Отдел разнообразия и эволюции геномов

Лаборатория сравнительной геномики

Трифонов Владимир Александрович
Ведущий научный сотрудник
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-62

Состав лаборатории: 
        ФИО Должность Ученая
степень		 Контакты
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Трифонов Владимир Александрович внс / зав. лаб. кбн vladatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Воробьева Надежда Валентиновна снс кбн vornatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Билтуева Лариса Семеновна снс кбн bilaratmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpgscopus_logo.jpgscopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Беклемишева (Еремина) Виолетта Робертовна нс кбн beklatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Прокопов Дмитрий Юрьевич мнс    
  scopus_logo.jpg     Побединцева Мария Алексеевна ст. лаб.-иссл.    
        Попова Ксения Олеговна ст. лаборант    
  scopus_logo.jpg     Андреюшкова Дарья Александровна мнс (совместитель)    

Бывшие сотрудники

Дементьева Полина Владимировна, кбн
Кичигин Илья Геннадьевич
Сарачаков Александр Евгеньевич

Направления исследований: 
  1. Структура добавочных хромосом
  2. Хромосомные системы определения пола

Популярное изложение результатов исследований и публичные лекции:

Эволюционируешь? Удваивайся!
Половые хромосомы ящериц
Как и когда курицы попали на север Европы
Секвенирование ДНК вымершей лошади
Определение пола: хромосомы от X до Z
Скрестить хомяка с уткой не получится
Геномный зоопарк
Исследование осетровых рыб
Рыба мечты… осётр!
Любой вид животных - совокупность решения разных биохимических проблем

you_tube.jpg Полногеномные дупликации и эволюция позвоночных. Публичная лекция кбн ВА Трифонова
you_tube.jpg Мифы и факты об осетровых рыбах. Публичная лекция МА Побединцевой

Публикации за последние 5 лет: 

  1. Kukekova AV,... Serdyukova NA,... Beklemischeva V,... Perelman PL, Graphodatsky AS,... Zhang G. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours. Nature Ecol Evol, 2018, doi: 10.1038/s41559-018-0611-6

  2. Pobedintseva MA, Makunin AI, Kichigin IG, Kulemzina AI, Serdyukova NA, Romanenko SA, Vorobieva NV, Interesova EA, Korentovich MA, Zaytsev VF, Mischenko AV, Zadelenov VA, Yurchenko AA, Sherbakov DYu, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Population genetic structure and phylogeography of sterlet (Acipenser ruthenus, Acipenseridae) in the Ob and Yenisei river basins. Mitochondrial DNA Part A, 2018, doi: 10.1080/24701394.2018.1467409

  3. Makunin AI, Romanenko SA, Beklemisheva VR, Perelman PL, Druzhkova AS, Petrova KO, Prokopov DY, Chernyaeva EN, Johnson JL, Kukekova AV, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Sequencing of supernumerary chromosomes of red fox and raccoon dog confirms a non-random gene acquisition by B chromosomes. (doi: 10.3390/genes9080405) Genes 9(8): 405, 2018

  4. Makunin AI, Rajičić M, Karamysheva TV, Romanenko SA, Druzhkova AS, Blagojević J, Vujošević M, Rubtsov NB, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Low-pass single-chromosome sequencing of human small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) and Apodemus B chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-018-0662-0) Chromosoma 127(3): 301–311, 2018

  5. Evdokimov A, Kutuzov M, Petruseva I, Lukjanchikova N, Kashina E, Kolova E, Zemerova T, Romanenko S, Perelman P, Prokopov D, Seluanov A, Gorbunova V, Graphodatsky A, Trifonov V, Khodyreva S, Lavrik O. Naked mole rat cells display more efficient excision repair than mouse cells. (doi: 10.18632/aging.101482) Aging (Albany NY) 10: 1454-1473, 2018

  6. Guselnikov SV, Baranov KO, Najakshin AM, Mechetina LV, Chikaev NA, Makunin AI, Kulemzin SV, Andreyushkova DA, Stöck M, Wuertz S, Gessner J, Warren WC, Schartl M,  Trifonov VA, Taranin AV. Diversity of immunoglobulin light chain genes in non-teleost ray-finned fish uncovers IgL subdivision into five ancient isotypes. (doi: 10.3389/fimmu.2018.01079) Front Immunol 9: 1079, 2018

  7. Sangpakdee W, Tanomtong A, Chaveerach A, Pinthong K, Trifonov V, Loth K, Hensel C, Liehr T, Weise A, Fan X. Molecular cytogenetic analysis of one african and five asian macaque species reveals identical karyotypes as in mandrill. (doi: 10.2174/1389202918666170721115047) Curr Genomics 19(3): 207-215, 2018

  8. de Oliveira EA, Sember A, Bertollo LAC, Yano CF, Ezaz T, Moreira-Filho O, Hatanaka T, Trifonov V, Liehr T, Al-Rikabi ABH, Ráb P, Pains H, de Bello Cioffi M. Tracking the evolutionary pathway of sex chromosomes among fishes: characterizing the unique XX/XY1Y2 system in Hoplias malabaricus (Teleostei, Characiformes). (doi: 10.1007/s00412-017-0648-3) Chromosoma 127(1): 115-128, 2018

