создана 1 мая 2014 года для выполнения работы по гранту Правительства Российской Федерации (мегагрант №14.Z50.31.0005)

В январе 2017 года в состав лаборатории перешли сотрудники Лаборатории генетики клеточного цикла

        ФИО Должность Ученая
степень
Контакты
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Пиндюрин Алексей Валерьевич зав. лаб. кбн a [dot] pindyurinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Лебедева Лидия Ивановна снс дбн lilatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреева Евгения Николаевна снс кбн andreevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Болдырева Лидия Валерьевна снс кбн asdatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Омелина Евгения Сергеевна снс кбн omelinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Копыл Сергей Александрович нс кбн kopylatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Дубатолова Татьяна Дмитриевна нс   tdubatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Иванкина Елена Андреевна мнс   zotkevichatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Яринич Любовь Александровна мнс   l [dot] yarinichatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Иванкин Антон Вадимович ст. лаб.-иссл.   anton [dot] ivankinatgmail [dot] com
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Галимова Юлия Александровна ст. лаб.-иссл.    
      eLIBRARY_logo.png Павлова Гера Алексеевна ст. лаб.-иссл.   gera [dot] pavlovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Андерс (Мунзарова) Алина Фирдинантовна ст. лаб.-иссл.   alina [dot] munzarovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
      eLIBRARY_logo.png Разуваева Алена Викторовна ст. лаб.-иссл.   alena [dot] razuvaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Лещенко Анна Евгеньевна ст. лаб.-иссл.    
      eLIBRARY_logo.png Лебедев Михаил Олегович ст. лаборант   m [dot] lebedevatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Лепехина Татьяна Константиновна ст. лаборант    
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Огиенко Анна Александровна мнс совместитель кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кожевникова Елена Николаевна мнс совместитель кбн  
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Попова Юлия Владимировна ст. лаб.-иссл. совместитель   popovaatmcb [dot] nsc [dot] ru

Бывшие сотрудники

Киселева Елена Владимировна, кбн
Струнов Антон Александрович, кбн

Направления исследований: 
  1. Разработка новых методов для анализа роста микротрубочек, направляемых кинетохором
  2. Поиск и функциональная характеристика новых белков, необходимых для роста микротрубочек, направляемых кинетохором
  3. Функциональный анализ эволюционно высоко-консервативных гомологов белков дрозофилы, контролирующих митоз, в культуре клеток человека

Научно-популярное изложение результатов исследований:

Часы для хроматина
Сложное деление на два
Процесс удвоения ДНК может регулироваться и на стадии элонгации
Основные результаты работы по мегагранту (№14.Z50.31.0005)

Публикации за последние 5 лет: 

  1. Ilyin AA, Ryazansky SS, Doronin SA, Olenkina OM, Mikhaleva EA, Yakushev EY, Abramov YA, Belyakin SN, Ivankin AV, Pindyurin AV, Gvozdev VA, Klenov MS, Shevelyov YY. Piwi interacts with chromatin at nuclear pores and promiscuously binds nuclear transcripts in Drosophila ovarian somatic cells. Nucleic Acids Res 45(13): 7666-7680, 2017

  2. Renda F, Pellacani C, Strunov A, Bucciarelli E, Naim V, Bosso G, Kiseleva E, Bonaccorsi S, Sharp DJ, Khodjakov A, Gatti M, Somma MP. The Drosophila orthologue of the INT6 oncoprotein regulates mitotic microtubule growth and kinetochore structure. PLoS Genet 13(5): e1006784, 2017

  3. Andreyeva EN, Bernardo TJ, Kolesnikova TD, Lu X, Yarinich LA, Bartholdy BA, Guo X, Posukh OV, Healton S, Willcockson MA, Pindyurin AV, Zhimulev IF, Skoultchi AI, Fyodorov DV. Regulatory functions and chromatin loading dynamics of linker histone H1 during endoreplication in Drosophila. Genes Dev 31: 603-616, 2017

