Публикации и материалы конференций Лаборатории цитогенетики животных

2018

  • Lemskaya NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR,  Biltueva LS, Proskuryakova AA,  Hallenbeck JM, Perelman PP, Graphodatsky AS. A combined banding method that allows the reliable identification of chromosomes as well as differentiation of AT- and GC-rich heterochromatin. (doi: 10.1007/s10577-018-9589-9Chromosome Res 26(4): 307-315, 2018

  • Беклемишева ВР, Мензоров АГ. Использование вектора на основе вируса Сендай для эффективной трансдукции фибробластов ластоногих. (doi: 10.18699/VJ18.445Вавиловский журнал генетики и селекции 22(8): 1020-1025, 2018
  • Телепова АС, Романенко СА, Лемская НА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Юдкин ДВ. Маркерная хромосома, несущая гены рРНК, сопряженная с интеллектуальной недостаточностью: клинический случай. (doi: 10.17116/molgen201836041199Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 36(4): 199-202, 2018

  • Romanenko S, Serdyukova N, Perelman P, Trifonov V, Golenishchev F, Bulatova N, Stanyon R, Graphodatsky A. Multiple intrasyntenic rearrangements and rapid speciation in voles. (doi: 10.1038/s41598-018-33300-6Sci Reports 8: 14980, 2018

  • Komissarov A, Vij S, Yurchenko A, Trifonov V, Thevasagayam N, Saju J, Sridatta PSR, Purushothaman K, Graphodatsky A, Orbán L, Kuznetsova I. B chromosomes of the Asian seabass (Lates calcarifer) contribute to genome variations at the level of individuals and populations. (doi: 10.3390/genes9100464Genes 9(10): 464, 2018 

  • Pavlova SV, Biltueva LS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Shchinov AV, Abramov AV, Rozhnov VV. First cytogenetic analysis of lesser gymnures (Mammalia, Galericidae, Hylomys) from Vietnam. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27207Comp Cytogenet 12(3): 361-372, 2018

  • Kukekova AV,... Serdyukova NA,... Beklemischeva V,... Perelman PL, Graphodatsky AS,... Zhang G. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours. (doi: 10.1038/s41559-018-0611-6Nature Ecol Evol 2: 1479-1491, 2018 

  • Makunin AI, Romanenko SA, Beklemisheva VR, Perelman PL, Druzhkova AS, Petrova KO, Prokopov DY, Chernyaeva EN, Johnson JL, Kukekova AV, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Sequencing of supernumerary chromosomes of red fox and raccoon dog confirms a non-random gene acquisition by B chromosomes. (doi: 10.3390/genes9080405Genes 9(8): 405, 2018

  • Makunin AI, Rajičić M, Karamysheva TV, Romanenko SA, Druzhkova AS, Blagojević J, Vujošević M, Rubtsov NB, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Low-pass single-chromosome sequencing of human small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) and Apodemus B chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-018-0662-0Chromosoma 127(3): 301–311, 2018

  • Evdokimov A, Kutuzov M, Petruseva I, Lukjanchikova N, Kashina E, Kolova E, Zemerova T, Romanenko S, Perelman P, Prokopov D, Seluanov A, Gorbunova V, Graphodatsky A, Trifonov V, Khodyreva S, Lavrik O. Naked mole rat cells display more efficient excision repair than mouse cells. (doi: 10.18632/aging.101482Aging (Albany NY) 10: 1454-1473, 2018

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Serdukova NA, Ryder OA, Graphodatsky AS. The case of X and Y localization of nucleolus organizer regions (NORs) in Tragulus javanicus (Cetartiodactyla, Mammalia). (doi: 10.3390/genes9060312Genes 9(6): 312, 2018

  • Guselnikov SV, Baranov KO, Najakshin AM, Mechetina LV, Chikaev NA, Makunin AI, Kulemzin SV, Andreyushkova DA, Stöck M, Wuertz S, Gessner J, Warren WC, Schartl M,  Trifonov VA, Taranin AV. Diversity of immunoglobulin light chain genes in non-teleost ray-finned fish uncovers IgL subdivision into five ancient isotypes. (doi: 10.3389/fimmu.2018.01079Front Immunol 9: 1079, 2018

  • Колесникова ИС, Тулупов АА, Дольский АА, Лемская НА, Савелов АА, Петровский ЕД, Антонов АА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Сергеева ИГ, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная экспрессия рРНК у пациента с интеллектуальной недостаточностью и семейным случаем хромосомы 13р+. Бюллетень сибирской медицины 17(1): 243-253, 2018

  • Bikchurina TI, Tishakova KV, Kizilova EA, Romanenko SA, Serdyukova NA, Torgasheva AA, Borodin PM. Chromosome synapsis and recombination in male-sterile and female-fertile interspecies hybrids of the dwarf hamsters (Phodopus, Cricetidae). (doi:10.3390/genes9050227Genes 9(5): 227, 2018

  • Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Graphodatsky AS, Galanina EM, Yudkin DV. Alteration of rRNA gene copy number and expression in patients with intellectual disability and heteromorphic acrocentric chromosomes. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.08.010Egypt J Med Hum Genet 19(2): 129-134, 2018

  • Teeling EC, Vernes SC, Dávalos LM, Ray DA, Gilbert MTP, Myers E, Bat1K Consortium [includes Graphodatsky AS]. Bat biology, genomes, and the Bat1K Project: to generate chromosome-level genomes for all living bat species. (doi: 10.1146/annurev-animal-022516-022811Annu Rev Anim Biosci 6: 23-46, 2018

