Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория хромосомной инженерии

Демаков Сергей Анатольевич
Заведующий лабораторией

Curriculum Vitae

Сотрудники: 
        ФИО Должность Ученая
степень
Контакты
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Демаков Сергей Анатольевич зав. лаб. дбн demakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Волкова Елена Игоревна снс кбн volkatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpgscopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Зыкова (Ватолина) Татьяна Юрьевна снс кбн vatolinaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpgscopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенкова Наталья Григорьевна снс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpgscopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Андреенков Олег Владимирович нс   andreenkovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Шварц (Беркаева) Мария Борисовна мнс   berkaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Сидоренко (Демидова) Дарья Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Попова Ольга Олеговна ст. лаборант    
        Силютина Наталья Юрьевна ст. лаборант    
        Корнеева Любовь Алексеевна ст. лаборант    

Бывшие сотрудники:

Гончарова Алла Анатольевна
Николаев Дмитрий Алексеевич
Панкова Татьяна Евгеньевна
Прудникова Мария Максимовна

Направления исследований: 
  • Молекулярно-генетическая организация междисков политенных хромосом
  • Механизмы, обеспечивающие декомпактное состояние и функционирование междисков
  • Генетические факторы, вовлеченные в регуляцию высших уровней организации интерфазного хроматина

Публикации: 

  1. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Получение направленных делеций в регуляторной зоне гена Notch с использованием CRISPR/Cas-опосредованного метода редактирования геномов. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 92

  2. Zhimulev IF, Zykova TYu, Levitsky VG, Antonenko O, Belyaeva ES. A portrait of functional organization of the Drosophila genome – polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 88

  3. Zykova TYu, Levitsky VG, Zhimulev IF. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с.89

  4. Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TYu, Kolesnikova TD, Goncharov FP, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 75

  5. Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of insulator proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 60

  6. Khoroshko V, Pokholkova G, Zykova T, Zhimulev I. Gene location in intercalary heterochromatin bands of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 32

  7. Andreyenkova NG, Andreyenkov OV, Karyakin IV, Popova OO, Zhimulev IF. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 1

  8. Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Попова ОО, Жимулев ИФ. Структура границ дисков интеркалярного гетерохроматина политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.7868/S0869565218110257) Доклады Академии Наук 479(5): 589-592, 2018

  9. Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing. (doi: 10.1371/journal.pone.0192634PLoS ONE 13(4): e0192634, 2018

  10. Zykova TYu, Levitsky VG, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.2174/1389202918666171016123830Curr Genomics 19(3): 179-191, 2018

  11. Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. (doi:  10.2174/1389202917666160512164913Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

  12. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА, Сия С, Дубровский ЭБ, Жимулев ИФ. Направленное удаление гена RNaseZ дрозофилы методом гомологичной рекомбинации. Доклады Академии Наук 471(2): 230-233, 2016

  13. Khoroshko VA, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Chromatin heterogeneity and distribution of regulatory elements in the late-replicating intercalary heterochromatin domains of Drosophila melanogaster chromosomes. (doi: 10.1371/journal.pone.0157147) PLoS ONE 11(6): e0157147, 2016

  14. Демакова ОВ, Болдырева ЛВ, Демаков СА, Гончаров ФП, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Характеристика хроматина тонких дисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 58: 248-252, 2016

  15. Демидова ДС, Демаков СА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Жимулев ИФ. Комбинированный метод картирования политенных хромосом на примере 4-й микрохромосомы Drosophila melanogaster. Цитология 58: 253-257, 2016

  16. Зыкова ТЮ, Демидова ДС, Кокоза ЕБ, Жимулев ИФ. Локализация инсерций мобильных Р-элементов в доменах активного и репрессированного хроматина в геноме Drosophila melanogaster. Цитология 58: 258-261, 2016

  17. Pavlova GA, Galimova YuA, Popova YuV, Munzarova AF, Razuvaeva AV, Alekseeva AL, Berkaeva MB, Pindyurin AV, Somma MP, Gatti M, Renda F. Factors governing the pattern of spindle microtubule regrowth after tubulin depolymerization. Цитология 58: 299-303, 2016

