Отдел регуляции генетических процессов

Лаборатория клеточного деления

Пиндюрин Алексей Валерьевич
Заведующий лабораторией

Curriculum vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Пиндюрин Алексей Валерьевич зав. лаб. кбн a [dot] pindyurinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреева Евгения Николаевна снс кбн andreevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Болдырева Лидия Валерьевна снс кбн asdatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Омелина Евгения Сергеевна снс кбн omelinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Огиенко Анна Александровна снс кбн ogienko [dot] annaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Копыл Сергей Александрович нс кбн kopylatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Дубатолова Татьяна Дмитриевна нс   tdubatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Яринич Любовь Александровна мнс   l [dot] yarinichatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Попова Юлия Владимировна мнс   popovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Галимова Юлия Александровна ст. лаб.-иссл.   galimovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Разуваева Алена Викторовна ст. лаб.-иссл.   alena [dot] razuvaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Летягина Анна Евгеньевна ст. лаб.-иссл.   leschenko [dot] annaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Юшкова Анастасия Александровна ст. лаб.-иссл.   a [dot] yushkovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Федорова Юлия Антоновна ст. лаб.-иссл.    
        Моторина Дарья Максимовна ст. лаб.    
        Волегов Григорий Алексеевич ст. лаб.    
        Лепехина Татьяна Константиновна ст. лаб.    
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кожевникова Елена Николаевна снс совм. кбн  
        Морозова Марьяна Владимировна нс совм. кбн  
        Ачасова Ксения Михайловна мнс совм.    
        Сайдакова Снежанна Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Шерстобитова Наталья Юрьевна ст. лаб. совм.    
        Фахрутдинова Алена Игоревна ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Андерс (Мунзарова) Алина Фирдинантовна
Иванкин Антон Вадимович
Иванкина (Зоткевич) Елена Андреевна
Киселева Елена Владимировна, кбн
Лебедев Михаил Олегович
Лебедева Лидия Ивановна, дбн
Мальцева Светлана Вадимовна
Ощепкова (Алексеева) Анастасия Леонидовна
Павлова Гера Алексеевна, кбн
Струнов Антон Александрович, кбн

Направления исследований: 
  • Разработка новых методов для анализа роста микротрубочек, направляемых кинетохором
  • Поиск и функциональная характеристика новых белков, необходимых для роста микротрубочек, направляемых кинетохором
  • Функциональный анализ эволюционно высоко-консервативных гомологов белков дрозофилы, контролирующих митоз, в культуре клеток человека
BDGP_logo.jpg

Сотрудники лаборатории участвовали в создании Release 6 reference sequence of the Drosophila melanogaster genome

Механизмы кинетохор-зависимого образования микротрубочек у Drosophila
(грант Правительства РФ №14.Z50.31.0005)

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Часы для хроматина
Сложное деление на два
Процесс удвоения ДНК может регулироваться и на стадии элонгации

Публикации: 

  1. Dorogova NV, Galimova YA, Bolobolova EU, Baricheva EM, Fedorova SA. Loss of Drosophila E3 ubiquitin ligase Hyd promotes extra mitosis in germline cysts and massive cell death during oogenesis. (doi: 10.3389/fcell.2020.600868) Front Cell Dev Biol 8: 600868, 2020

  2. Дорогова НВ, Хрущева АС, Галимова ЮА, Ощепков ДЮ, Маслов ДЕ, Шведкина ЕД, Ахметова КА, Фёдорова СА. Миграцию клеток зародышевой линии в раннем эмбриогенезе Drosophila melanogaster негативно регулируют окружающие соматические клетки. (doi: 10.18699/VJ20.644) Вавиловский журнал генетики и селекции 24(5): 525-532, 2020

  3. Ogienko AA, Andreyeva EN, Omelina ES, Oshchepkova AL, Pindyurin AV. Molecular and cytological analysis of widely-used Gal4 driver lines for Drosophila neurobiology. (doi: 10.1186/s12863-020-00895-7) BMC Genetics 21: 96, 2020

  4. Ogienko AA, Yarinich LA, Fedorova EV, Dorogova NV, Bayborodin SI, Baricheva EM, Pindyurin AV. GAGA regulates border cell migration in Drosophila. (doi: 10.3390/ijms21207468) Int J Mol Sci 21(20): 7468, 2020

  5. Ritter GS, Nikolin VP, Popova NA, Proskurina AS, Kisaretova PE, Taranov OS, Dubatolova TD, Dolgova EV, Potter EA, Kirikovich SS, Efremov YaR, Bayborodin SI, Romanenko MV, Meschaninova MI, Venyaminova AG, Kolchanov NA, Shurdov MA, Bogachev SS. Characterization of biological peculiarities of the radioprotective activity of double-stranded RNA isolated from Saccharomyces сerevisiae. (doi: 10.1080/09553002.2020.1793020Int J Radiat Biol 96(9): 1173-1191, 2020