  4. Майор ТЮ, Галимова ЮА, Шевелева НГ, Суханова ЛВ, Кирильчик СВ. Молекулярно-филогенетический анализ представителей родов Diacyclops и Acanthocyclops (Copepoda: Cyclopoida) из озера Байкал. Генетика 53(2): 233-239, 2017

  5. Omelyanchuk LV, Munzarova AF. Theoretical model of mitotic spindle microtubule growth for FRAP curve interpretation. BMC Syst Biol 11(Suppl 1): 3, 2017

  6. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

  7. Пиндюрин АВ. Геномное картирование белков хроматина при помощи модификации Daminv FLP-зависимого метода DamID. Доклады Академии наук 472: 222-225, 2017

  8. Renda F, Pellacani C, Strunov A, Bucciarelli E, Naim V, Bosso G, Kiseleva E, Bonaccorsi S, Sharp DJ, Khodjakov A, Gatti M, Somma MP. The Drosophila orthologue of the INT6 onco-protein regulates mitotic microtubule dynamics
    and kinetochore structure. Mol Biol Cell 27(25): 3947 (P204), 2016

  9. Strunov A, Boldyreva LV, Pavlova GA, Pindyurin AV, Gatti M, Kiseleva E. A simple and effective method for ultrastructural analysis of mitosis in Drosophila S2 cells. MethodsX 3: 551-559, 2016

  10. Тетерина ВИ, Галимова ЮА, Шевелева НГ, Суханова ЛВ, Майор ТЮ, Зайцева АН, Кирильчик СВ. Простой и эффективный метод оценки размера диминуций хроматина у циклопов с использованием ПЦР в режиме реального времени. Генетика 52: 1327-1331, 2016

  11. Андреева ЕН, Иванкин АВ, Кожевникова ЕН, Павлова ГА, Разуваева АВ, Пиндюрин АВ. Исследование функций консервативного белка CG17337 у Drosophila melanogaster. Acta Naturae S-2: 68, 2016

  12. Павлова ГА, Попова ЮВ, Мунзарова АФ, Галимова ЮА, Разуваева АВ, Ренда Ф, Сомма МП, Пиндюрин АВ, Гатти М. Факторы, обусловливающие характер повторного роста микротрубочек веретена деления после деполимеризации тубулина у Drosophila melanogaster. Acta Naturae S-2: 70, 2016

  13. Попова ЮВ, Павлова ГА, Мунзарова АФ, Разуваева АВ, Ренда Ф, Сомма МП, Пиндюрин АВ, Гатти М. Исследование генетического контроля кинетохор-зависимого роста микротрубочек в культуре клеток S2 Drosophila melanogaster при помощи РНК-интерференции. Acta Naturae S-2: 71, 2016

  14. Munzarova A, Popova J, Razuvaeva A, Shloma V, Gatti M, Omelyanchuk L. Accurate measurement of poleward microtubule flux in the spindle of Drosophila S2 cells. Cell Biol Int 40: 984-990, 2016

  15. Pindyurin AV, Pagie L, Kozhevnikova EN, van Arensbergen J, van Steensel B. Inducible DamID systems for genomic mapping of chromatin proteins in Drosophila. Nucleic Acids Res 44: 5646-5657, 2016

  16. Демакова ОВ, Болдырева ЛВ, Демаков СА, Гончаров ФП, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Характеристика хроматина тонких дисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 58: 248-252, 2016

  17. Andreyeva EN, Pechkovsky EV, Pindyurin AV, Gatti M. Pathways of spindle formation in Drosophila mitotic and meiotic cells. Цитология 58: 295-298, 2016

  18. Pavlova GA, Galimova YuA, Popova YuV, Munzarova AF, Razuvaeva AV, Alekseeva AL, Berkaeva MB, Pindyurin AV, Somma MP, Gatti M, Renda F. Factors governing the pattern of spindle microtubule regrowth after tubulin depolymerization. Цитология 58: 299-303, 2016