  • Capozzi O, Stanyon R, Archidiacono N, Ishida T, Romanenko SA, Rocchi M. Rapid emergence of independent “chromosomal lineages” in silvered-leaf monkey triggered by Y/autosome translocation. (doi: 10.1038/s41598-018-21509-4Sci Reports 8: 3250, 2018

  • Perelman PL, Pichler R, Gaggl A, Larkin DM, Raudsepp T, Alshanbari F, Holl HM, Brooks SA, Burger PA, Periasamy K. Construction of two whole genome radiation hybrid panels for dromedary (Camelus dromedarius): 5000RAD and 15000RAD. (doi: 10.1038/s41598-018-20223-5Sci Reports 8: 1982, 2018

  • Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Kolesnikova IS, Yudkin DV. Robertsonian translocation 13/14 associated with rRNA genes overexpression and intellectual disability. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.11.002Egypt J Med Hum Genet 19(2): 141-145, 2018

  • Lemskaya NA. A modified protocol for highly efficient EBV-mediated immortalization of human B lymphocytes from small volumes of peripheral blood serum. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.10.002Egypt J Med Hum Genet 19(3): 221-223, 2018

  • Guselnikov S, Baranov K, Chikaev N, Najakshin A, Kulemzin S, Makunin A, Trifonov V, Taranin A. Mining of non-teleost fish transcriptomes and genomes uncovers the evolutionary history of Immunoglobulin light chains. Proceedings of the Eleventh international conference "Bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology" (BGRS\SB-2018), Novosibirsk, 2018, p. 44

  • Романенко СА, Федорова ЮЕ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Внутрихромосомные перестройки в эволюционно консервативных синтенных блоках полевковых. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 168

  • Побединцева МА, Макунин АИ, Кичигин ИГ, Кулемзина АИ, Сердюкова НА, Романенко СА, Воробьева НВ, Интересова ЕА, Корентович МА, Зайцев ВФ, Мищенко АВ, Заделенов ВА, Юрченко АА, Щербаков ДЮ, Графодатский АС, Трифонов ВА. Популяционная генетика осетровых Сибири. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 156-157

  • Осипов ГВ, Васильев СК, Тиунов МП, Гимранов ДО, Уфыркина ОВ, Воробьева НВ, Дружкова АС, Графодатский АС. Выделение древней ДНК, секвенирование, генотипирование и видовая идентификация некоторых представителей древних кошачьих. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 152

  • Андреюшкова ДА, Макунин АИ, Романенко СА, Билтуева ЛС, Беклемишева ВР, Дружкова АС, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Выявление паралогичных районов в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 93

  • Trifonov VA, Andreyushkova DA, Romanenko SA, Pobedintseva MA, Prokopov DYu, Biltueva LS, Beklemisheva VR, Druzhkova AS, Makunin AI, Graphodatsky AS. Polyploidy and genome evolution of ray-finned fishes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 81

  • Rando HM, Farré M, Johnson JL, Kim J, Zhang G, Perelman PL, Serdyukova NA, Kharlamova AV, Herbeck Yu, Gulevich RG, Vladimirova AV, Trut LN, Graphodatsky AS, O’Brien SJ, Larkin DM, Kukekova AV. Construction of red fox chromosomal fragments from the short-read genome assembly. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 67

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 63

  • Makunin A. Summary of mammalian B chromosome sequencing. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 50

  • Makunin A. Using multiple reference genomes to identify phylogenetically informative markers for amplicon sequencing: an example from Anopheles mosquitoes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 51

  • Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maximova YuV, Shorina AR, Graphodatskiy AS, Yudkin DV. Altered rRNA levels in possible connection to intellectual disability. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 36-37

  • Kichigin IG, Makunin AI, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Studying iguanid and gekkonid sex chromosomes by isolated chromosome sequencing. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 33

  • Druzhkova AS, Makunin AI, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov G, Mamaev N, Ochlopkov I, Kryukov A, Lyapunova E, Kholodova M, Salomashkina V, Seryodkin I, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. The phylogeographical history of the brown bear (Ursus arctos Linnaeus) in Northeast Eurasia. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 18-19

  • Bernegossi AM, Silva DMZA, Tomazella IM, Trifonov VA, Romanenko SA, Serdukova NA, Duarte JMB. Generation of translocated chromosome probes of the Mazama gouazoubira species by microdissection. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 8-9

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution and Ancestral Carnivore Karyotype refinement revealed by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 5-6

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Proskuryakova AA, Romanenko SA, Prokopov DY, Luo S, Uphyrkina OV. Cytogenetic analyses of leopard cat subspecies (Prionailurus bengalensis) revealed Y-chromosome polymorphism. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 4

  • Prokopov DY, Makunin AI, Biltueva LS, Komissarov AS, Sarachakov AE, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Identification and annotation of repetitive DNA in the genome of sterlet (Acipenser ruthenus). Bioinformatics: from algorithms to applications (16-19 July 2018, St Petersburg). Conference proceedings. p. 44-45

  • Прокопов ДЮ. Происхождение и эволюция половых и добавочных хромосом копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus). Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2018". М.: МАКС Пресс, 2018. ISBN 978-5-317-05800-5

  • Trifonov VA, Lisachov AP, Kichigin IG, Makunin AI, Pereira JC, Druzhkova AS, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M. Evolutionary sex chromosome translocations in amniotes. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748Comp Cytogenet 12(3): 304-305, 2018

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromo-some painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748Comp Cytogenet 12(3): 306-307, 2018

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748Comp Cytogenet 12(3): 307-308, 2018 

