Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория хромосомной инженерии

Демаков Сергей Анатольевич
И.о. заведующего лабораторией

Curriculum Vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Демаков Сергей Анатольевич и.о. зав. лаб. дбн demakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Волкова Елена Игоревна снс кбн volkatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Зыкова Татьяна Юрьевна снс кбн vatolinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенкова Наталья Григорьевна снс кбн anataatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенков Олег Владимирович нс   andreenkovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Шварц Мария Борисовна мнс   berkaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Сидоренко Дарья Сергеевна ст. лаб.-иссл.   demidova [dot] dariaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Силютина Наталья Юрьевна ст. лаб.    
        Корнеева Любовь Алексеевна ст. лаб.    

Бывшие сотрудники:

Гончарова Алла Анатольевна
Николаев Дмитрий Алексеевич
Панкова Татьяна Евгеньевна
Попова Ольга Олеговна
Прудникова Мария Максимовна

Направления исследований: 
  • Молекулярно-генетическая организация междисков политенных хромосом
  • Механизмы, обеспечивающие декомпактное состояние и функционирование междисков
  • Генетические факторы, вовлеченные в регуляцию высших уровней организации интерфазного хроматина

Публикации: 

  1. Literák I, Skyrpan M, Andreyenkova NG. A mixed pair of black and red kites in ukraine, including DNA analysis of hybrid offspring. Biologia, 2019, doi: 10.2478/s11756-019-00268-1

  2. Зыкова ТЮ, Левицкий ВГ, Жимулев ИФ. Архитектура промоторов генов "домашнего хозяйства" в междисках политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524851104-109Доклады Академии Наук 485(1): 104-109, 2019

  3. Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TY, Goncharov FP, Larsson J, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s00412-019-00703-x) Chromosoma 128(2): 97-117, 2019

  4. Хорошко ВА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Осадчий ИС, Жимулев ИФ. Локализация гена dunce в большой серии близлежащих структур политенной хромосомы Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524844507-510Доклады Академии Наук 484(4): 507-510, 2019

  5. Andreyenkova NG, Starikov IJ, Wink M, Karyakin IV, Andreyenkov OV, Zhimulev IF. The problems of genetic support of dividing the black kite (Milvus migrans) into subspecies. (doi: 10.18699/VJ19.486Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 226-231, 2019

  6. Andreyenkov OV, Volkova EI, Andreyenkova NG, Demakov SA. The study of the regulatory region of the Drosophila melanogaster Notch gene by new methods of directed genome editing. (doi: 10.18699/VJ19.482Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 199-202, 2019

  7. Schwartz (Berkaeva) MB, Pankova TE, Demakov SA. ADF1 and BEAF-32 chromatin proteins affect nucleosome positioning and DNA decompaction in 61C7/C8 interband region of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.18699/VJ19.475) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 154-159, 2019

  8. Sidorenko DS, Zykova TYu, Khoroshko VA, Pokholkova GV, Demakov SA, Larsson J, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes reflect functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.18699/VJ19.474Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 148-153, 2019

  9. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ. Обзор современных данных о состоянии популяции орлана-долгохвоста. (doi: 10.19074/1814-8654-2018-37-54-65Пернатые хищники и их охрана 37: 54-65, 2018

  10. Сидоренко ДС. Четвертая хромосома – особый домен хроматина дрозофилы. Norwegian J Dev Int Sci 15(1): 13-19, 2018

  11. Зыкова ТЮ, Попова ОО, Хорошко ВА, Левицкий ВГ, Лавров СА, Жимулев ИФ. Генетическая организация доменов открытого типа, расположенных в междисках политенных хромосом дрозофилы. (doi: 10.31857/S086956520003420-5Доклады Академии Наук 483(1): 98-102, 2018

  12. Андреенкова Н, Андреенков О, Карякин И, Жимулев И. Новые гаплотипы митохондриального гена CytB в гнездящейся популяции сибирского подвида черного коршуна Milvus migrans lineatus Gray, 1831 на территории республики Тыва. (doi: 10.31857/S086956520003206-9Доклады Академии Наук 482(2): 217-219, 2018

  13. Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Попова ОО, Жимулев ИФ. Структура границ дисков интеркалярного гетерохроматина политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.7868/S0869565218110257) Доклады Академии Наук 479(5): 589-592, 2018

  14. Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing. (doi: 10.1371/journal.pone.0192634PLoS ONE 13(4): e0192634, 2018

  15. Zykova TYu, Levitsky VG, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.2174/1389202918666171016123830Curr Genomics 19(3): 179-191, 2018

  16. Карякин ИВ, Николенко ЭГ, Андреенков ОВ, Андреенкова НГ. Обыкновенный и амурский кобчики в республике Тыва, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2018-36-136-141) Пернатые хищники и их охрана 36: 136-141, 2018 

  17. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. (doi:  10.2174/1389202917666160512164913Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

  18. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулёв ИФ, Фон Эйлер Ф. Первый факт гнездования сапсана на дереве в Сибири, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2017-35-260-264Пернатые хищники и их охрана 35: 260-264, 2017

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2019-0003 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Жимулев ИФ

Гранты РФФИ

19-44-543016 Изучение организации открытого хроматина междисков политенных хромосом Drosophila melanogaster методом направленного редактирования генома с использованием системы CRISPR/Cas9.
Сидоренко ДС

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Жимулев ИФ, Демаков СА. Хромосома 2018. Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 127-128, 2019

  2. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Получение направленных делеций в регуляторной зоне гена Notch с использованием CRISPR/Cas-опосредованного метода редактирования геномов. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 92

  3. Zhimulev IF, Zykova TYu, Levitsky VG, Antonenko O, Belyaeva ES. A portrait of functional organization of the Drosophila genome – polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 88

  4. Zykova TYu, Levitsky VG, Zhimulev IF. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с.89

  5. Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TYu, Kolesnikova TD, Goncharov FP, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogasterМатериалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 75

  6. Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of insulator proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 60

  7. Khoroshko V, Pokholkova G, Zykova T, Zhimulev I. Gene location in intercalary heterochromatin bands of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 32

  8. Andreyenkova NG, Andreyenkov OV, Karyakin IV, Popova OO, Zhimulev IF. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 1

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Andreyenkov OV. Directed formation of deletions in Notch regulatory region using CRISPR-Cas-mediated targeted genome editing method. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Andreyenkova NG. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Zykova TYu. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Zykova T. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus, June 19-22, 2017, Nizhny Novgorod, Russia

  5. Zykova T. Molecular and genetic organization of chromatin in the composition of Drosophila interphase chromosomes. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  6. Sidorenko D. A combined method for mapping polytene chromosome binding pattern in the fourth microchromosome of Drosophila melanogaster. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  7. Демаков СА. Современные методы изучения геномов эукариот. Обзорные лекции для студентов, аспирантов, молодых ученых и преподавателей Курганского государственного университета. 10-11 апреля 2017, Курган

  8. Zykova TYu. Chromosomal organization of Drosophila genome. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  9. Zykova T. Structural and genetic domains of interphase chromosomes in Drosophila melanogaster. 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology (CMCB-2016), April 25-28 2016, Dalian, China

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

Fordham University, New York, NY, USA
Генетический анализ гена дрозофилы – гомолога гена восприимчивости рака предстательной железы у человека

Награды: 

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Зыкова ТЮ (2012)

Премия СО РАН для молодых ученых им. Д.К. Беляева

Зыкова ТЮ (2012)