Galaxy семинар / практическое занятие RNA-Seq

Макунин Игорь Васильевич, кбн (University of Queensland, Australia)

Практическое занятие по анализу данных крупномасштабного секвенирования в Galaxy

Galaxy - удобная и простая система для анализа геномных данных, не требующая знаний программирования. Семинар ориентирован на новых пользователей Galaxy с минимальным знанием геномики и крупномасштабного секвенирования 

Занятие будет проводится на сервере http://galaxy-tut.genome.edu.au/galaxy

Программа

1. Базовые понятия крупномасштабного секвенирования
2. RNA-Seq in Galaxy: мы проанализируем данные экспрессии генов на хромосоме 4 дрозофилы. Участники семинара локализуют последовательности, полученные на секвенаторе illumina, (~100,000 последовательностей для каждого эксперимента) в геноме дрозофилы используя tophat и найдут гены с статистически значимой разницей в экспрессии при помощи Cuffdiff
3. Вопросы

Продолжительность семинара: 2 часа
Количество мест: 10
Для участия в семинаре необходимо зарегистрироваться
Участникам понадобится персональные компьютеры с возможностью выхода в сеть
Рекомендуем распечатать инструкцию с сайта виртуальной лаборатории геномики gvl.org.au > Learn > RNA-Seq > Basic Galaxy tutorial