Отдел разнообразия и эволюции геномов

Лаборатория сравнительной геномики

Трифонов Владимир Александрович
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-62

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Трифонов Владимир Александрович зав. лаб. дбн vladatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Билтуева Лариса Семеновна снс кбн bilaratmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Побединцева Мария Алексеевна нс кбн mapobatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Румянцев Александр Васильевич ст. лаб.-иссл.    
        Уткин Ярослав Александрович ст. лаб.-иссл.    
        Тотиков Азамат Альбертович ст. лаб.-иссл.    
        Томаровский Андрей Александрович ст. лаб.-иссл.    
        Лисачева Лада Сергеевна ст. лаб.-иссл.    
        Модина Светлана Андреевна ст. лаб.    
        Яковлев Артём Владимирович ст. лаб.    
        Тишакова Катерина Валерьевна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Власов Евгений Вячеславович ст. лаб.-иссл. совм.    

Бывшие сотрудники:

Андреюшкова Дарья Александровна
Бишани Али
Воробьева Надежда Валентиновна, кбн
Дементьева Полина Владимировна, кбн
Кичигин Илья Геннадьевич
Кливер Сергей Федорович
Попова Ксения Олеговна
Сарачаков Александр Евгеньевич

Направления исследований: 
  • Структура добавочных хромосом
  • Хромосомные системы определения пола
IMCB_DNA_Zoo.JPG

Сотрудники лаборатории составляют филиал международного консорциума DNA Zoo – DNA Zoo Novosibirsk. Задача консорциума - это сборка и исследование трехмерной организации геномов млекопитающих, птиц, рептилий и беспозвоночных

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Обская стерлядь генетически более разнообразна, чем енисейская
Добавочные хромосомы – фабрика для образования новых генов
Эволюционируешь? Удваивайся!
Половые хромосомы ящериц
Как и когда курицы попали на север Европы
Секвенирование ДНК вымершей лошади
Определение пола: хромосомы от X до Z
Скрестить хомяка с уткой не получится
Геномный зоопарк
Исследование осетровых рыб
Рыба мечты… осётр!
Любой вид животных - совокупность решения разных биохимических проблем

gutenberg.jpg Половое размножение. Публичная лекция дбн ВА Трифонова в Просветительском проекте Курилка Гутенберга
you_tube.jpg Полногеномные дупликации и эволюция позвоночных. Публичная лекция дбн ВА Трифонова
you_tube.jpg Мифы и факты об осетровых рыбах. Публичная лекция МА Побединцевой

Публикации: 

  1. Yakupova A, Tomarovsky A, Totikov A, Beklemisheva V, Logacheva M, Perelman PL, Komissarov A, Dobrynin P, Krasheninnikova K, Tamazian G, Serdyukova NA, Rayko M, Bulyonkova T, Cherkasov N, Pylev V, Peterfeld V, Penin A, Balanovska E, Lapidus A, Consortium DZ, O'Brien SJ, Graphodatsky A, Koepfli K-P, Kliver S. Chromosome-length assembly of the Baikal seal (Pusa sibirica) genome reveals a historically large population prior to isolation in lake Baikal. (doi: 10.3390/genes14030619) Genes 14(3): 619, 2023

  2. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DY, Perelman PL, Romanenko SA, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Utkin YA, Nie W, Ferguson-Smith MA, Fentang Y, Graphodatsky AS. Maps of constitutive-heterochromatin distribution for four martes species (Mustelidae, Carnivora, Mammalia) show the formative role of macrosatellite repeats in interspecific variation of chromosome structure. (doi: 10.3390/genes14020489) Genes 14(2): 489, 2023

  3. Lisachov A, Rumyantsev A, Prokopov D, Ferguson-Smith M, Trifonov V. Conservation of major satellite DNAs in snake heterochromatin. (doi: 10.3390/ani13030334) Animals 13(3): 334, 2023

