Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория хромосомной инженерии

Демаков Сергей Анатольевич
Заведующий лабораторией

thomson_logo.gif ResearcherID

eLIBRARY_logo.pngLIBRARY.RU

Curriculum Vitae

Состав лаборатории: 
      ФИО Должность Ученая
степень
Контакты
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Демаков Сергей Анатольевич зав. лаб. дбн demakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Волкова Елена Игоревна снс кбн volkatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Зыкова (Ватолина) Татьяна Юрьевна снс кбн vatolinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Андреенкова Наталья Григорьевна снс кбн  
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Андреенков Олег Владимирович нс   andreenkovatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Беркаева Мария Борисовна мнс   berkaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  thomson_logo.gif eLIBRARY_logo.png Сидоренко (Демидова) Дарья Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
      Мальцева Светлана Вадимовна ст. лаборант    
      Попова Ольга Олеговна ст. лаборант    
      Прудникова Мария Максимовна ст. лаборант    
      Силютина Наталья Юрьевна ст. лаборант    
      Корнеева Любовь Алексеевна ст. лаборант    

Бывшие сотрудники

Николаев Дмитрий Алексеевич
Гончарова Алла Анатольевна
Панкова Татьяна Евгеньевна

Направления исследований: 
  1. Молекулярно-генетическая организация междисков политенных хромосом
  2. Механизмы, обеспечивающие декомпактное состояние и функционирование междисков
  3. Генетические факторы, вовлеченные в регуляцию высших уровней организации интерфазного хроматина

Публикации за последние 5 лет: 

  1. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. Curr Genomics, 18(2): 214-226, 2017

  2. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА, Сия С, Дубровский ЭБ, Жимулев ИФ. Направленное удаление гена RNaseZ дрозофилы методом гомологичной рекомбинации. Доклады Академии Наук 471(2): 230-233, 2016

  3. Khoroshko VA, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Chromatin heterogeneity and distribution of regulatory elements in the late-replicating intercalary heterochromatin domains of Drosophila melanogaster chromosomes. PLoS ONE 11(6): e0157147, 2016

  4. Демакова ОВ, Болдырева ЛВ, Демаков СА, Гончаров ФП, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Характеристика хроматина тонких дисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 58: 248-252, 2016

  5. Демидова ДС, Демаков СА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Жимулев ИФ. Комбинированный метод картирования политенных хромосом на примере 4-й микрохромосомы Drosophila melanogaster. Цитология 58: 253-257, 2016

  6. Зыкова ТЮ, Демидова ДС, Кокоза ЕБ, Жимулев ИФ. Локализация инсерций мобильных Р-элементов в доменах активного и репрессированного хроматина в геноме Drosophila melanogaster. Цитология 58: 258-261, 2016

  7. Pavlova GA, Galimova YuA, Popova YuV, Munzarova AF, Razuvaeva AV, Alekseeva AL, Berkaeva MB, Pindyurin AV, Somma MP, Gatti M, Renda F. Factors governing the pattern of spindle microtubule regrowth after tubulin depolymerization. Цитология 58: 299-303, 2016

  8. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Георгиев ПГ, Гончарова АА, Похолкова ГВ, Демаков СА. Эктопическое привлечение белка Chromator в системе UAS>DBD(GAL4) как метод изучения инсуляторных белков в политенных хромосомах Drosophila melanogaster. Цитология 58: 493-496, 2016

  9. Жимулев ИФ, Болдырева ЛВ, Демакова ОВ, Похолкова ГВ, Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Лавров СА, Беляева ЕС. Формирование дисков политенных хромосом из интронов генов у дрозофилы. Доклады Акад Наук 466(5): 607–610, 2016

  10. Zykova T, Demidova D, Levitsky V, Khoroshko V, Belyaeva E, Kokoza E, Zhimulev I. Molecular and genetic structure of polytene chromosome banding pattern in Drosophila melanogaster. Athens: ATINER'S Conference Paper Series, No: BIO2015-1700: 4-15, 2015

  11. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Levitsky VG, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s10577-014-9447-3)  Chromosome Res 23: 409-410, 2015

  12. Pokholkova GV, Koryakov DE, Pindyurin AV, Kozhevnikova EN, Belyakin SN, Andreyenkov OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of SUUR and HP1 proteins results in delayed replication of euchromatic regions in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 124: 209-220, 2015

  13. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. PLoS ONE 9(7): e101631, 2014

