Отдел регуляции генетических процессов

Лаборатория геномики

Белякин Степан Николаевич
Заведующий отделом
Заведующий лабораторией

Сотрудники: 
        ФИО Должность Ученая
степень
Контакты
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Белякин Степан Николаевич зав. лаб. кбн belyakinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Шлома Виктор Владимирович снс кбн shlomaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Посух Ольга Витальевна нс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лактионов Пётр Павлович нс кбн laktionovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Максимов Даниил Александрович нс кбн viftatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Юрлова Анна Александровна мнс кбн annushatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Калашникова Дарья Андреевна ст. лаб.-иссл.   tsunatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg     Романов Станислав Евгеньевич ст. лаб.-иссл.   romanovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg     Антошина Полина Андреевна ст. лаб.-иссл.   poloniumatmcb [dot] nsc [dot] ru

Бывшие сотрудники:

Синицын Иван Александрович
Скворцова Ксения Николаевна

Направления исследований: 
  • Механизм эпигенетического наследования модификаций гистонов в процессе репликации генома дрозофилы
     
  • Механизмы регуляции генов транскрипционными факторами, участвующими в дифференцировке клеток в развитии дрозофилы
     
  • Проект Лаборатории эпигенетики, созданной на Факультете естественных наук Новосибирского государственного университета совместно с Лабораторией геномики Института молекулряной и клеточной биологии СО РАН "Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга"

 

ПОПУЛЯРНОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

Молекулярный детектив
О влиянии невесомости на дрозофил

you_tube.jpg Неформальное общение с кбн СН Белякиным о лаборатории и о науке вообще

Публикации: 

  1. Ильин АА, Шлома ВВ, Оленкина ОМ, Ненашева ВВ, Абрамов ЮА, Пиндюрин АВ, Максимов ДА, Лактионов ПП, Белякин СН, Шевелев ЮЯ. Анализ динамики связывания хромосом с ядерной ламиной в ходе сперматогенеза у дрозофилы. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 119-120

  2. Romanov SE, Posukh OV, Maksimov DA, Belyakin SN, Laktionov PP. In vivo DamID mapping uncovered dynamic CP190 chromatin binding landscape in course of Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 68-69

  3. Maksimov DA, Laktionov PP, Posukh OV, Belyakin SN, Koryakov DE. Genome-wide analysis of SU(VAR)3-9 distribution in chromosomes of Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 49

  4. Maksimov DA, Antoshina PA, Kalashnikova DA, Posukh OV, Belyakin SN. Doublesex protein is associated with gene activation in Drosophila males. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 48

  5. Laktionov PP, Maksimov DA, Romanov SE, Antoshina PA, Posukh OV, White-Cooper H, Koryakov DE, Belyakin SN. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 40

  6. Belyakin SN, Posukh OV, Maksimov DA, Laktionov PP, Koryakov DE. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 7

  7. Singh PB, Belyakin SN. L chromosome behaviour and chromosomal imprinting in Sciara coprophila. (doi: 10.3390/genes9090440) Genes 9(9): 440, 2018

  8. Белякин СН, Максимов ДА. Направленное редактирование генома Drosophila melanogaster. В кн: Редактирование генов и геномов (ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ЕА Покушалов, ВВ Власов). Новосибирск: Издательство СО РАН, 2018, т. 2, гл. 19, с. 177-192

  9. Laktionov PP, Maksimov DA, Romanov SE, Antoshina PA, Posukh OV, White‑Cooper H, Koryakov DE, Belyakin SN. Genome‑wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. (doi: 10.1186/s13072-018-0183-3) Epigenetics Chromatin 11: 14, 2018

  10. Maksimov DA, Laktionov PP, Posukh OV, Belyakin SN, Koryakov DE. Genome-wide analysis of SU(VAR)3-9 distribution in chromosomes of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s00412-017-0647-4Chromosoma 127(1): 85-102, 2018

