Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория хромосомной инженерии

Демаков Сергей Анатольевич
И.о. заведующего лабораторией

Curriculum Vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Демаков Сергей Анатольевич и.о. зав. лаб. дбн demakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Волкова Елена Игоревна снс кбн volkatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенкова Наталья Григорьевна снс кбн anataatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенков Олег Владимирович нс   andreenkovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Сидоренко Дарья Сергеевна мнс кбн demidova [dot] dariaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Шварц Мария Борисовна мнс   berkaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Богуславский Денис Анатольевич ст. лаб.    
        Туркина Ольга Романовна ст. лаб.    
        Силютина Наталья Юрьевна ст. лаб.    
        Корнеева Любовь Алексеевна ст. лаб.    
        Поспелова Татьяна Ивановна мнс совм. дмн  
        Тихомиров Савелий Алексеевич ст. лаб.-иссл. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гончарова Алла Анатольевна
Зыкова Татьяна Юрьевна, кбн
Николаев Дмитрий Алексеевич
Панкова Татьяна Евгеньевна
Попова Ольга Олеговна
Прудникова Мария Максимовна

Направления исследований: 
  • Молекулярно-генетическая организация междисков политенных хромосом
  • Механизмы, обеспечивающие декомпактное состояние и функционирование междисков
  • Генетические факторы, вовлеченные в регуляцию высших уровней организации интерфазного хроматина

Публикации: 

  1. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулёв ИФ, Богомолова ИН, Равкин ЮС, Цыбулин СМ, Кашинская ЮО, Штоль ДА. Инвазии ястребиной совы в лесостепь Западной Сибири. (doi: 10.19074/1814-8654-2020-40-116-124Пернатые хищники и их охрана 40: 116-124, 2020

  2. Levitsky VG, Zykova TYu, Moshkin YuM, Zhimulev IF. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in Drosophila interphase chromosomes. (doi: 10.3390/ijms21239282Int J Mol Sci 21(23): 9282, 2020

  3. Жимулев ИФ, Антоненко ОВ, Деева ЕА, Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Цыбулин СМ, Богомолова ИН, Равкин ЮС, Зыкова ТЮ, Кашинская ЮО, Романов КВ, Сысоев БА, Шнайдер ЕП, Штоль ДА, Машков ВЕ, Жимулев ЕИ, Карякин ИВ. Встречи птиц, редких для Новосибирского Академгородка и его окрестностей на Правобережье Оби (Новосибирская область). Русский орнитологический журнал 29(1959): 3611-3631, 2020

  4. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Применение CRISPR/Cas9 для получения в геноме Drosophila melanogaster направленных делеций и введения сайта интеграции из системы attP/attB фага ФС31. В кн. Методы редактирования генов и геномов (отв. ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ВВ Власов). Новосибирск: Издательство СО РАН, 2020, гл. 8, с. 117-131

  5. Khoroshko VA, Pokholkova GV, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.3390/genes11040417Genes 11(4): 417, 2020

  6. Demakova OV, Demakov SA, Boldyreva LV, Zykova TYu, Levitsky VG, Semeshin VF, Pokholkova GV, Sidorenko DS, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes. (doi: 10.1007/s00412-019-00728-2Chromosoma 129(1): 25-44, 2020

  7. Literák I, Skyrpan M, Andreyenkova NG. A mixed pair of black and red kites in ukraine, including DNA analysis of hybrid offspring. (doi: 10.2478/s11756-019-00268-1Biologia 75: 115-120, 2020

  8. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Боксорн АЮ, Кашинская ЮО, Штоль ДА. Новые данные о распространении домового сыча в Новосибирской области и северной части Алтайского края, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-282-285Пернатые хищники и их охрана 39: 282-285, 2019

  9. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Дубиковский ДВ, Урусов ЛВ, Жимулев ИФ. Новые данные о гнездовании бородатой неясыти в лесостепной зоне Новосибирской области, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-275-281Пернатые хищники и их охрана 39: 275-281, 2019