  4. Dumas F, Perelman PL, Biltueva L, Roelke M. Retrotransposon mapping in spider monkey genomes of the family Atelidae (Platyrrhini, Primates) shows a high level of LINE-1 amplification. (doi: 10.4081/jbr.2022.10725) J Biol Res 95(2): 10725, 2022

  5. Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA. New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri. (doi: 10.1134/S003294522206011X) J Ichthyol 62(7): 1230-1236, 2022

  6. Karamysheva TV, Gayner TA, Elisaphenko EA, Trifonov VA, Zakirova EG, Orishchenko KE, Prokhorovich MA, Lopatkina ME, Skryabin NA, Lebedev IN, Rubtsov NB. The Precise breakpoint mapping in paracentric inversion 10q22.2q23.3 by comprehensive cytogenomic analysis, multicolor banding, and single-copy chromosome sequencing. (doi.org/10.3390/biomedicines10123255) Biomedicines 10(12): 3255, 2022

  7. Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA. Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania). (doi: 10.3390/ijms232415838) Int J Mol Sci 23(24): 15838, 2022

  8. Ochkalova S, Korchagin V, Vergun A, Urin A, Zilov D, Ryakhovsky S, Girnyk A, Martirosyan I, Zhernakova DV, Arakelyan M, Danielyan F, Kliver S, Brukhin V, Komissarov A, Ryskov A. First genome of rock lizard Darevskia valentini involved in formation of several parthenogenetic species. (doi: 10.3390/genes13091569) Genes 13(9): 1569, 2022

  9. Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs. (doi: 10.3390/ijms232113063) Int J Mol Sci 23(21): 13063, 2022

  10. Romanenko S, Trifonov V. Chapter 3. Generation of microdissection-derived painting probes from single copy chromosomes. In: Liehr T (ed.) Cytogenetics and Molecular Cytogenetics, CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 2022, pp 27-34 (doi: 10.1201/9781003223658)

  11. Milioto V, Perelman PL, Paglia LL, Biltueva L, Roelke M, Dumas F. Mapping retrotransposon LINE-1 sequences into two Cebidae species and Homo sapiens genomes and a short review on primates. (doi: 10.3390/genes13101742) Genes 13(10): 1742, 2022

  12. de Ferran V, ..., Kliver S, Serdyukova N, ..., Eizirik E. Phylogenomics of the world’s otters. (doi: 10.1016/j.cub.2022.06.036) Curr Biol 32(16): 3650-3658.e4, 2022

  13. Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА. Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири. (doi: 10.35885/1996-1499-15-2-38-42) Российский журнал биологических инвазий 15(2): 38-42, 2022

  14. Derežanin L, Blažytė A, Dobrynin P, Duchêne DA, Grau JH, Jeon S, Kliver S, Koepfli K-P, Meneghini D, Preick M, Tomarovsky A, Totikov A, Fickel J, Förster DW. Multiple types of genomic variation contribute to adaptive traits in the mustelid subfamily Guloninae. (doi: 10.1111/mec.16443) Mol Ecol 31(10): 2898-2919, 2022 

  15. Molodtseva AS, Makunin AI, Salomashkina VV, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov GG, Mamaev N, Okhlopkov IM, Kryukov AP, Lyapunova EA, Kholodova MV, Seryodkin IV, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Phylogeography of ancient and modern brown bears from eastern Eurasia. (doi: 10.1093/biolinnean/blac009) Biol J Linn Soc 135(4): 722-733, 2022

  16. Rajičić M, Makunin A, Adnađević T, Trifonov V, Vujošević M, Blagojević J. B chromosomes’ sequences in yellow-necked mice Apodemus flavicollis — exploring the transcription. (doi: 10.3390/life12010050) Life 12(1): 50, 2022

  17. Volleth M, Müller S, Heller K-G, Trifonov V, Liehr T, Yong H-S, Baker RJ, Khan FAA, Sotero-Caio CG. Cytogenetic analyses detect cryptic diversity in Megaderma spasma from Malaysia. (doi: 10.3161/15081109ACC2021.23.2.001) Acta Chiropterologica 23(2): 271–284, 2021