  14. Похолкова ГВ, Коряков ДЕ, Пиндюрин АВ, Андреенков ОВ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Искусственное привлечение гетерохроматиновых белков SUUR и HP1 в районы открытого хроматина приводит к замедлению движения репликационной вилки. Цитология 56: 677, 2014

  15. Makunin IV, Kolesnikova TD, Andreyenkova NG. Under-replicated regions in D. melanogaster are enriched with fast evolving genes and highly conserved noncoding sequences. Genome Biol Evol 6: 2050-2060, 2014

  16. Andreyenkova NG, Kolesnikova TD, Makunin IV, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Zykova TYu, Zhimulev IF, Belyaeva ES. Late replication domains are evolutionary conserved in the Drosophila genome. PLoS ONE 8(12): e83319, 2013

  17. Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Зыкова (Ватолина) ТЮ, Семешин ВФ, Демаков СА, Демакова ОВ, Гончаров ФП, Хорошко ВА, Болдырева ЛВ, Кокоза ЕБ. Хромосомная организация генома у дрозофилы. Цитология 55: 144–147, 2013

  18. Колесникова ТД, Андреенкова НГ, Беляева ЕС, Гончаров ФП, Зыкова ТЮ, Болдырева ЛВ, Похолкова ГВ, Жимулев ИФ. Районы поздней репликации политенных хромосом слюнных желез Drosophila melanogaster. Цитология 55: 178–180, 2013

  19. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Семешин ВФ, Жимулев ИФ, Демаков СА. Структурные особенности организации хроматина междиска 3С6/С7 политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 55: 198–203, 2013

  20. Dubatolova TD, Volkova EI, Omelyanchuk LV. Drosophila splicing factor SF2 knock-down mutant shows altered cell cycle in vivo. Cell Biol Int 37: 187-190, 2013

  21. Zhimulev IF, Belyaeva ES, Vatolina TYu, Demakov SA. Banding patterns in Drosophila melanogaster polytene chromosomes correlate with DNA-binding protein occupancy. BioEssays 34: 498-508, 2012

Публикации старше 5 лет

Действующие гранты: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2016-0005 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Демаков СА

0310-2016-0009
Тема 1: Структура хроматина интерфазных хромосом и ее роль в регуляции экспрессии генов. Демаков СА
Тема 2: Создание гибридных молекул ДНК для направленного переноса генов и средств их доставки в клетки. Демаков СА

Гранты РФФИ

16-34-00331 (номер гос. регистрации АААА-А16-116022510077-6) Разработка методов картирования доменов активного и репрессированного хроматина четвёртой хромосомы Drosophila melanogaster. Демидова ДС

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Демаков СА. Современные методы изучения геномов эукариот. Обзорные лекции для студентов, аспирантов, молодых ученых и преподавателей Курганского государственного университета. 10-11 апреля 2017, Курган

  2. Zykova TYu. Chromosomal organization of Drosophila genome. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  3. Zykova T. Structural and genetic domains of interphase chromosomes in Drosophila melanogaster. 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology (CMCB-2016), April 25-28 2016, Dalian, China

  4. Демаков СА. Методы направленной трансформации генома дрозофилы: проблемы и перспективы. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015",
    5-9 октября 2015, Новосибирcк

  5. Зыкова ТЮ. Р-elements insert in 5’ ends of genes located in polytene chromosome interbands in D. melanogaster. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  6. Zykova T. Molecular and genetic structure of polytene chromosome banding pattern in Drosophila melanogaster. Annual International Conference on Biology, 22-25 June 2015, Athens, Greece

  7. Зыкова ТЮ. Хромомерная организация интерфазных хромосом дрозофилы. III Съезд Общества клеточной биологии, 16-18 октября 2012, С.-Петербург

  8. Демаков СА. Моделирование дисков и междисков политенных хромосом дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  9. Демаков СА. Искусственные хромосомы – проблемы и перспективы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  10. Демаков СА. Функциональная организация межхромомеров политенных хромосом дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  11. Зыков ИА. Структура хроматина дрозофилы при эктопической экспрессии гена SUUR. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

Международное сотрудничество: 

Департамент биологии, Университет Фордхэм, Нью Йорк, США
Генетический анализ гена дрозофилы – гомолога гена восприимчивости рака предстательной железы у человека

Награды: 

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Зыкова ТЮ (2012)

Премия СО РАН для молодых ученых им. Д.К. Беляева

Зыкова ТЮ (2012)