  19. Жимулев ИФ, Болдырева ЛВ, Демакова ОВ, Похолкова ГВ, Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Лавров СА, Беляева ЕС. Формирование дисков политенных хромосом из интронов генов у дрозофилы. Доклады Акад Наук 466(5): 607–610, 2016

  20. Pindyurin AV, Gatti M. Chromosomes in the taiga. Chromosome Res 23: 641-647, 2015

  21. Мариловцева ЕВ, Дубатолова ТД, Галимова ЮА, Копыл СА, Омельянчук ЛВ. Исследование клеточной локализации Hrs и других маркеров эндосом в сперматогенезе Drosophila melanogaster с помощью химерных GFP-конструктов. Цитология 57: 509-517, 2015

  22. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Levitsky VG, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster.  (doi: 10.1007/s10577-014-9447-3) Chromosome Res 23: 409-410, 2015

  23. Pindyurin AV, de Jong J, Akhtar W. TRIP through the chromatin: a high throughput exploration of enhancer regulatory landscapes. Genomics 106: 171–177, 2015

  24. Yarinich LA, Burakova EA, Zakharov BA, Boldyreva EV, Babkina IN, Tikunova NV, Silnikov VN. Synthesis and structure-activity relationship of novel 1,4-Diazabicyclo[2.2.2]octane derivatives as potent antimicrobial agents. Eur J Med Chem 95: 563–573, 2015

  25. Hoskins RA,... Demakova OV, Andreyeva EN, Boldyreva LV,... Zhimulev IF,... Celniker SE. The Release 6 reference sequence of the Drosophila melanogaster genome. Genome Res 25: 445-458, 2015

  26. Pokholkova GV, Koryakov DE, Pindyurin AV, Kozhevnikova EN, Belyakin SN, Andreyenkov OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of SUUR and HP1 proteins results in delayed replication of euchromatic regions in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 124: 209-220, 2015

  27. Bgatova N, Dubatolova T, Omelyanchuk L, Plyusnina E, Shaposhnikov M, Moskalev A. Gadd45 expression correlates with age dependent neurodegeneration in Drosophila melanogasterBiogerontology 16: 53-61, 2015

  28. Palchikova IG, Ivankina EA, Semeshin VF, Omelyanchuk LV, Zhimulev IF, Smirnov ES. DNA Feulgen cytophotometry and chromatin diminution. In: International Multidisciplinary Microscopy Congress: Proceedings of InterM, Antalya, Turkey, October 10-13, 2013 (eds. Polychroniadis EK, Oral AY, Ozer M). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, pp 233-239, 2014

  29. Nordman JT, Kozhevnikova EN, Verrijzer CP, Pindyurin AV, Andreyeva EN, Shloma VV, Zhimulev IF, Orr-Weaver TL. DNA copy-number control through inhibition of replication fork progression. Cell Reports 9: 841–849, 2014

  30. Akhtar W, Pindyurin AV, de Jong J, Pagie L, ten Hoeve J, Berns A, Wessels LFA, van Steensel B, van Lohuizen M. Using TRIP for genome-wide position effect analysis in cultured cells. Nature Protocols 9: 1255–1281, 2014

  31. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. PLoS ONE 9(7): e101631, 2014

  32. Похолкова ГВ, Коряков ДЕ, Пиндюрин АВ, Андреенков ОВ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Искусственное привлечение гетерохроматиновых белков SUUR и HP1 в районы открытого хроматина приводит к замедлению движения репликационной вилки. Цитология 56: 677, 2014

  33. Шевелев ЮЯ, Оленкина ОМ, Абрамов ЮА, Пиндюрин АВ, Максимов ДА, Белякин СН. Построение карт контакта хромосом с ядерной ламиной в герминальных клетках самцов Drosophila melanogaster. Цитология 56: 690, 2014