  18. Shevchenko AK, Zhernakova DV, Malov SV, Komissarov A, Kolchanova SM, Tamazian G, Antonik A, Cherkasov N, Kliver S, Turenko A, Rotkevich M, Evsyukov I, Vlahov D, Thami PK, Gaseitsiwe S, Novitsky V, Essex M, O’Brien SJ. Genome-wide association study reveals genetic variants associated with HIV-1C infection in a Botswana study population. (doi: 10.1073/pnas.2107830118) Proc Natl Acad Sci USA 118(47): e2107830118, 2021

  19. Никитин СВ, Князев СП, Трифонов ВА, Проскурякова АА, Шмидт ЮД, Шатохин КС, Запорожец ВИ, Башур ДС, Коршунова ЕВ, Ермолаев ВИ. Необычная врожденная полидактилия мини-свиней селекционной группы ИЦиГ СО РАН. (doi: 10.18699/VJ21.074) Вавиловский журнал генетики и селекции 25(6): 652-660, 2021

  20. Tamazian G, Dobrynin P, Zhuk A, Zhernakova DV, Perelman PL, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Komissarov A, Kliver S, Cherkasov N, Scott AF, Mohr DW, Koepfli K-P, O’Brien SJ, Krasheninnikova K. Draft de novo genome assembly of the elusive jaguarundi, Puma yagouaroundi. (doi: 10.1093/jhered/esab036) J Heredity 112(6): 540-548, 2021

  21. Кливер СФ. Полногеномный подход в природоохранной биологии и его перспективы. (doi: 10.17816/ecogen65152) Экологическая генетика 19(3): 281-298, 2021

  22. Sharakhova M, Trifonov V. Chromosome-centric view of genome organization and evolution. (doi: 10.3390/genes12081237) Genes 12(8): 1237, 2021

  23. Totikov A, Tomarovsky A, Prokopov D, Yakupova A, Bulyonkova T, Derezanin L, Rasskazov D, Wolfsberger WW, Koepfli K-P, Oleksyk TK, Kliver S. Chromosome-level genome assemblies expand capabilities of genomics for conservation biology. (doi: 10.3390/genes12091336) Genes 12(9): 1336, 2021

  24. Hempel E, Westbury MV, Grau JH, Trinks A, Paijmans JLA, Kliver S, Barlow A, Mayer F, Müller J, Chen L, Koepfli K-P, Hofreiter M, Bibi F. Diversity and paleodemography of the addax (Addax nasomaculatus), a Saharan antelope on the verge of extinction. (doi: 10.3390/genes12081236) Genes 12(8): 1236, 2021

  25. Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 193-209 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  26. Buggiotti L, Yurchenko AA, Yudin NS, Vander Jagt CJ, Vorobieva NV, Kusliy MA, Vasiliev SK, Rodionov AN, Boronetskaya OI, Zinovieva NA, Graphodatsky AS, Daetwyler HD, Larkin DM. Demographic history, adaptation, and NRAP convergent evolution at amino acid residue 100 in the world northernmost cattle from Siberia. (doi: 10.1093/molbev/msab078) Mol Biol Evol 38(8): 3093-3110, 2021

  27. Lisachov AP, Tishakova KV, Romanenko SA, Molodtseva AS, Prokopov DYu, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Whole-chromosome fusions in the karyotype evolution of Sceloporus (Iguania, Reptilia) are more frequent in sex chromosomes than autosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0099) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1833): 20200099, 2021

  28. Karamysheva T, Romanenko S, Makunin A, Rajičić M, Bogdanov A, Trifonov V, Blagojević J, Vujošević M, Orishchenko K, Rubtsov N. New data on organization and spatial localization of B-chromosomes in cell nuclei of the yellow-necked mouse Apodemus flavicollis. (doi: 10.3390/cells10071819) Cells 10(7): 1819, 2021