  11. Гайнер ТА, Карамышева ТВ, Каримова ОГ, Корень ОЛ, Шлома ВВ, Шорина АР, Богомолов АГ, Рубцов НБ. Комплексная диагностика хромосомной патологии - деривата хромосомы 4 и малой сверхчисленной маркерной хромосомы. Медицинская генетика 16(12): 9-17, 2017

  12. Posukh OV, Maksimov DA, Laktionov PP, Koryakov DE, Belyakin SN. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. (doi: 10.1186/s13072-017-0163-zEpigenetics Chromatin 10: 56, 2017

  13. Ilyin AA, Ryazansky SS, Doronin SA, Olenkina OM, Mikhaleva EA, Yakushev EY, Abramov YA, Belyakin SN, Ivankin AV, Pindyurin AV, Gvozdev VA, Klenov MS, Shevelyov YY. Piwi interacts with chromatin at nuclear pores and promiscuously binds nuclear transcripts in Drosophila ovarian somatic cells. (doi: 10.1093/nar/gkx355Nucleic Acids Res 45(13): 7666-7680, 2017

  14. Степанова АО, Лактионов Петр П, Лактионов Павел П. Исследование транскриптома первичных эндотелиоцитов, культивируемых на поверхности микроволокнистых матриксов разного состава. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 79, 2017

  15. Новикова ОА, Назаркина ЖК, Лактионов Петр П, Покушалова ЕА, Карпенко АА, Лактионов Павел П. Поиск генетических маркеров настабильных атером. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 89, 2017

  16. Andreyeva EN, Bernardo TJ, Kolesnikova TD, Lu X, Yarinich LA, Bartholdy BA, Guo X, Posukh OV, Healton S, Willcockson MA, Pindyurin AV, Zhimulev IF, Skoultchi AI, Fyodorov DV. Regulatory functions and chromatin loading dynamics of linker histone H1 during endoreplication in Drosophila. (doi: 10.1101/gad.295717.116Genes Dev 31: 603-616, 2017

  17. Ogneva IV, Belyakin SN, Sarantseva SV. The development of Drosophila melanogaster under different duration space flight and subsequent adaptation to Earth gravity. (doi: 10.1371/journal.pone.0166885PLoS ONE 11(11): e0166885, 2016

  18. Maksimov DA, Laktionov PP, Belyakin SN. Data analysis algorithm for DamID-seq profiling of chromatin proteins in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s10577-016-9538-4Chromosome Res 24: 481-494, 2016

  19. Munzarova A, Popova J, Razuvaeva A, Shloma V, Gatti M, Omelyanchuk L. Accurate measurement of poleward microtubule flux in the spindle of Drosophila S2 cells. (doi: 10.1002/cbin.10638Cell Biol Int 40: 984-990, 2016

  20. Куслий МА, Дружкова АС, Попова КО, Воробьева НВ, Макунин АИ, Юрлова АА, Тишкин АА, Миняев СС, Трифонов ВА, Графодатский АС, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Цитология 58: 304-308, 2016

  21. Posukh OV, Maksimov DA, Skvortsova KN, Koryakov DE, Belyakin SN. The effects of SUUR protein suggest its role in repressive chromatin renewal during replication in Drosophila. (doi: 10.1080/19491034.2015.1074366) Nucleus 6: 249-253, 2015

  22. Pokholkova GV, Koryakov DE, Pindyurin AV, Kozhevnikova EN, Belyakin SN, Andreyenkov OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of SUUR and HP1 proteins results in delayed replication of euchromatic regions in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-014-0491-8Chromosoma 124: 209-220, 2015

  23. Nordman JT, Kozhevnikova EN, Verrijzer CP, Pindyurin AV, Andreyeva EN, Shloma VV, Zhimulev IF, Orr-Weaver TL. DNA copy-number control through inhibition of replication fork progression. (doi: 10.1016/j.celrep.2014.10.005Cell Reports 9: 841-849, 2014

  24. Maksimov DA, Koryakov DE, Belyakin SN. Developmental variation of the SUUR protein binding correlates with gene regulation and specific chromatin types in D. melanogaster. (doi: 10.1007/s00412-013-0445-6Chromosoma 123: 253-264, 2014