  34. Дубатолова ТД, Копыл СА, Омельянчук ЛВ. Сплайсинг-факторы как позиционные регуляторы клеточного цикла в тканях дрозофилы. Цитология 56: 654, 2014

  35. Kolesnikova TD, Posukh OV, Andreyeva EN, Bebyakina DS, Ivankin AV, Zhimulev IF. Drosophila SUUR protein associates with PCNA and binds chromatin in a cell cycle-dependent manner. Chromosoma 122: 55-66, 2013

  36. Kopyl SA, Omelyanchuk LV. A dose-sensitive modifier of the of Drosophila melanogaster ectopic eye. Cent Eur J Biol 8: 252-258, 2013

  37. Dubatolova TD, Volkova EI, Omelyanchuk LV. Drosophila splicing factor SF2 knock-down mutant shows altered cell cycle in vivo. Cell Biol Int 37: 187-190, 2013

  38. Копыл СА, Дубатолова ТД, Волкова ЕИ, Омельянчук ЛВ. Генетические модификаторы формирования эктопического глаза на крыле у Drosophila melanogaster. Цитология и Генетика 47 (4): 19-28, 2013

  39. Лебедева ЛИ, Дубатолова ТД, Омельянчук ЛВ. Аномалии митоза в имагинальных дисках Drosophila melanogaster, несущих сайленсирующий конструкт опухолевого супрессора dlg. Цитология 55: 406-413, 2013

  40. Плюснина ЕН, Шапошников МВ, Андреева ЕН, Москалев АА, Омельянчук ЛВ. Особенности кривой выживания у Drosophila melanogaster со сверхэкспрессией гена D-GADD45. Вавиловский журнал генетики и селекции 17 (3): 399-403, 2013

  41. Копыл СА, Омельянчук ЛВ, Шапошников МВ, Москалев АА. Исследование роли генов опухолевой супрессии в механизмах старения и долголетия на модели Drosophila melanogaster. Вавиловский журнал генетики и селекции 17 (3): 207-211, 2013

  42. Лактионов ПП, Максимов ДА, Андреева ЕН, Шлома ВВ, Белякин СН. Генетическая система для мечения соматических и герминальных клеточных линий в гонадах Drosophila melanogaster. Цитология 55: 185-189, 2013

  43. Копыл СА, Дубатолова ТД, Мариловцева EВ, Омельянчук ЛВ. Роль гена hrs в формировании крыла Drosophila melanogaster. Генетика 48: 1039-1045, 2012

  44. Dolgova EV, Proskurina AS, Nikolin VP, Popova NA, Alyamkina EA, Orishchenko KE, Rogachev VA, Efremov YR, Dubatolova TD, Prokopenko AV, Chernykh ER, Ostanin AA, Taranov OS, Omigov VV, Zagrebelniy SN, Bogachev SS, Shurdov MA. “Delayed death” phenomenon: a synergistic action of cyclophosphamide and exogenous DNA. Gene 495: 134-145, 2012

Действующие гранты: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2016-0005 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Пиндюрин АВ

Гранты РНФ

16-14-10288 (номер гос. регистрации АААА-А16-116062950043-1) Мультиплексный анализ влияния эффекта положения и процесса терминации транскрипции на активность генов у эукариот. Пиндюрин АВ

Гранты РФФИ

16-04-01598 (номер гос. регистрации 116021860021) Исследование функций консервативного белка CG17337, ассоциированного с регулирующим скорость репликации ДНК белком SUUR у Drosophila melanogaster. Пиндюрин АВ