  29. Volleth M, Khan FAA, Müller S, Baker RJ, Arenas-Viveros D, Stevens RD, Trifonov V, Liehr T, Heller K-G, Sotero-Caio CG. Cytogenetic investigations in Bornean Rhinolophoidea revealed cryptic diversity in Rhinolophus sedulus entailing classification of Peninsular Malaysia specimens as a new species. (doi: 10.3161/15081109ACC2021.23.1.001) Acta Chiropterologica 23(1): 1-20, 2021

  30. Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian M, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. (doi: 10.3390/genes12070964) Genes 12(7): 964, 2021

  31. Höhne C, Prokopov D, Kuhl H, Du K, Klopp C, Wuertz S, Trifonov V, Stöck M. The immune system of sturgeons and paddlefish (Acipenseriformes): a review with new data from a chromosome‐scale sturgeon genome. (doi: org/10.1111/raq.12542) Rev Aquacult 13(3): 1709-1729, 2021

  32. Lisachov A, Andreyushkova D, Davletshina G, Prokopov D, Romanenko S, Galkina S, Saifitdinova A, Simonov E, Borodin P, Trifonov V. Amplified fragments of an autosome-borne gene constitute a significant component of the W sex chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). (doi: 10.3390/genes12050779) Genes 12(5): 779, 2021

  33. Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Molodtseva AS, Perelman PL, Interesova EA, Beklemisheva VR, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolution of tandemly arranged repetitive DNAs in three species of Cyprinoidei with different ploidy levels. (doi: 10.1159/000513274) Cytogenet Genome Res 161: 32-42, 2021

  34. Kolchanova S, Komissarov A, Kliver S, Mazo-Vargas A, Afanador Y, Velez-Valentín J, de la Rosa RV, Castro-Marquez S, Rivera-Colon I, Majeske AJ, Wolfsberger WW, Hains T, Corvelo A, Martinez-Cruzado J-C, Glenn TC, Robinson O, Koepfli K-P, Oleksyk TK. Molecular phylogeny and evolution of Amazon parrots in the Greater Antilles. (doi: 10.3390/genes12040608) Genes 12(4): 608, 2021

  35. Трифонов ВА Шаймуратова ДН, Асылгараева ГШ, Монахов СП, Молодцева АС, Аськеев АО, Аськеев ИВ, Аськеев ОВ. Археогеномика доместикации животных Евразии. (doi: 10.24852/pa2021.1.35.179.186) Поволжская Археология 1(35): 179-186, 2021

  36. Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron age mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. In: 
    eds. Caramelli D, Lari M, Vai S (eds) Ancient and Archaic Genomes, MDPI, Switzerland, 2021, pp 5-19

  37. Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron Age Mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. (doi: 10.3390/genes12030412) Genes 12(3): 412, 2021

  38. Побединцева МА, Решетникова СН, Сердюкова НА, Бишани А, Трифонов ВА, Интересова ЕА. Генетическая гетерогенность серебряного карася Carassius gibelio (Cyprinidae) в бассйне средней Оби. (doi: 10.31857/S0016675821040111) Генетика 57(4): 429-436, 2021

  39. Evdokimov A., Popov A., Ryabchikova E., Koval O., Romanenko S., Trifonov V., Petruseva I., Lavrik I., Lavrik O. Uncovering molecular mechanisms of regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.18632/aging.202577) Aging (Albany NY) 13(3): 3239-3253, 2021

  40. Pan Q, ..., Trifonov V, ..., Guiguen Y. The rise and fall of the ancient northern pike master sex determining gene. (doi: 10.7554/eLife.62858) eLife 10: e62858, 2021

  41. Iannucci A, Makunin AI, Lisachov AP, Ciofi C, Stanyon R, Svartman M, Trifonov VA. Bridging the gap between vertebrate cytogenetics and genomics with single-chromosome sequencing (ChromSeq). (doi: 10.3390/genes12010124) Genes 12(1): 124, 2021