  6. Somma MP, Andreyeva EN, Pavlova GA, Pellacani C, Bucciarelli E, Popova JV, Bonaccorsi S, Pindyurin AV, Gatti M. Moonlighting in mitosis: analysis of the mitotic functions of transcription and splicing factors. (doi: 10.3390/cells9061554) Cells 9(6): 1554, 2020

  7. Kisaretova PE, Kirikovich SS, Ritter GS, Efremov YR, Taranov OS, Dubatolova TD, Proskurina AS, Potter EA, Dolgova EV, Sidorov SV, Ostanin AA, Chernych ER, Bogachev SS. Approbation of the cancer treatment approach based on the eradication of TAMRA+ cancer stem cells in a model of murine cyclophosphamide resistant lymphosarcoma. (doi: 10.21873/anticanres.14011) Anticancer Res 40(2): 795-805, 2020

  8. Demakova OV, Demakov SA, Boldyreva LV, Zykova TYu, Levitsky VG, Semeshin VF, Pokholkova GV, Sidorenko DS, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes. (doi: 10.1007/s00412-019-00728-2Chromosoma 129(1): 25-44, 2020

  9. Borisova MA, Snytnikova OA, Litvinova EA, Achasova KM, Babochkina TI, Pindyurin AV, Tsentalovich YuP, Kozhevnikova EN. Fucose ameliorates tryptophan metabolism and behavioral abnormalities in a mouse model of chronic colitis. (doi: 10.3390/nu12020445) Nutrients 12(2): 445, 2020

  10. Ogienko AG, Stoporev AS, Ogienko AA, Mel'gunov MS, Adamova TP, Yunoshev AS, Manakov AY, Boldyreva EV. Discrepancy between thermodynamic and kinetic stabilities of the tert-butanol hydrates and its implication for obtaining pharmaceutical powders by freeze-drying. (doi: 10.1039/c9cc00397e) Chem Commun 55(29): 4262-4265, 2019

  11. Pavlova GA, Popova JV, Andreyeva EN, Yarinich LA, Lebedev MO, Razuvaeva AV, Dubatolova TD, Oshchepkova AL, Pellacani C, Somma MP, Pindyurin AV, Gatti M. RNAi-mediated depletion of the NSL complex subunits leads to abnormal chromosome segregation and defective centrosome duplication in Drosophila mitosis. (doi: 10.1371/journal.pgen.1008371) PLoS Genet 15(9): e1008371, 2019

  12. Omelina ES, Ivankin AV, Letiagina AE, Pindyurin AV. Optimized PCR conditions minimizing the formation of chimeric DNA molecules from MPRA plasmid libraries. (doi: 10.1186/s12864-019-5847-2) BMC Genomics 20 (Suppl 7): 536, 2019

  13. Pavlova GA, Razuvaeva AV, Popova JV, Andreyeva EN, Yarinich LA, Lebedev MO, Pellacani C, Bonaccorsi S, Somma MP, Gatti M, Pindyurin AV. The role of Patronin in Drosophila mitosis. (doi: 10.1186/s12860-019-0189-0) BMC Mol Cell Biol 20 (Suppl 1): 7, 2019

  14. Gisler S, Gonçalves JP, Akhtar W, de Jong J, Pindyurin AV, Wessels LFA, van Lohuizen M. Multiplexed Cas9 targeting reveals genomic location effects and gRNA-based staggered breaks influencing mutation efficiency. (doi: 10.1038/s41467-019-09551-w) Nature Communications 10: 1598, 2019

  15. Omelina ES, Pindyurin AV. Optogenetic regulation of endogenous gene transcription in mammals. (doi: 10.18699/VJ19.485) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 219-225, 2019

  16. Lebedev MO, Yarinich LA, Ivankin AV, Pindyurin AV. Generation of barcoded plasmid libraries for massively parallel analysis of chromatin position effects. (doi: 10.18699/VJ19.483) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 203-211, 2019

  17. Andreyeva EN, Ogienko AA, Yushkova AA, Popova JV, Pavlova GA, Kozhevnikova EN, Ivankin AV, Gatti M, Pindyurin AV. Non3 is an essential Drosophila gene required for proper nucleolus assembly. (doi: 10.18699/VJ19.481) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 190-198, 2019

  18. Andreyeva EN, Ogienko AA, Dubatolova TD, Oshchepkova AL, Kozhevnikova EN, Ivankin AV, Pavlova GA, Kopyl SA, Pindyurin AV. A toolset to study functions of Cytosolic non-specific dipeptidase 2 (CNDP2) using Drosophila as a model organism. (doi: 10.1186/s12863-019-0726-z) BMC Genetics 20(Suppl 1): 31, 2019

