Отдел регуляции генетических процессов

Лаборатория геномики

Шлома Виктор Владимирович
Заведующий лабораторией

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Шлома Виктор Владимирович зав. лаб. кбн shlomaatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Посух Ольга Витальевна нс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лактионов Пётр Павлович нс кбн laktionovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Максимов Даниил Александрович нс кбн viftatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Юрлова Анна Александровна мнс кбн annushatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Калашникова Дарья Андреевна ст. лаб.-иссл.   tsunatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg     Антошина Полина Андреевна ст. лаб.-иссл.   poloniumatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Романов Станислав Евгеньевич ст. лаб.-иссл. совм.   romanovatmcb [dot] nsc [dot] ru

Бывшие сотрудники:

Белякин Степан Николаевич, кбн
Синицын Иван Александрович
Скворцова Ксения Николаевна

Направления исследований: 
  • Механизм эпигенетического наследования модификаций гистонов в процессе репликации генома дрозофилы
     
  • Механизмы регуляции генов транскрипционными факторами, участвующими в дифференцировке клеток в развитии дрозофилы
     
  • Проект Лаборатории эпигенетики, созданной на Факультете естественных наук Новосибирского государственного университета совместно с Лабораторией геномики Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН "Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга"

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Молекулярный детектив
О влиянии невесомости на дрозофил

you_tube.jpg Неформальное общение с кбн СН Белякиным о лаборатории и о науке вообще
you_tube.jpg Выступление кбн ОВ Посух на Ночи научных историй 2018
you_tube.jpg Фантастический геномный импринтинг у насекомых. Публичная лекция кбн СН Белякина
you_tube.jpg Выступление Романова СЕ на семинаре “Лайфхаки генной инженерии” 

Публикации: 

  1. Романов СЕ, Шлома ВВ, Коряков ДЕ, Белякин СН, Лактионов ПП. Инсуляторный белок Cp190 регулирует экспрессию генов дифференцировки сперматоцитов в клетках мужского зародышевого пути Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0026898423010147) Молекулярная биология 57(1): 109-123, 2023
    Romanov SE, Shloma VV, Koryakov DE, Belyakin SN, Laktionov PP. Insulator protein CP190 regulates expression оf spermatocyte differentiation genes in Drosophila melanogaster male germline. Mol Biol, 2022, doi: 10.1134/S0026893323010120

  2. Романов СЕ, Лактионов ПП. Практическое применение массового параллельного репортерного анализа в биотехнологии и медицине. (doi: 10.17816/clinpract115063) Клиническая практика 13(4): 74-87, 2022

  3. Shevelyov YY, Ulianov SV, Gelfand MS, Belyakin SN, Razin SV. Dosage compensation in Drosophila: its canonical and non-canonical mechanisms. (doi: 10.3390/ijms231810976) Int J Mol Sci 23(18): 10976, 2022

  4. Belyakin SN, Maksimov DA, Pobedintseva MA, Laktionov PP, Voronova D. ASIP promoter variants predict the sesame coat color in Shiba Inu dogs. (doi: 10.3390/vetsci9050222) Vet Sci 9(5): 222, 2022

  5. Ilyin AA, Kononkova AD, Golova AV, Shloma VV, Olenkina OM, Nenasheva VV, Abramov YuA, Kotov AA, Maksimov DA, Laktionov PP, Pindyurin AV, Galitsyna AA, Ulianov SV, Khrameeva EE, Gelfand MS, Belyakin SN, Razin SV, Shevelyov YuY. Comparison of genome architecture at two stages of male germline cell differentiation in Drosophila. (doi: 10.1093/nar/gkac109) Nucleic Acids Res  50(6): 3203–3225, 2022