2017

  • Moskalev AА, Kudryavtseva AV, Graphodatsky AS, Beklemisheva VR, Serdyukova NA, Krutovsky KV, Sharov VV, Kulakovskiy IV, Lando AS, Kasianov AS, Kuzmin DA, Putintseva YuA, Feranchuk SI, Shaposhnikov MV, Fraifeld VE, Toren D, Snezhkina AV, Sitnik VV. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. (doi: 10.1186/s12862-017-1103-zBMC Evol Biol 17 (Suppl 2): 258, 2017

  • Telepova AS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Yudkin DV. X-derived marker chromosome in patient with mosaic Turner syndrome and Dandy-Walker syndrome: a case report. (doi: 10.1186/s13039-017-0344-2Mol Cytogenet 10: 43, 2017

  • Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Biltueva LB, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Next generation sequencing of chromosome-specific libraries sheds light on genome evolution in paleotetraploid sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.3390/genes8110318Genes 8(11): 318, 2017

  • Biltueva LS, Prokopov DY, Makunin AI, Komissarov AS, Kudryavtseva AV, Lemskaya NA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Romanenko SA, Gladkikh OL, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Genomic organization and physical mapping of tandemly arranged repetitive DNAs in sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.1159/000479472Cytogenet Genome Res 152: 148-157, 2017

  • Dymova MA, Zadorozhny AV, Mishukova OV, Khrapov EA, Druzhkova AS, Trifonov VA, Kichigin IG, Tishkin AA, Grushin SP, Filipenko ML. Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Altai. (doi: 10.1111/age.12569Anim Genet 48(5): 615-618, 2017

  • Romanenko SA, Serdyukova NA, Perelman PL, Pavlova SV, Bulatova NS, Golenishchev FN, Stanyon R, Graphodatsky AS. Intrachromosomal rearrangements in rodents from the perspective of comparative region-specific painting. (doi: 10.3390/genes8090215Genes 8(9): 215, 2017

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Larkin DM, Farré M, Kukekova AV, Johnson JL, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Roelke-Parker ME, Bellizzi J, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3390/genes8090216Genes 8(9): 216, 2017

  • Poplavskaya NS, Romanenko SA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Yang F, Nie W, Wang J, Bannikova AA, Surov AV, Lebedev VS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of Cricetulus sokolovi Orlov et Malygin 1988 (Cricetidae, Rodentia) inferred from chromosomal painting and molecular data. (doi: 10.1159/000477521Cytogenet Genome Res 152: 65-72, 2017

  • Chiatante G, Capozzi O, Svartman M, Perelman P, Centrone L, Romanenko S, Ishida T, Valeri M, Roelke-Parker ME, Stanyon R. Centromere repositioning explains fundamental number variability in the New World monkey genus Saimiri. (doi: 10.1007/s00412-016-0619-0Chromosoma 126(4): 519-529, 2017

  • Rajičić M, Romanenko SA, Karamysheva TV, Blagojević J, Adnađević T, Budinski I, Bogdanov AS, Trifonov VA, Rubtsov NB, Vujošević M. The origin of B chromosomes in yellow-necked mice (Apodemus flavicollis) - Break rules but keep playing the game. (doi: 10.1371/journal.pone.0172704PLoS ONE 12(3): e0172704, 2017

  • Dyomin AG, Danilova MI, Mwacharo JM, Masharsky AE, Panteleev AV, Druzhkova AS, Trifonov VA, Galkina SA. Mitochondrial DNA D-loop haplogroup contributions to the genetic diversity of East European domestic chickens from Russia. (doi: 10.1111/jbg.12248J Anim Breed Genet 134(2): 98-108, 2017

  • Druzhkova AS, Makunin AI, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Ovodov ND, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Complete mitochondrial genome of an extinct Equus (Sussemionusovodovi specimen from Denisova cave (Altai, Russia). (doi: 10.1080/23802359.2017.1285209Mitochondrial DNA Part B 2(1): 79-81, 2017

  • Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Rens W. FISH with and without COT1 DNA. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 123-132 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_11)

  • Yang F, Graphodatsky AS. Animal probes and ZOO-FISH. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 395-415 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_42)

  • Колесникова ИС, Дольский АА, Лемская НА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная активность амплифицированных генов рибосомной РНК на хромосоме 13 у ребенка с умственной отсталостью: исследование семейного случая. Молекулярная диагностика 2017. Сборник трудов IХ Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Москва, 2017. с. 76-77

  • Графодатский АС. Хромосомы и геномы домашних, пушных и промысловых млекопитающих. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 26

  • Kukekova AV, Johnson JL, Xiang X, Feng S, Liu S, Rando HM, Kharlamova AV, Herbeck Yu, Serdyukova NA, Xiong Z, Beklemisheva VR, Koepfli K-P, Gulevich RG, Vladimirova AV, Shepeleva DV, Hekman JP, Perelman PL, Graphodatsky AS, O’Brien SJ, Wang X, Clark AG, Acland GM, Zhang G, Trut LN. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviors. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 43

  • Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Kulemzina AI, Biltueva LS, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Revealing of the chromosome synteny regions between sterlet (Acipenser ruthenus) and spotter gar (Lepisosteus oculatus). Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 113

  • Dolskiy AA, Pustylnyak VO, Yarushkin AA, Lemskaya NA, Yudkin DV. Inhibitors of histone deacetylases are weak activators of the FMR1 gene in Fragile X syndrome cell lines. (doi: 10.1155/2017/3582601BioMed Res Int 2017: 3582601, 2017