  19. Fedorova EV, Dorogova NV, Bolobolova EU, Fedorova SA, Karagodin DA, Ogienko AA, Khruscheva AS, Baricheva EM. GAGA protein is required for multiple aspects of Drosophila oogenesis and female fertility. (doi: 10.1002/dvg.23269) Genesis 57(2): e23269, 2019 

  20. Ogienko AG, Markov AV, Sen'kova AV, Logashenko EB, Salomatina OV, Myz SA, Ogienko AA, Nefedov AA, Losev EA, Drebushchak TN, Salakhutdinov NF, Boldyrev VV, Vlasov VV, Zenkova MA, Boldyreva EV. Increasing bioavailability of very poorly water-soluble compounds. A case study of an anti-tumor drug, soloxolon methyl. (doi: 10.1016/j.jddst.2018.10.025J Drug Delivery Sci Tech 49: 35-42, 2019

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2019-0005 Регуляция генной активности и эпигенетической наследственности. Белякин СН

Гранты РНФ

20-74-00137 Оптогенетический контроль локализации эндогенных белков. Омелина ЕС

20-74-10022 Механизмы регуляции динамики цитоскелета при развитии воспаления и формировании защитного барьера кишки на мышиных моделях хронического колита. Кожевникова ЕН

16-14-10288 (период 2019-2020) Мультиплексный анализ влияния эффекта положения и процесса терминации транскрипции на активность генов у эукариот. Пиндюрин АВ

Гранты РФФИ

20-14-50398 Эффект положения гена: роль локального окружения в регуляции активности генов. Болдырева ЛВ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Maltseva SV, Omelina ES, Popova JV, Pavlova GA, Yarinich LA, Razuvaeva AV, Yushkova AA, Ogienko AA, Pindyurin AV, Andreyeva EN. Conservative mitotic localization and functions of the nucleolar RPF2/Non3 protein in human and Drosophila cells. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-140) The 12th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology". Abstract book (ISBN 978-5-91291-051-7). Novosibirsk, 2020, p. 221-222

  2. Юшкова АА, Андреева ЕН, Огиенко АА, Попова ЮВ, Пиндюрин АВ. Белок Non3 (Novel Nucleolar protein 3) необходим для формирования прицентромерного гетерохроматина Drosophila melanogaster. II межвузовская студенческая конференция "Студенческий биохимический форум - 2020". Материалы конференции (ISBN 978-5-9500298-8-2). Москва, 2020, с. 49

  3. Boldyreva LV, Leschenko AE, Omelina ES, Ivankin AV, Yarinich LA, Kozhevnikova EN, Pindyurin AV. Large-scale screening for gene expression regulatory DNA motifs located downstream transcription termination sites. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 8-9

  4. Razuvaeva AV, Pavlova GA, Popova JV, Andreyeva EN, Gatti M, Pindyurin AV. The role of Patronin in the process of kinetochore-driven microtubule formation in Drosophila S2 cells. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 16-17

  5. Yushkova АА, Andreyeva ЕN, Ogienko АА, Popova JV, Pindyurin AV. Novel Nucleolar protein 3 is essential for Drosophila pericentric heterochromatin formation. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 38-39

  6. Болдырева ЛВ, Омелина ЕС, Летягина АЕ, Иванкин АВ, Яринич ЛА, Лебедев МО, Кожевникова ЕН, Пиндюрин АВ. Поиск нуклеотидных мотивов, регулирующих процесс терминации транскрипции. Acta Naturae Спецвыпуск I (Том 2): 11, 2019

  7. Андреева ЕН, Огиенко АА, Павлова ГА, Пиндюрин АВ. Роль консервативного белка CNDP2 у Drosophila melanogaster. Acta Naturae Спецвыпуск I (Том 2): 92-93, 2019

  8. Pavlova GA, Popova JV, Andreyeva EN, Yarinich LA, Lebedev MO, Razuvaeva AV, Dubatolova TD, Oshchepkova AL, Pellacani C, Somma MP, Pindyurin AV, Gatti M. Multiple function of the NSL complex subunits in Drosophila mitosis. Acta Naturae Спецвыпуск I (Том 2): 95, 2019

  9. Popova JV, Pavlova GA, Ogienko AA, Andreyeva EN, Yushkova AA, Pindyurin AV. Towards understanding the role of nucleolar NON3 protein in Drosophila mitosis. Acta Naturae Спецвыпуск I (Том 2): 99, 2019

  10. Razuvaeva AV, Pavlova GA, Popova JV, Andreyeva EN, Gatti M, Pindyurin AV. The role of Patronin in mitotic spindle formation in Drosophila S2 cells. Acta Naturae Спецвыпуск I (Том 2): 99, 2019