  6. Bryzgunova O, Bondar A, Ruzankin P, Laktionov Petr, Tarasenko A, Kurilshikov A, Epifanov R, Zaripov M, Kabilov M, Laktionov Pavel. Locus-specific methylation of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 genes with single molecule resolution in cell-free DNA from healthy donors and prostate tumor patients: application in diagnostics. (doi: 10.3390/cancers13246234) Cancers 13(24): 6234, 2021

  7. Романов СЕ, Калашникова ДА, Лактионов ПП. Методы высокопроизводительного репортерного анализа энхансеров. (doi: 10.18699/VJ21.038) Вавиловский журнал генетики и селекции 25(3): 344-355, 2021

  8. Kalashnikova DA, Maksimov DA, Romanov SE, Laktionov PP, Koryakov DE. SetDB1 and Su(var)3-9 play non-overlapping roles in somatic cell chromosomes of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1242/jcs.253096) J Cell Sci 134(2): jcs253096, 2021

  9. Gilbert M, ..., Belyakin S, Yurlova AA, ..., Cleaveland S. Distemper, extinction, and vaccination of the Amur tiger. (doi: 10.1073/pnas.2000153117) Proc Natl Acad Sci USA 117(50): 31954-31962, 2020

  10. Романов СЕ, Лактионов ПП. Получение направленных делеций в геноме Drosophila melanogaster с помощью системы CRISPR/Cas9. В кн. Методы редактирования генов и геномов (отв. ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ВВ Власов). Новосибирск: Издательство СО РАН, 2020, гл. 9, с. 133-148

  11. Singh PB, Belyakin SN, Laktionov PP. Biology and physics of heterochromatin-like domains/complexes. (doi: 10.3390/cells9081881) Cells 9(8): 1881, 2020

  12. Chernonosova VS, Laktionov Petr P, Murashov IS, Karpenko AA, Laktionov Pavel P. Comparative gene expression profiling of human primary endotheliocytes cultivated on polyurethane-based electrospun 3D matrices and natural decellularized vein. (doi: 10.1088/1748-605X/ab7d84) Biomed Mater 15(4): 045012, 2020

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0017 (122011900429-5) Регуляция генной активности и эпигенетической наследственности.

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Smelova A, Maksimov D, Posukh O, Singh P, Belyakin S. The role of heterochromatin proteins in imprinted paternal X chromosomes elimination in the development of Sciara coprophila. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 144-145 (P-01.4-26), 2021

  2. Morozova EE, Laktionov PP, Singh P. The effect of LMNB1 in replicative senescence of human fibroblasts. Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2020. с. 503-504. ISBN 978-5-4437-1114-0

  3. Antoshina PA, Maksimov DA, Laktionov PP, Romanov SE. The dREAM complex binding on chromosomes of male germline cells during Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 23

  4. Osipov YA, Kalashnikova DA, Posukh OV, Antoshina PA, Belyakin SN, Singh P. The role of heterochromatin factors in the paternal genome inactivation during the embryogenesis of Planococcus citri. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 26-27

  5. Romanov SE, Laktionov PP, Belyakin SN. The role of CP190 in genetic regulation of Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 30

  6. Skrypnik PA, Maksimov DA, Posukh OV, Shloma VV, Belyakin SN, Singh PB. Identification of the CE region in the de novo assembled genome of S. coprophila. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 33 

  7. Ильин АА, Шлома ВВ, Оленкина ОМ, Ненашева ВВ, Абрамов ЮА, Пиндюрин АВ, Максимов ДА, Лактионов ПП, Белякин СН, Шевелев ЮЯ. Анализ динамики связывания хромосом с ядерной ламиной в ходе сперматогенеза у дрозофилы. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 119-120

  8. Romanov SE, Posukh OV, Maksimov DA, Belyakin SN, Laktionov PP. In vivo DamID mapping uncovered dynamic CP190 chromatin binding landscape in course of Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 68-69

  9. Maksimov DA, Laktionov PP, Posukh OV, Belyakin SN, Koryakov DE. Genome-wide analysis of SU(VAR)3-9 distribution in chromosomes of Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 49