  25. Лактионов ПП, White-Cooper H, Максимов ДА, Белякин СН. Транскрипционный фактор COMR играет роль прямого активатора в генетической программе сперматогенеза у D. melanogaster. (doi: 10.1134/S0026893314010087Молекулярная Биология 48: 153-165, 2014

  26. Похолкова ГВ, Коряков ДЕ, Пиндюрин АВ, Андреенков ОВ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Искусственное привлечение гетерохроматиновых белков SUUR и HP1 в районы открытого хроматина приводит к замедлению движения репликационной вилки. Цитология 56: 677, 2014

  27. Шевелев ЮЯ, Оленкина ОМ, Абрамов ЮА, Пиндюрин АВ, Максимов ДА, Белякин СН. Построение карт контакта хромосом с ядерной ламиной в герминальных клетках самцов Drosophila melanogaster. Цитология 56: 690, 2014

Публикации старше 5 лет

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2018-0009 Регуляция генной активности и эпигенетической наследственности. Белякин СН

Грант Правительства Российской Федерации (мегагрант). Совместно с Новосибирским государственным университетом

14.Y26.31.0024 Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга. Сингх П, Белякин СН 

Гранты РФФИ

16-04-01463 ​​(номер гос. регистрации АААА-А16-116021850048-4) Регуляторные эффекты изоформ транскрипционного фактора Doublesex при формировании полового диморфизма у Drosophila melanogaster. Максимов ДА

17-00-00181 Регуляторная роль факторов, участвующих в трехмерной организации и позиционировании X хромосомы в ядре герминальных клеток самцов Drosophila melanogaster. Белякин СН

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Belyakin SN. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Laktionov PP. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Belyakin S. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  4. Лактионов ПП. Поиск генетических маркеров настабильных атером. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  5. Laktionov PP. Genome-wide profiling of gene expression and transcription factors binding reveals new insights into the mechanisms of gene regulation during Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  6. Белякин СН. The role of Suppressor of Under-Replication protein in epigenetic control and replication of the repressed regions in Drosophila melanogaster genome. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  7. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  8. Laktionov PP. Transcription factors Cookie monster and Cannonball in regulation of gene expression during Drosophila melanogaster spermatogenesis. Drosophila Genetics and Genomics Course, 27 July – 4 August 2014, Cambridge, UK

  9. Belyakin SN. Putative mechanism of the SUUR protein action in late replicating regions of Drosophila genome. 11th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-29 June, 2013, Lecce, Italy

  10. Белякин СН. Регуляция репрессированных районов генома в развитии Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  11. Laktionov PP. Identification of transcriptional regulators for testis-specific gene clusters in Drosophila melanogaster. 16th European Workshop on Molecular and Cellular Endocrinology of the Testis, 8-12 May, 2010, La Biodola, Island of Elba, Italy

  12. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  13. Belyakin SN. Gene density profile reveals the landmarks of late replicated domains in Drosophila melanogaster genome. 9th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-30 May 2009, Gubbio, Italy

  14. Юрлова АА. Доменная консервативность быстро эволюционирующего гетерохроматинового белка SUUR дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  15. Белякин СН. Плотность генов в поздно реплицирующихся доменах генома Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

Международное сотрудничество: 

  • The European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany
    Геномный анализ (2002 - 2005)

  • Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2010)

  • University of Toronto, Canada
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2011 - 2013)

  • Cardiff University, UK
    Исследование семенник-специфичных генов (2011 - 2108)

  • University of Edinburgh, UK
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Charité – Universitätsmedizin Berlin, Germany
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Università degli Studi della Tuscia, Viterbo, Italy
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

Награды: 

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Белякин СН (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Белякин СН (2007)

 

1 декабря 2016 года проект Indicator.Ru и инициативная группа ученых представили рейтинг молодых исследователей-руководителей проектов, поддержанных грантами РФФИ. В первую сотню рейтинга вошел кбн Белякин СН