  42. Jevit MJ, Davis BW, Castaneda C, Hillhouse A, Juras R, Trifonov VA, Tibary A, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Raudsepp T. An 8.22 Mb assembly and annotation of the alpaca (Vicugna pacos) Y chromosome. (doi: 10.3390/genes12010105) Genes 12(1): 105, 2021

​Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0015 (122011800125-7) Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Трифонов ВА, Фофанов МВ. Паттерны редиплоидизации после полногеномных дупликаций у животных. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 85

  2. Fofanov MV, Prokopov DYu, Trifonov VA, Beklemisheva VR, Khan R, Aiden E, Graphodatsky AS, Perelman PL. Comparative bioinformatic analysis of Hi-C chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 113-114

  3. Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DYu, Romanenko SA, Serdyukova NA, Utkin YaA, Graphodatsky AS. Detailed analysis of distribution of repetitive sequences across genomes of Martes (Mustelidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 137-138

  4. Romanenko SA, Proskuryakova AA, Prokopov DYu, Davletshina GI, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 167-168

  5. Tishakova K, Prokopov D, Davletshina G, O’Brien P, Ferguson-Smith M, Giovannotti M, Trifonov V. Composition of sex chromosomes of veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Squamata) reveals new insights into sex chromosome evolution of iguanian lizards. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 179

  6. Куслий МА, Тишкин АА, Воробьева НВ, Семибратов ВП, Кирюшин КЮ, Ковалев АА, Эрдэнэбаатар Д, Графодатский АС. Палеогенетические определения мастей и пола у лошадей из древних памятников Алтая. С. 323-328. В кн.: Материалы XI Международной научной конференции "Древние культуры Монголии, Южной Сибири и Северного Китая" (doi: 10.31600/978-5-907298-19-4.323-328). Абакан, 2021

  7. Popov A, Evdokimov A, Ryabchikova E, Koval O, Romanenko S, Trifonov V, Petruseva I, Lavrik I, Lavrik O. Regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 466 (P-08.4-13), 2021

  8. Totikov A, Tomarovsky A, Derezanin L, Dudchenko O, Lieberman-Aiden E, Koepfli K, Kliver S. Chromosome-level genome assemblies: expanded capabilities for conservation biology research. (doi: 10.3390/IECGE-07149) Proceedings 76(1): 10, 2021

  9. Румянцев АВ, Тишакова КВ. Получение и характеристика хромосомспецифичных зондов йеменского хамелеона (Chamaeleo calyptratus). Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2020. с. 544-545. ISBN 978-5-4437-1114-0

  10. Tishakova K, Prokopov D, Kichigin I, Molodtseva A, Kratochvil L, Lisachov A, Trifonov V. Analysis of sequenced chromosome-specific libraries of gekkonids sheds light to large scale genome reshuffling in reptiles. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-164) Novosibirsk, 2020, p. 260

  11. Popov A, Evdokimov A, Petruseva I, Romanenko S, Trifonov V, Koval O, Lavrik I, Ryabchikova E, Lavrik O. Regulated cell death in Hetherocephalus glaber. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-365) Novosibirsk, 2020, p. 597

  12. Davletshina G, Kliver S, Prokopov D, Interesova E, Trifonov V. Application of ITS1 and ITS2 for population genetic studies of sturgeons (Acipenseridae). The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-133) Novosibirsk, 2020, p. 209

  13. Fofanov M, Sheglova T, Trifonov V, Schartl M. Bioinformatic methods applied to the analysis of the genes retained after the whole genome duplication events in the sterlet genome (Acipenser ruthenus). (doi: 10.1109/CSGB51356.2020.9214587) Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, pp 53-56