  • Исанова ЕР, Петровский ЕД, Савелов АА, Юдкин ДВ, Лемская НА, Дольский АА, Тулупов АА. Исследование нейрональной активности головного мозга у пациентов с синдромом ломкой х-хромосомы методом функциональной МРТ. Rus Electron J Radiol (REJR) 7(3): 23-30, 2017

  • Бобокова ТС, Лемская НА, Колесникова ИС, Юдкин ДВ. Метод молекулярно-цитогенетической визуализации ломкого сайта FRAXA. (doi: 10.1134/S0026893317040069Мол Биол 51(4): 704-709, 2017

  • Galanina EM, Tulupov AA, Lemskaya NA, Korostyshevskaya AM, Maksimova YV, Shorina AR, Savelov AA, Sergeeva IG, Isanova ER, Grishchenko IV, Yudkin DV. A female patient with FMR1 premutation and mosaic X chromosome aneuploidy and two sons with intellectual disability. (doi: 10.1159/000453060Mol Syndromol 8: 110-114, 2017

  • Trifonov VA, Makunin AI, Romanenko SA, Biltueva LS, Beklemisheva VR, Pobedintseva MA, Prokopov DYu, Andreyushkova DA, Graphodatsky AS. Whole genome duplications in vertebrate evolution. Mol Cytogenet 10 (Suppl 1): 20(L17), 2017

  • Дружкова АС, Макунин АИ, Воробьева НВ, Васильев СК, Оводов НД, Шуньков МВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Сборка полного митохондриального генома лошади Оводов (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 71, 2017

  • Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Тишкин АА, Трифонов ВА, Графодатский АС. Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 71, 2017

  • Куслий МА, Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Тишкин АА, Попова КО, Графодатский АС, Трифонов ВА, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование древнихлошадей археологического памятника Яломан-II. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 72, 2017

  • Попова КО, Воробьева НВ, Дружкова АС, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Трифонов ВА, Графодатский АС. Изучение древней ДНК: митогеномы и В-хромосомы сибирской косули. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 72, 2017

  • Андреюшкова ДА, Макунин АИ, Беклемишева ВР, Романенко СА, Дружкова АС, Билтуева ЛС, Сердюкова НА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 75, 2017

  • Графодатский АС. Разнообразие геномов млекопитающих на хромосомном уровне. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 76, 2017 

  • Макунин АИ, Прокопов ДЮ, Кичигин ИГ, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Высокопроизводительное секвенированиеотдельных хромосом. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 78, 2017

  • Побединцева МА, Макунин АИ, Дружкова АС, Сердюкова НА, Воробьева НВ, Интересова ЕА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальный геномов. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 78, 2017

  • Прокопов ДЮ, Макунин АИ, Романенко СА, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 79, 2017

  • Трифонов ВА, Макунин АИ, Романенко СА, Беклемишева ВР, Билтуева ЛС, Прокопов ДЮ, Побединцева МА, Дружкова АС, Андреюшкова ДА, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Кудрявцева АВ, Комиссаров АС, Кливер СФ, Шартл М, Графодатский АС. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 80, 2017

2016

  • Галкина СА, Демин АГ, Пантелеев АВ, Дружкова АС, Трифонов ВА, Григорьева НВ. Перспективы и методика анализа ДНК ископаемых костей домашней курицы, обнаруженных при археологических раскопках. В кн. Ладога и проблемы древной и средневековой истории северной Евразии. СПб: Нестор-История, 2016. С. 118-124
  • Gladkikh OL, Romanenko SA, Lemskaya NA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Kovalskaya JM, Smorkatcheva AV, Golenishchev FN, Perelman PL, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Rapid karyotype evolution in Lasiopodomys involved at least two autosome – sex chromosome translocations. (doi: 10.1371/journal.pone.0167653PLoS ONE 11(12): e0167653, 2016

  • Makunin AI, Kichigin IG, Larkin DM, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Yang F, Proskuryakova AA, Vorobieva NV, Chernyaeva EN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Contrasting origin of B chromosomes in two cervids (Siberian roe deer and grey brocket deer) unravelled by chromosomespecific DNA sequencing. (doi: 10.1186/s12864-016-2933-6BMC Genomics 17: 618, 2016

  • Kichigin IG, Giovannotti M, Makunin AI, Ng BL, Kabilov MR, Tupikin AE, Barucchi VC, Splendiani A, Ruggeri P, Rens W, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolutionary dynamics of Anolis sex chromosomes revealed by sequencing of flow sorting-derived microchromosome-specific DNA. (doi: 10.1007/s00438-016-1230-zMol Genet Genomics 291: 1955-1966, 2016

  • Trifonov VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Stanyon R, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of acipenseriform genomes. (doi: 10.1007/s00412-016-0609-2Chromosoma 125: 661-668, 2016

  • Tchurikov NA, Yudkin DV, Gorbacheva MA, Kulemzina AI, Grischenko IV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Kravatsky YuV, Kretova OV. Hot spots of DNA double-strand breaks in human rDNA units are produced in vivo. (doi: 10.1038/srep25866Sci Reports 6: 25866, 2016

  • Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Comparative chromosome map and heterochromatin features of the gray whale karyotype (Cetacea). (doi: 10.1159/000445459Cytogenet Genome Res 148: 25-34, 2016

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, Graphodatsky AS. The ancestral carnivore karyotype as substantiated by comparative chromosome painting of three pinnipeds, the walrus, the steller sea lion and the Baikal seal (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.1371/journal.pone.0147647PLoS ONE 11(1): e0147647, 2016