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Pindyurin A. Efficient delivery of transgenes to cultured Drosophila cells. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  2. Pindyurin AV. Cell type-specific mapping of genomic binding sites of chromatin proteins using FLP-inducible DamID systems in Drosophila. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  3. Boldyreva LV. A point deletion in a region immediately downstream of GFP reporter 3′ UTR increases level of GFP transcription in mouse and human cells two-fold. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  4. Yarinich LA. Adaptation of the piggyBac transposon system to study position effects in cultured Drosophila cells. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  5. Munzarova AF. Measuring microtubule flux using the modification of a standard photobleaching-based method. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  6. Razuvaeva AV. Analysis of the involvement of kinesin-like proteins in cell division of Drosophila S2 cells. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  7. Popova JV. Role of Eb1, Mars, Mast and Mei-38 proteins in kinetochore-driven microtubule growth in Drosophila S2 cells. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  8. Pavlova GA. Role of the minus-end binding proteins in kinetochore-driven microtubule growth. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  9. Пиндюрин АВ. Современные методы обнаружения и исследования регуляторных последовательностей ДНК. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  10. Разуваева АВ. Изучение роли белков Klp67A и Mast в процессе кинетохор-зависимого роста микротрубочек у Drosophila melanogaster. XII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Перспективы развития фундаментальных наук", 21-24 апреля 2015, Томск

  11. Мунзарова АФ. Визуализация межполярных микротрубочек веретена деления клеток дрозофилы при помощи метода FRAP. 19 Международная пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука 21 века", 20-24 апреля 2015, Пущино

  12. Павлова ГА. Поиск белков, участвующих в кинетохор-зависимом росте микротрубочек у Drosophila melanogaster. 19 Международная пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука 21 века", 20-24 апреля 2015, Пущино

  13. Пиндюрин АВ. Множественный параллельный функциональный анализ регуляторов генной активности. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  14. Pindyurin AV. A TRIP through the genome: a high-throughput method to study the influence of chromatin context on gene regulation. 10th Dutch Chromatin Meeting. 24 October 2012, Amsterdam, Netherlands

  15. Андреева ЕН. Белки “чёрного” хроматина в овариях и раннем эмбриогенезе дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  16. Дубатолова ТД. Эффект мутаций опухолевого супрессора Merlin на пролиферацию и дифференцировку клеток крыла Drosophila melanogaster. II Международная конференция “Дрозофила в экспериментальной генетике и биологии, 6-10 сентября 2010, Одесса, Украина

  17. Зоткевич ЕА. Реорганизация генома и динамика теломерных повторов в ходе диминуции хроматина у циклопов. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  18. Болдырева ЛВ. Картирование прицентромерного гетерохроматина Drosophila melanogaster с использованием политенных хромосом двойных мутантов SuURES Su(var)3-906. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  19. Andreyeva EN. The SUUR protein affects late replicating chromatin domains in Drosophila melanogaster. Meeting on Eukaryotic DNA replication and genome maintenance, 5-9 September 2007, Cold Spring Harbor, New York, USA

Международное сотрудничество: 

  1. Albert Einstein College of Medicine, New York, USA
    Functions and chromatin loading dynamics of linker histone H1
  2. Università di Roma “Sapienza”, Roma, Italy 
    Механизмы кинетохор-зависимого образования микротрубочек у Drosophila
  3. The Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands 
    Влияние локального хроматинового окружения на функциональную активность промоторных элементов
    Применение метода TRIP для анализа функционирования энхансерных элементов генома
  4. Department of Biochemistry and Molecular Biology, Mayo Clinic, Rochester, USA 
    Идентификация районов генома, контактирующих с внутренней ядерной оболочкой в клетках слюнных желез Drosophila
  5. Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, USA 
    Регуляция процесса удвоения ДНК на стадии продвижения реплисомы
Патенты: 

Шляхова ЕВ, Булушева ЛГ, Окотруб АВ, Гурова ОВ, Омельянчук ЛВ, Дубатолова ТД, Окотруб КА, Суровцев НВ. Способ детекции проникновения углеродных нанотрубок в биологическую ткань. Патент на изобретение №2582286. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 30.03.2016

Награды: 

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Андреева ЕН (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Андреева ЕН (2007)

Пиндюрин АВ (2009)

Национальная премия Л'Ореаль-ЮНЕСКО при поддержке РАН “Для женщин в науке”

Болдырева ЛВ (2013)