  10. Карякин ИВ, Николенко ЭГ, Шнайдер ЕП, Зиневич ЛС, Пуликова ГИ, Бартошук К, Хорват М, Юхаш Т, Агабабян К, Андреенкова НГ. Результаты GPS/GSM-трекинга ювенильных степных орлов из России и Казахстана. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-71-227Пернатые хищники и их охрана 39: 71-227, 2019

  11. Volkova EI, Andreyenkova NG, Andreyenkov OV, Sidorenko DS, Zhimulev IF, Demakov SA.  Structural and functional dissection of the 5’ region of the Notch gene in Drosophila melanogaster. (doi: 10.3390/genes10121037Genes 10(12): 1037, 2019

  12. Зыкова ТЮ, Левицкий ВГ, Жимулев ИФ. Архитектура промоторов генов "домашнего хозяйства" в междисках политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524851104-109Доклады Академии Наук 485(1): 104-109, 2019

  13. Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TY, Goncharov FP, Larsson J, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s00412-019-00703-x) Chromosoma 128(2): 97-117, 2019

  14. Хорошко ВА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Осадчий ИС, Жимулев ИФ. Локализация гена dunce в большой серии близлежащих структур политенной хромосомы Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524844507-510Доклады Академии Наук 484(4): 507-510, 2019

  15. Andreyenkova NG, Starikov IJ, Wink M, Karyakin IV, Andreyenkov OV, Zhimulev IF. The problems of genetic support of dividing the black kite (Milvus migrans) into subspecies. (doi: 10.18699/VJ19.486Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 226-231, 2019

  16. Andreyenkov OV, Volkova EI, Andreyenkova NG, Demakov SA. The study of the regulatory region of the Drosophila melanogaster Notch gene by new methods of directed genome editing. (doi: 10.18699/VJ19.482Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 199-202, 2019

  17. Schwartz (Berkaeva) MB, Pankova TE, Demakov SA. ADF1 and BEAF-32 chromatin proteins affect nucleosome positioning and DNA decompaction in 61C7/C8 interband region of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.18699/VJ19.475) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 154-159, 2019

  18. Sidorenko DS, Zykova TYu, Khoroshko VA, Pokholkova GV, Demakov SA, Larsson J, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes reflect functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.18699/VJ19.474Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 148-153, 2019

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0246-2021-0014 Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Гранты РНФ

20-14-00074 Роль микроРНК в механизмах регуляции развития и ранней диагностике онкогенеза человека. Демаков СА

Гранты РФФИ

19-44-543016 Изучение организации открытого хроматина междисков политенных хромосом Drosophila melanogaster методом направленного редактирования генома с использованием системы CRISPR/Cas9.
Сидоренко ДС

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Жимулев ИФ, Демаков СА. Хромосома 2018. Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 127-128, 2019

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Andreyenkov OV. Directed formation of deletions in Notch regulatory region using CRISPR-Cas-mediated targeted genome editing method. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Andreyenkova NG. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Zykova TYu. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Демаков СА. Методы генетической коррекции у дрозофилы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  5. Зыкова ТЮ. Организация промоторов повсеместно активных генов. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  6. Zykova T. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus, June 19-22, 2017, Nizhny Novgorod, Russia

  7. Zykova T. Molecular and genetic organization of chromatin in the composition of Drosophila interphase chromosomes. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  8. Sidorenko D. A combined method for mapping polytene chromosome binding pattern in the fourth microchromosome of Drosophila melanogaster. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  9. Демаков СА. Современные методы изучения геномов эукариот. Обзорные лекции для студентов, аспирантов, молодых ученых и преподавателей Курганского государственного университета. 10-11 апреля 2017, Курган

  10. Zykova TYu. Chromosomal organization of Drosophila genome. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  11. Zykova T. Structural and genetic domains of interphase chromosomes in Drosophila melanogaster. 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology (CMCB-2016), April 25-28 2016, Dalian, China

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

Fordham University, New York, NY, USA
Генетический анализ гена дрозофилы – гомолога гена восприимчивости рака предстательной железы у человека

Награды: 

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Зыкова ТЮ (2012)

Премия СО РАН для молодых ученых им. Д.К. Беляева

Зыкова ТЮ (2012)

Памятный знак "За труд на благо города"

Волкова ЕИ, Корнеева ЛА (2013)