  • Romanenko SA, Lemskaya NA, Trifonov VA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Bulatova NSh, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Genome-wide comparative chromosome maps of Arvicola amphibius, Dicrostonyx torquatus, and Myodes rutilus. (doi: 10.1007/s10577-015-9504-6Chromosome Res 24: 145-159, 2016

  • Куслий МА, Дружкова АС, Попова КО, Воробьева НВ, Макунин АИ, Юрлова АА, Тишкин АА, Миняев СС, Трифонов ВА, Графодатский АС, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Цитология 58: 304-308, 2016

  • Romanenko SA. Review on cytogenetic studies in mammals. Chromosome Res 24 (Suppl 1): S26-S27, 2016

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Chromosome organization features of the grey whale (Cetacea). Chromosome Res 24 (Suppl 1): S28, 2016 

  • Trifonov  VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Prokopov DY, Vorobieva NV, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of Sturgeon genomes. Cytogenet Genome Res 148: 103, 2016

  • Beklemisheva  V, Perelman P, Lemskaya N, Kulemzina A, Proskuryakova A, Burkanov V, Graphodatsky A. Refinement of the ancestral Carnivore karyotype based on comparative chromosome painting of Pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). Cytogenet Genome Res 148: 105, 2016

  • Жимулев ИФ, Графодатский АС. Хромосома 2015. Цитология 58: 247, 2016

2015

  • Dobrynin P,... Makunin A,... Perelman P,... O’Brien SJ. Genomic legacy of the African cheetah, Acinonyx jubatus. (doi: 10.1186/s13059-015-0837-4Genome Biology 16: 277, 2015

  • Matveevsky S, Bakloushinskaya I, Tambovtseva V, Romanenko S, Kolomiets O. Analysis of meiotic chromosome structure and behavior in Robertsonian heterozygotes of Ellobius tancrei (Rodentia, Cricetidae): a case of monobrachial homology. (doi: 10.3897/CompCytogen.v9i4.5674Comp Cytogenet 9: 691-706, 2015

  • Romanenko SA, Biltueva LS, Serdyukova NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Gladkikh OL, Lemskaya NA, Interesova EA, Korentovich MA, Vorobieva NV, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Segmental paleotetraploidy revealed in sterlet (Acipenser ruthenus) genome by chromosome painting. (doi: 10.1186/s13039-015-0194-8Mol Cytogenet 8: 90, 2015

  • Korolyuk E, Makunin A, Matveeva T. Relationships and generic delimitation of Eurasian genera of the subtribe Asterinae (Astereae, Asteraceae) using molecular phylogeny of ITS. (doi: 10.3906/bot-1410-12Turkish J Botany 39: 808-824, 2015

  • Lemskaya NA, Kartavtseva IV, Rubtsova NV, Golenishchev FN, Sheremetyeva IN, Graphodatsky AS. Chromosome polymorphism in Microtus (Alexandromysmujanensis (Arvicolinae, Rodentia). (doi: 10.1159/000439096Cytogenet Genome Res 146: 238-242, 2015 

  • Дружкова АС, Воробьева НВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Древняя ДНК: итоги и перспективы (к 30-летию начала исследований). Генетика 51: 627–643, 2015

  • Romanenko SA, Perelman PP, Trifonov VA, Serdyukova NA, Li T, Fu B, O’Brien PCM, Ng BL, Nie W, Liehr T, Stanyon R, Graphodatsky AS, Yang F. A first generation comparative chromosome map between guinea pig (Cavia porcellus) and humans. (doi: 10.1371/journal.pone.0127937PLoS ONE 10(5): e0127937, 2015

  • Johnson JL, Kosyza A, Kharlamova AV, Gulevich RG, Perelman PL, Fong HTW, Vladimirova AV, Oskina IN, Trut LN, Kukekova AV. Platinum coat color in red fox (Vulpes vulpes) is caused by a mutation in an autosomal copy of KIT. (doi: 10.1111/age.12270Anim Genet 46: 190-199, 2015

  • Юдкин ДВ, Лемская НА, Грищенко ИВ, Дольский АА. Изменение состава хроматина при экспансии тринуклеотидного повтора CGG в гене fmr1Молекулярная биология 49: 205-211, 2015

2014

  • Biltueva L, Kulemzina A, Vorobieva N, Perelman P, Kochneva M, Zhidenova A, Graphodatsky A. A new case of an inherited reciprocal translocation in cattle: rcp(13;26)(q24;q11). (doi: 10.1159/000368950Cytogenet Genome Res 144: 208-211, 2014

  • Avila F, Baily MP, Perelman P, Das PJ, Pontius J, Chowdhary R, Owens E, Johnson WE, Merriwether DA, Raudsepp T. A comprehensive whole-genome integrated cytogenetic map for the alpaca (Lama pacos). (doi: 10.1159/000370329Cytogenet Genome Res 144: 193-204, 2014

  • Jarvis ED,... Perelman P,... Zhang G. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds. (doi: 10.1126/science.1253451Science 346: 1320-1331, 2014

  • Makunin AI, Dementyeva PV, Graphodatsky AS, Volobujev VT, Kukekova AV, Trifonov VA. Genes on B chromosomes of vertebrates. (doi: 10.1186/s13039-014-0099-yMol Cytogenet 7: 99, 2014

  • Avila F, Das PJ, Kutzler M, Owens E, Perelman P, Rubes J, Hornak M, Johnson WE, Raudsepp T. Development and application of camelid molecular cytogenetic tools. (doi: 10.1093/jhered/ess067J Hered 105: 858-869, 2014