  18. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Георгиев ПГ, Гончарова АА, Похолкова ГВ, Демаков СА. Эктопическое привлечение белка Chromator в системе UAS>DBD(GAL4) как метод изучения инсуляторных белков в политенных хромосомах Drosophila melanogaster. Цитология 58: 493-496, 2016

  19. Жимулев ИФ, Болдырева ЛВ, Демакова ОВ, Похолкова ГВ, Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Лавров СА, Беляева ЕС. Формирование дисков политенных хромосом из интронов генов у дрозофилы. Доклады Акад Наук 466(5): 607–610, 2016

  20. Zykova T, Demidova D, Levitsky V, Khoroshko V, Belyaeva E, Kokoza E, Zhimulev I. Molecular and genetic structure of polytene chromosome banding pattern in Drosophila melanogaster. Athens: ATINER'S Conference Paper Series, No: BIO2015-1700: 4-15, 2015

  21. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Levitsky VG, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s10577-014-9447-3Chromosome Res 23: 409-410, 2015

  22. Pokholkova GV, Koryakov DE, Pindyurin AV, Kozhevnikova EN, Belyakin SN, Andreyenkov OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of SUUR and HP1 proteins results in delayed replication of euchromatic regions in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-014-0491-8Chromosoma 124: 209-220, 2015

  23. Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1371/journal.pone.0101631PLoS ONE 9(7): e101631, 2014

  24. Похолкова ГВ, Коряков ДЕ, Пиндюрин АВ, Андреенков ОВ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Искусственное привлечение гетерохроматиновых белков SUUR и HP1 в районы открытого хроматина приводит к замедлению движения репликационной вилки. Цитология 56: 677, 2014

  25. Makunin IV, Kolesnikova TD, Andreyenkova NG. Under-replicated regions in D. melanogaster are enriched with fast evolving genes and highly conserved noncoding sequences. (doi: 10.1093/gbe/evu156Genome Biol Evol 6: 2050-2060, 2014

Публикации старше 5 лет

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2018-0010 Организация интерфазных хромосом и структура генома. Жимулев ИФ

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Andreyenkov OV. Directed formation of deletions in Notch regulatory region using CRISPR-Cas-mediated targeted genome editing method. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Andreyenkova NG. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Zykova TYu. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Zykova T. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus, June 19-22, 2017, Nizhny Novgorod, Russia

  5. Zykova T. Molecular and genetic organization of chromatin in the composition of Drosophila interphase chromosomes. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  6. Sidorenko D. A combined method for mapping polytene chromosome binding pattern in the fourth microchromosome of Drosophila melanogaster. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  7. Демаков СА. Современные методы изучения геномов эукариот. Обзорные лекции для студентов, аспирантов, молодых ученых и преподавателей Курганского государственного университета. 10-11 апреля 2017, Курган

  8. Zykova TYu. Chromosomal organization of Drosophila genome. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  9. Zykova T. Structural and genetic domains of interphase chromosomes in Drosophila melanogaster. 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology (CMCB-2016), April 25-28 2016, Dalian, China

  10. Демаков СА. Методы направленной трансформации генома дрозофилы: проблемы и перспективы. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015",
    5-9 октября 2015, Новосибирcк

  11. Зыкова ТЮ. Р-elements insert in 5’ ends of genes located in polytene chromosome interbands in D. melanogaster. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  12. Zykova T. Molecular and genetic structure of polytene chromosome banding pattern in Drosophila melanogaster. Annual International Conference on Biology, 22-25 June 2015, Athens, Greece

  13. Зыкова ТЮ. Хромомерная организация интерфазных хромосом дрозофилы. III Съезд Общества клеточной биологии, 16-18 октября 2012, С.-Петербург

  14. Демаков СА. Моделирование дисков и междисков политенных хромосом дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  15. Демаков СА. Искусственные хромосомы – проблемы и перспективы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  16. Демаков СА. Функциональная организация межхромомеров политенных хромосом дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  17. Зыков ИА. Структура хроматина дрозофилы при эктопической экспрессии гена SUUR. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

Международное сотрудничество: 

Fordham University, New York, NY, USA
Генетический анализ гена дрозофилы – гомолога гена восприимчивости рака предстательной железы у человека

Награды: 

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Зыкова ТЮ (2012)

Премия СО РАН для молодых ученых им. Д.К. Беляева

Зыкова ТЮ (2012)