  11. Пиндюрин АВ, Болдырева ЛВ, Иванкин АВ, Летягина АЕ, Омелина ЕС, Яринич ЛА, Лебедев МО, Кожевникова ЕН. Широкомасштабный поиск нуклеотидных мотивов, регулирующих процесс терминации транскрипции у млекопитающих. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 103

  12. Лубяга ЮА, Яринич ЛА, Дроздова ПБ, Люкенбах Т, Тимофеев МА. Изучение P-гликопротеина байкальских эндемичных амфипод в культивируемых клетках S2 дрозофилы. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 481

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Болдырева ЛВ. Поиск нуклеотидных мотивов, регулирующих процесс терминации транскрипции. IX Российский симпозиум "Белки и пептиды". 1-6 октября 2019, Сочи-Дагомыс

  2. Болдырева ЛВ. Широкомасштабный поиск нуклеотидных мотивов, регулирующих процесс терминации транскрипции у млекопитающих. VII съезд ВОГиС, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, 18-22 июня 2019, Санкт-Петербург

  3. Pavlova G. The role of Drosophila NSL complex in centromere/kinetochore assembly. 14th International conference on Drosophila heterochromatin, 9-15 June 2019, Spoleto, Italy

  4. Pindyurin AV. Input of DNA sequences located in the transcription termination region in gene expression level. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  5. Ogienko AA. The influence of genetic background in Drosophila fly lines on results on example of line №6458 from Bloomington Drosophila Stock Center. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  6. Pavlova GA. Roles of Drosophila NSL complex components in mitosis. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  7. Popova JV. The moonlighting functions of the NON3 protein in Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  8. Andreyeva EN. The CG17337 protein is involved in mitosis progression and control the cell death in Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  9. Andreyeva E. Functional characterization of the conservative protein CG17337 in Drosophila melanogaster. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  10. Pindyurin A. Large fraction of heterochromatin in Drosophila neurons is simultaneously bound by B-type lamin and HP1a. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  11. Дубатолова ТД. Визуализация углеродных нанотрубок в тканях личинок Drosophila melanogaster с помощью репортеров теплового шока. Всероссийская конференция "Дрозофила в генетике и медицине", 4-6 октября 2017, Санкт-Петербург

  12. Pindyurin A. Efficient delivery of transgenes to cultured Drosophila cells. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Università di Roma “Sapienza”, Roma, Italy 
    Механизмы кинетохор-зависимого образования микротрубочек у Drosophila (2014 – н. вр.)
    Роль белкового комплекса NSL/KANSL в процессе митоза у дрозофилы и человека (2017 – н. вр.)

  • The Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands
    Особенности гетерохроматина в специализированных клеточных типах дрозофилы (2017 – 2018)
    Влияние локального хроматинового окружения на функциональную активность промоторных элементов (2014-2016)
    Применение метода TRIP для анализа функционирования энхансерных элементов генома (2015) 

  • Ludwig-Maximilians-University Munich, Germany
    Динамика взаимодействия белка-репрессора Polycomb с геномом дрозофилы при развитии крыловых имагинальных дисков (2017 – 2018)

  • Virginia Polytechnic Institute and State University, Blacksburg, VA, USA
    Особенности взаимодействия генома с внутренней ядерной оболочкой в клетках дрозофилы при нокдауне белка Lamin B (2017 – н. вр.)

  • Albert Einstein College of Medicine, New York, NY, USA
    Functions and chromatin loading dynamics of linker histone H1 (2016 – н. вр.)

  • Department of Biochemistry and Molecular Biology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA 
    Идентификация районов генома, контактирующих с внутренней ядерной оболочкой в клетках слюнных желез Drosophila (2014-2015)

  • Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA 
    Регуляция процесса удвоения ДНК на стадии продвижения реплисомы (2014)

  • Department of Molecular Biology, Umeå University, Umeå, Sweden
    Применение технологии мультиплексирования репортёрных конструкций для исследования механизмов эпигенетической регуляции экспрессии генов, осуществляемой белками группы Polycomb (2020)

Патенты: 

Шляхова ЕВ, Булушева ЛГ, Окотруб АВ, Гурова ОВ, Омельянчук ЛВ, Дубатолова ТД, Окотруб КА, Суровцев НВ. Способ детекции проникновения углеродных нанотрубок в биологическую ткань. Патент на изобретение №2582286. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 30.03.2016

Награды: 

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Андреева ЕН (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Андреева ЕН (2007)

Пиндюрин АВ (2009)

Национальная премия Л'Ореаль-ЮНЕСКО при поддержке РАН “Для женщин в науке”

Болдырева ЛВ (2013)