  • Kulemzina AI, Perelman PL, Grafodatskaya DA, Nguyen TT, Thompson M, Roelke-Parker ME, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting of pronghorn (Antilocapra americana) and saola (Pseudoryx nghetinhensis) karyotypes with human and dromedary camel probes. (doi: 10.1186/1471-2156-15-68BMC Genetics 15: 68, 2014

2013

  • Thalmann O,... , Druzhkova A, Graphodatsky A,... Wayne RK. Complete mitochondrial genomes of ancient canines suggest a European origin of domestic dogs. (doi: 10.1126/science.1243650Science 342: 871-874, 2013

  • Kosyakova N, Hamid AB, Chaveerach A, Pinthong K, Siripiyasing P, Supiwong W, Romanenko S, Trifonov V, Fan X. Generation of multicolor banding probes for chromosomes of different species. (doi: 10.1186/1755-8166-6-6Mol Cytogen 6: 6, 2013

  • Bakloushinskaya I, Romanenko SA, Serdukova NA, Graphodatsky AS, Lyapunova EA. A new form of the mole vole Ellobius tancrei Blasius, 1884 (Mammalia, Rodentia) with the lowest chromosome number. (doi: 10.3897/CompCytogen.v7i2.5350Comp Cytogenet 7: 163-169, 2013

  • Cernohorska H, Kubickova S, Kopecna O, Kulemzina AI, Perelman PL, Elder FFB, Graphodatsky A, Rubes J. Molecular cytogenetic insights to the phylogenetic affinities of the giraffe (Giraffa camelopardalis) and pronghorn (Antilocapra americana). (doi: 10.1007/s10577-013-9361-0Chromosome Res 21: 447-460, 2013

  • Trifonov VA, Dementyeva PV, Larkin DM, O’Brien PCM, Perelman PL, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Transcription of a protein-coding gene on b-chromosomes of the siberian roe deer (Capreolus pygargus). (doi: 10.1186/1741-7007-11-90BMC Biology 11: 90, 2013

  • Romanenko SA, Lebedev VS, Serdukova NA, Feoktistova NY, Surov AV, Graphodatsky AS. Comparative cytogenetics of hamsters of the genus Allocricetulus, Argyropulo 1932 (Cricetidae, Rodentia). (doi: 10.1159/000346194Cytogen Genome Res 139: 258-266, 2013

  • Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes. (doi: 10.1371/journal.pgen.1003429PLoS Genet 9(4): e1003429, 2013

  • Druzhkova AS, Thalmann O, Trifonov VA, Leonard JA, Vorobieva NV, Ovodov ND, Graphodatsky AS, Wayne RK. Ancient DNA analysis affirms the canid from Altai as a primitive dog. (doi: 10.1371/journal.pone.0057754PLoS ONE 8(3): e57754, 2013

  • Картавцева ИВ, Шереметьева ИН, Романенко СА, Гладких ОЛ, Рябкова АВ. Изменчивость хромосом полевки Максимовича Microtus maximowiczii (Rodentia, Cricetidae, Microtus). Цитология 55: 261-263, 2013

  • Кулемзина АИ. Эволюция кариотипов подотряда жвачных (Ruminantia). Цитология 55: 264-267, 2013

  • Макунин АИ, Трифонов ВА. Современные методы анализа добавочных хромосом. Цитология 55: 148–152, 2013

  • Косякова Н, Трифонов В, Романенко С, Мкртчан Х, Графодатский А, Лир Т. Многоцветный бэндинг хромосом мыши. Цитология 55: 259-260, 2013

  • Булатова НШ, Павлова СВ, Романенко СА, Сердюкова НА, Голенищев ФН, Малыгин ВМ, Лавренченко ЛА. Молекулярно-цитогенетические маркеры криптических видов и гибридов надвидового комплекса обыкновенных полевок Microtus arvalis s.l. Цитология 55: 268-270, 2013

2012

  • Dumas F, Houck M, Bigoni F, Perelman P, Romanenko SA, Stanyon R. Chromosome painting of the pygmy tree shrew shows that no derived cytogenetic traits link Primates and Scandentia. Cytogen Genome Res 136: 175-179, 2012

  • Bakloushinskaya IY, Matveevsky SN, Romanenko SA, Serdukova NA, Kolomiets OL, Spangenberg VE, Lyapunova EA, Graphodatsky AS. A comparative analysis of the mole vole sibling species Ellobius tancrei and E. talpinus (Cricetidae, Rodentia) through chromosome painting and examination of synaptonemal complex structures in hybrids. Cytogen Genome Res 136: 199-207, 2012

  • Graphodatsky A, Ferguson-Smith MA, Stanyon R. A short introduction to cytogenetics studies in mammals with reference to the present volume. Cytogen Genome Res 137: 83-96, 2012

  • Perelman PL, Beklemisheva VR, Yudkin DV, Petrina TN, Rozhnov VV, Nie W, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting in Carnivora and Pholidota. Cytogen Genome Res 137: 174-193, 2012

  • Rubes J, Musilova P, Kopecna O, Kubickova S, Cernohorska H, Kulemsina AI. Comparative molecular cytogenetics in Cetartiodactyla. Cytogen Genome Res 137: 194-207, 2012

  • Trifonov VA, Musilova P, Kulemsina AI. Chromosome evolution in the Perissodactyla. Cytogen Genome Res 137: 208-217, 2012

  • Romanenko SA, Volobouev V. Non-sciuromorph rodents karyotypes in evolution. Cytogen Genome Res 137: 233-245, 2012

  • Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia. Heredity 108: 4-16, 2012