  10. Maksimov DA, Antoshina PA, Kalashnikova DA, Posukh OV, Belyakin SN. Doublesex protein is associated with gene activation in Drosophila males. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 48

  11. Laktionov PP, Maksimov DA, Romanov SE, Antoshina PA, Posukh OV, White-Cooper H, Koryakov DE, Belyakin SN. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 40

  12. Belyakin SN, Posukh OV, Maksimov DA, Laktionov PP, Koryakov DE. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 7

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Лактионов ПП. Применение высокопроизводительных методов исследования регуляторных элементов генома для оптимизации экспрессии трансгенов. Школа-конференция "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител", 9 сентября 2022, Носоибирск

  2. Belyakin SN. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Laktionov PP. Genome-wide analysis of gene regulation mechanisms during Drosophila spermatogenesis. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Belyakin S. Functional dissection of Drosophila melanogaster SUUR protein influence on H3K27me3 profile. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  5. Белякин СН. Картирование хроматиновых белков без применения антител. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  6. Лактионов ПП. Поиск генетических маркеров настабильных атером. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  7. Laktionov PP. Genome-wide profiling of gene expression and transcription factors binding reveals new insights into the mechanisms of gene regulation during Drosophila spermatogenesis. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  8. Белякин СН. The role of Suppressor of Under-Replication protein in epigenetic control and replication of the repressed regions in Drosophila melanogaster genome. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  9. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  10. Laktionov PP. Transcription factors Cookie monster and Cannonball in regulation of gene expression during Drosophila melanogaster spermatogenesis. Drosophila Genetics and Genomics Course, 27 July – 4 August 2014, Cambridge, UK

  11. Belyakin SN. Putative mechanism of the SUUR protein action in late replicating regions of Drosophila genome. 11th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-29 June, 2013, Lecce, Italy

  12. Белякин СН. Регуляция репрессированных районов генома в развитии Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  13. Laktionov PP. Identification of transcriptional regulators for testis-specific gene clusters in Drosophila melanogaster. 16th European Workshop on Molecular and Cellular Endocrinology of the Testis, 8-12 May, 2010, La Biodola, Island of Elba, Italy

  14. Белякин СН. Геномные подходы в биологии развития Drosophila melanogaster. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины, 1-2 сентября 2010, Новосибирск

  15. Belyakin SN. Gene density profile reveals the landmarks of late replicated domains in Drosophila melanogaster genome. 9th International Conference on Drosophila Heterochromatin, 23-30 May 2009, Gubbio, Italy

  16. Юрлова АА. Доменная консервативность быстро эволюционирующего гетерохроматинового белка SUUR дрозофилы. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  17. Белякин СН. Плотность генов в поздно реплицирующихся доменах генома Drosophila melanogaster. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

Международное сотрудничество: 

  • The European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany
    Геномный анализ (2002 - 2005)

  • Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Netherlands
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2010)

  • University of Toronto, Canada
    Микрочиповый анализ данных по экспрессии генов (2011 - 2013)

  • Cardiff University, UK
    Исследование семенник-специфичных генов (2011 - 2108)

  • University of Edinburgh, UK
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Charité – Universitätsmedizin Berlin, Germany
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

  • Università degli Studi della Tuscia, Viterbo, Italy
    Неменделевское наследование: консервативные механизмы генетического импринтинга

Награды: 

Медаль и премия РАН для молодых ученых

Белякин СН (2006)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Белякин СН (2007)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Лактионов ПП (2019)
Посух ОВ (2019)

Памятный знак "За труд на благо города"

Шлома ВВ (2003)

 

1 декабря 2016 года проект Indicator.Ru и инициативная группа ученых представили рейтинг молодых исследователей-руководителей проектов, поддержанных грантами РФФИ. В первую сотню рейтинга вошел кбн Белякин СН

Отдел регуляции генетических процессов