  14. Воробьева НВ, Куслий МА, Дружкова АС, Макунин АИ, Попова КО, Трифонов ВА, Графодатский АС, Васильев СК, Полосьмак НВ, Молодин ВИ. Филогеография древних лошадей из курганов плато Укок. C. 232-235. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  15. Куслий МА, Хан Н, Тишкин АА, Кирюши КЮ, Фаж А, Воробьева НВ, Графодатский АС, Орландо Л. Предварительные результаты молекулярно-генетического анализа остеологических материалов от древних лошадей из поселений Новоильинеп-III и VI (Кулундинская степь). Труды VI (XXII) Всероссийского археологического съезда в Самаре. В 3-х томах. Том. III. с. 253-255. Самара, 2020, ISBN: 978-5-8428-1171-7

​Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Trifonov VA. Лекция “Evolution of Sex determination”. Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil, 26 July 2019

  2. Trifonov V. Origin and evolution of mammalian B chromosomes. 4th B Chromosome Conference. 20-23 July 2019, Botucatu, Brazil

  3. Трифонов ВА. Параллелизм и конвергенция в эволюции половых хромосом позвоночных. VII съезд ВОГиС, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, 18-22 июня 2019, Санкт-Петербург

  4. Trifonov VA. Polyploidy and genome evolution of ray-finned fishes. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  5. Kichigin IG. Studying anolis and gekkota sex chromosomes by isolated chromosome sequencing. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  6. Trifonov V. Evolutionary sex chromosome translocations in amniotes. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  7. Трифонов ВА. Курс лекций "Фундаментальные и прикладные аспекты сравнительной геномики". Красноярский государственный медицинский университет им. проф. ВФ Войно-Ясенецкого Минздрава России, май 2018

  8. Побединцева МА. Генетическое разнообразие древней и современной стерляди (Acipenser ruthenus) в бассейне Волги. XXV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов", 9-13 апреля 2018, Москва

  9. Трифонов ВА. Эволюционная пластичность геномов. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  10. Trivonof V. Whole genome duplications in vertebrate evolution. 11th European Cytogenetics Conference, 1-4 July 2017, Florence, Italy

  11. Трифонов В. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  12. Андреюшкова Д. Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  13. Побединцева М. Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальных геномов. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics, University of Cambridge, UK
    Эволюция кариотипов и половых хромосом рептилий

  • National Cancer Institute at Frederick, MD, USA
    Сравнительная геномика млекопитающих

  • Cornell University, Ithaca, NY, USA
    Сравнительная геномика

  • University of North Carolina at Chapel Hill, NC, USA
    Сравнительная геномика

  • Institut für Humangenetik, Jena, Germany
    Сравнительная геномика

  • Julius-Maximilians-Universität Würzburg, Germany
    Организация геномов и эволюция осетровых

  • Muséum national d'histoire naturelle, Paris, France
    Сравнительная геномика

  • Università degli Studi di Firenze, Florence, Italy
    Сравнительная геномика

  • Università Politécnica delle Marche, Ancona, Italy
    Исследование половых хромосом

  • Kunming Institute of Zoology, China
    Сравнительная геномика

  • Zhejiang Ocean University, China
    Исследование половых хромосом

  • Universidade de São Paulo, Câmpus de Rio Claro, Brasil
    Цитогенетика неотропических рыб

  • Universidade Estadual Paulista, São Paulo, Brazil
    Сравнительная геномика

  • Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brasil
    Исследование неоцентромер

  • Institute for Biological Research "Siniša Stanković", Belgrade, Serbia
    Исследование добавочных хромосом

  • Univerzita Karlova, Praha, Czech Republick
    Сравнительная геномика

Награды: 

Медаль Минобрнауки РФ 
“За вклад в реализацию государственной политики в области научно-технического развития”

Трифонов ВА (2021)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Трифонов ВА (2008)

Премия РАН имени НК Кольцова

Трифонов ВА (2021)

Премия РАН для молодых ученых им. ВЕ Соколова

Трифонов ВА (2005)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Трифонов ВА (2007)

Памятный знак "За труд на благо города"

Воробьева НВ (2013, 2018)

Трифонов ВА (2023)

Звание “Лучший аспирант РАН”

Дементьева ПВ (2011)

Отдел регуляции генетических процессов