  • Nie W, Wang J, Su W, Wang D, Tanomtong A, Perelman PL, Graphodatsky AS, Yang F. Chromosomal rearrangements and karyotype evolution in carnivores revealed by chromosome painting. Heredity 108: 17-27, 2012

  • Wong PBY, Wiley EO, Johnson WE, Ryder OA, O’Brien SJ, Haussler D, Koepfli K-P, Houck ML, Perelman P, Mastromonaco G, Bentley AC, Venkatesh B, Zhang Y, Murphy RW. Genome 10K community of scientists: Tissue sampling and standards for vertebrate genomics. GigaScience 1:8, 2012

  • Stanyon R, Graphodatsky A. (Ed’s) Evolutionary dynamics of mammalian karyotypes. Karger, Basel, Switzerland, 2012, 208 pp

2011

  • Perelman P, Johnson WE, Roos C, Seuanez HN, Horvath JE, Moreira MAM, Kessing B, Pontius J, Roelke M, Rumpler Y, Schneider MPC, Silva A, O'Brien SJ, Pecon-Slattery J. A molecular phylogeny of living primates. PLoS Genet 7(3): e1001342, 2011

  • Vorobieva NV, Sherbakov DY, Druzhkova AS, Stanyon R, Tsybankov AA, Vasiljev SK, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Genotyping of Capreolus pygargus fossil DNA from Denisova Cave reveals phylogenetic relationships between ancient and modern populations. PLoS One 6(8): e24045, 2011

  • Beklemisheva VR, Romanenko SA, Biltueva LS, Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdukova NA, Rubtsova NV, Brandler OV, O'Brien PCM, Yang F, Stanyon R, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 19: 549-565, 2011

  • Kulemzina AI, Yang F, Trifonov VA, Ryder OA, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Chromosome painting in Tragulidae facilitates the reconstruction of Ruminantia ancestral karyotype. Chromosome Res 19: 531-539, 2011

  • Duke Becker SE, Thomas R, Trifonov VA, Wayne RK, Graphodatsky AS, Breen M. Anchoring the dog to its relatives reveals new evolutionary breakpoints across 11 species of the Canidae and provides new clues for the role of B chromosomes. Chromosome Res 19: 685-708, 2011

  • Kulemzina AI, Nie W, Trifonov VA, Staroselec Y, Vasenkov DA, Volleth M, Yang F, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting of four Siberian vespertilionidae species with aselliscus stoliczkanus and human probes. Cytogenet Genome Res 134: 200-205, 2011

  • Biltueva L, Vorobieva N, Perelman P, Trifonov V, Volobouev V, Panov V, Ilyashenko V, Onischenko S, O'Brien P, Yang F, Ferguson-Smith M, Graphodatsky A. Karyotype evolution of Eulipotyphla (Insectivora): The genome homology of seven sorex species revealed by comparative chromosome painting and banding data. Cytogenet Genome Res 135: 51-64, 2011

  • Ye J, Nie W, Wang J, Su W, Jing M, Graphodatsky AS, Yang F. Genome-wide comparative chromosome map between human and the Forrest's pika (Ochotona forresti) established by cross-species chromosome painting: Further support for the glires hypothesis. Cytogenet Genome Res 132: 41-46, 2011

  • Graphodatsky AS, Trifonov VA, Stanyon R. The genome diversity and karyotype evolution of mammals. Molecular Cytogenetics 4:22, 2011

2010

  • Dementyeva PV, Trifonov VA, Kulemzina AI, Graphodatsky AS. Reconstruction of the putative Cervidae ancestral karyotype by chromosome painting of Siberian roe deer (Capreolus pygargus) with dromedary probes. Cytogenet Genome Res 128: 228-235, 2010

  • Lemskaya NA, Romanenko SA, Golenishchev FN, Rubtsova NV, Sablina OV, Serdukova NA, O’Brien PCM, Fu B, Yiğit N, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). III. Karyotype relationships of ten Microtus species. Chromosome Res 18: 473-486, 2010 

  • Trifonov VA, Kosyakova N, Romanenko SA, Stanyon R, Graphodatsky AS, Liehr T. New insights into the karyotypic evolution in muroid rodents revealed by multicolor banding applying murine probes. Chromosome Res 18: 265-275, 2010

  • Баклушинская ИЮ, Романенко СА, Графодатский АС, Матвеевский СН, Ляпунова ЕА, Коломиец ОЛ. Роль хромосомных перестроек в эволюции слепушонок рода Ellobius (Rodentia, Mammalia). Генетика 46: 1290-1293, 2010

  • Романенко СА, Лемская НА, Беклемишева ВР, Перельман ПЛ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Сравнительная цитогенетика грызунов. Генетика 46: 1285-1289, 2010

  • Трифонов ВА, Дементьева ПВ, Беклемишева ВР, Юдкин ДВ, Воробьева НВ, Графодатский АС. Добавочные хромосомы, сегментные дупликации и эволюция. Генетика 46: 1234-1236, 2010

  • Кулемзина АИ, Билтуева ЛС, Трифонов ВА, Перельман ПЛ, Староселец ЯЮ, Беклемишева ВР, Воробьева НВ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Сравнительная цитогенетика основных таксонов Laurasiatheria. Генетика 46: 1278-1284, 2010

  • Пристяжнюк ИЕ, Матвеева НМ, Графодатский АС, Сердюкова ИА, Серов ОЛ. Хромосомный состав межвидовых эмбриональных стволовых гибридных клеток мыши. Цитология 52: 136-143, 2010

2009

  • Kulemzina AI, Trifonov VA, Perelman PL, Rubtsova V, Volobuev V, Ferguson-Smith MA, Stanyon R, Yang F, Graphodatsky AS. Cross-species chromosome painting in Cetartiodactyla: reconstructing the karyotype evolution in key phylogenetic lineages. Chromosome Res 17: 419-436, 2009

  • Kukekova AV, Vorobieva NV, Beklemisheva VR, Johnson JL, Temnykh V, Yudkin DV, Trut LN, Andre C, Galibert F, Aguirre GD, Acland GM, Graphodatsky AS. Chromosomal mapping of canine-derived BAC clones to the red fox and American mink genomes. J Heredity 100: S42-S53, 2009

  • Genome 10K Community of Scientists. A proposal to obtain whole genome sequence for 10 000 vertebrate species.
    J Heredity 100: 659-674, 2009

2008

  • Trifonov VA, Stanyon R, Nesterenko AI, Fu B, Perelman PL, O’Brien PCM, Stone G, Rubtsova NV, Houck ML, Robinson TJ, Ferguson-Smith MA, Dobigny G, Graphodatsky AS, Yang F. Multi-directional cross-species painting illuminates the history of karyotypic evolution in Perissodactyla. Chromosome Res 16: 89-107, 2008

  • Graphodatsky AS, Perelman PL, Sokolovskaya NV, Beklemisheva VR, Serdukova NA, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Yang F. Phylogenomics of the dog and fox family (Canidae, Carnivora) revealed by chromosome painting. Chromosome Res 16: 129-143, 2008

  • Graphodatsky AS, Yang F, Dobigny G, Romanenko SA, Biltueva LS, Perelman PL, Beklemisheva VR, Alkalaeva EZ, Serdukova NA, Ferguson-Smith MA, Murphy WJ, Robinson TJ. Tracking genome organization in rodents by ZOO-FISH. Chromosome Res 16: 261-274, 2008

  • Huang L, Nesterenko A, Nie W, Wang J, Su W, Graphodatsky AS, Yang F. Karyotypic evolution of giraffes (Giraffa camelopardalis) revealed by cross-species chromosome painting with Chinese muntjac (Muntiacus reevesi) and human (Homo sapiens) paints. Cytogenet Genome Res 122: 132-138, 2008

  • Trifonov V, Fluri S, Binkert F, Nandini A, Andersen J, Rodriguez L, Gross M, Kosyakova N, Mkrtchyan H, Ewers E, Reich D, Weise A, Liehr T. Complex rearranged small supernumerary marker chromosomes (sSMC), three new cases; evidence for an underestimated entity? Mol Cytogenet 1: 6, 2008

  • Perelman PL, Graphodatsky AS, Dragoo JW, Serdyukova NA, Stone G, Cavagna P, Menotti A, Nie W, O’Brien PCM, Wang J, Burkett S, Yuki K, Yang F, Stanyon R. Chromosome painting shows skunks (Mephitidae, Carnivora) have highly rearranged karyotypes. Chromosome Res 16: 1215-1231, 2008

2007

  • Romanenko SA, Volobouev VT, Perelman PL, Lebedev VS, Serdukova NA, Trifonov VA, Biltueva LS, Nie W, O’Brien PCM, Bulatova NS, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of hamsters (Cricetidae, Muroidea, Rodentia) inferred from chromosomal painting and banding comparison. Chromosome Res 15: 283-297, 2007

  • Balmus G, Trifonov VA, Biltueva LS, O’Brien PCM, Alkalaeva ES, Fu B, Skidmore JA, Allen WR, Graphodatsky AS, Yang F, Ferguson-Smith MA. Cross-species chromosome painting among camel, cattle, pig and human: further insights into the putative Cetartiodactyla karyotype. Chromosome Res 15: 499-514, 2007

  • Sitnikova NA, Romanenko SA, O’Brien PCM, Perelman PL, Fu B, Rubtsova NV, Serdukova NA, Golenishchev FN, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). I. The genome homology of tundra vole, field vole, mouse and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 15: 447-456, 2007

  • Romanenko SA, Sitnikova NA, Serdukova NA, Perelman PL, Rubtsova NV, Bakloushinskaya IY, Lyapunova EA, Just W, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). II. The genome homology of two mole voles (genus Ellobius), the field vole and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 15: 891-897, 2007

  • Yudkin DV, Trifonov VA, Kukekova AV, Vorobieva NV, Rubtsova NV, Yang F, Acland GM, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Assignment of some sequences to Canidae autosomes and B-chromosomes by FISH and PCR-screening. Cytogenet Genome Res 116: 100-103, 2007

  • Kukekova AV, Trut LN, Oskina IN, Johnson JL, Temnykh SV, Kharlamova AV, Shepeleva D, Gulievich RG, Shikhevich SG, Graphodatsky AS, Aguirre GD, Acland GM. A Meiotic Linkage Map of the Silver Fox. Genome Res 17: 387-399, 2007

  • Just W, Baumstark A, Süß A, Graphodatsky A, Rens W, Schäfer N, Bakloushinskaya I, Hameister H, Vogel W. Ellobius lutescens: sex determination and sex chromosome. Sex Dev 1: 211-221, 2007

  • Графодатский АС. Сравнительная хромосомика. Молекулярная Биология 41: 408-422, 2007

  • Пузаков МВ, Баттулин НР, Темирова СА, Матвеева НМ, Сердюкова НА, Графодатский АС, Серов ОЛ. Анализ экспрессии родительских аллелей Xist и Gla в межвидовых эмбриональных гибридных клетках в условиях индуцированной in vitro инактивации X-хромосом. Онтогенез 38: 205-212, 2007