  9. Moskalev AА, Kudryavtseva AV, Graphodatsky AS, Beklemisheva VR, Serdyukova NA, Krutovsky KV, Sharov VV, Kulakovskiy IV, Lando AS, Kasianov AS, Kuzmin DA, Putintseva YuA, Feranchuk SI, Shaposhnikov MV, Fraifeld VE, Toren D, Snezhkina AV, Sitnik VV. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol 17(Suppl 2): 258, 2017

  10. Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Biltueva LB, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Next generation sequencing of chromosome-specific libraries sheds light on genome evolution in paleotetraploid sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.3390/genes8110318) Genes 8(11): 318, 2017

  11. Гусельников СВ, Баранов КО, Кулемзин СВ, Макунин АИ, Трифонов ВА, Таранин АВ. Легкие Цепи иммуноглобулинов стерляди Acipenser ruthenus: генерируемое разнообразие и молекулярная эволюция. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 27

  12. Kukekova AV, Johnson JL, Xiang X, Feng S, Liu S, Rando HM, Kharlamova AV, Herbeck Yu, Serdyukova NA, Xiong Z, Beklemisheva VR, Koepfli K-P, Gulevich RG, Vladimirova AV, Shepeleva DV, Hekman JP, Perelman PL, Graphodatsky AS, O’Brien SJ, Wang X, Clark AG, Acland GM, Zhang G, Trut LN. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviors. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 43

  13. Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Kulemzina AI, Biltueva LS, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Revealing of the chromosome synteny regions between sterlet (Acipenser ruthenus) and spotter gar (Lepisosteus oculatus). Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 113

  14. Biltueva LS, Prokopov DY, Makunin AI, Komissarov AS, Kudryavtseva AV, Lemskaya NA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Romanenko SA, Gladkikh OL, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Genomic organization and physical mapping of tandemly arranged repetitive DNAs in sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.1159/000479472) Cytogenet Genome Res 152: 148-157, 2017

  15. Dymova MA, Zadorozhny AV, Mishukova OV, Khrapov EA, Druzhkova AS, Trifonov VA, Kichigin IG, Tishkin AA, Grushin SP, Filipenko ML. Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Altai. (doi: 10.1111/age.12569) Anim Genet 48(5): 615-618, 2017

  16. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Larkin DM, Farré M, Kukekova AV, Johnson JL, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Roelke-Parker ME, Bellizzi J, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3390/genes8090216) Genes 8(9): 216, 2017

  17. Poplavskaya NS, Romanenko SA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Yang F, Nie W, Wang J, Bannikova AA, Surov AV, Lebedev VS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of Cricetulus sokolovi Orlov et Malygin 1988 (Cricetidae, Rodentia) inferred from chromosomal painting and molecular data. (doi: 10.1159/000477521) Cytogenet Genome Res 152: 65-72, 2017

  18. Trifonov VA, Makunin AI, Romanenko SA, Biltueva LS, Beklemisheva VR, Pobedintseva MA, Prokopov DYu, Andreyushkova DA, Graphodatsky AS. Whole genome duplications in vertebrate evolution. Mol Cytogenet 10(Suppl 1): 20(L17), 2017

  19. Дружкова АС, Макунин АИ, Воробьева НВ, Васильев СК, Оводов НД, Шуньков МВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Сборка полного митохондриального генома лошади Оводов (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 71, 2017

  20. Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Тишкин АА, Трифонов ВА, Графодатский АС. Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 71, 2017

  21. Куслий МА, Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Тишкин АА, Попова КО, Графодатский АС, Трифонов ВА, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование древнихлошадей археологического памятника Яломан-II. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 72, 2017

  22. Попова КО, Воробьева НВ, Дружкова АС, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Трифонов ВА, Графодатский АС. Изучение древней ДНК: митогеномы и В-хромосомы сибирской косули. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 72, 2017

  23. Андреюшкова ДА, Макунин АИ, Беклемишева ВР, Романенко СА, Дружкова АС, Билтуева ЛС, Сердюкова НА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 75, 2017

  24. Гусельников СВ, Кулемзин СВ, Горчаков АА, Чикаев НА, Макунин АИ, Трифонов ВА, Таранин АВ. Изучение перестраиваемых цепей Т-клеточного рецептора у стерляди Acipenser ruthenus с использованием платформы Illumina MiSeq. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 76, 2017

  25. Макунин АИ, Прокопов ДЮ, Кичигин ИГ, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Высокопроизводительное секвенированиеотдельных хромосом. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 78, 2017

  26. Побединцева МА, Макунин АИ, Дружкова АС, Сердюкова НА, Воробьева НВ, Интересова ЕА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальный геномов. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 78, 2017

  27. Прокопов ДЮ, Макунин АИ, Романенко СА, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Изучение кариатида копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом. Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 79, 2017

  28. Трифонов ВА, Макунин АИ, Романенко СА, Беклемишева ВР, Билтуева ЛС, Прокопов ДЮ, Побединцева МА, Дружкова АС, Андреюшкова ДА, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Кудрявцева АВ, Комиссаров АС, Кливер СФ, Шартл М, Графодатский АС. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 80, 2017

  29. Трифонов ВА, Макунин АИ, Романенко СА, Беклемишева ВР, Билтуева ЛС, Прокопов ДЮ, Побединцева МА, Дружкова АС, Андреюшкова ДА, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Кудрявцева АВ, Комиссаров АС, Кливер СФ, Шартл М, Графодатский АС. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). Acta Naturae 9(Спецвыпуск 1): 80, 2017

  30. Lisachov AP, Trifonov VA, Giovannotti M, Ferguson-Smith MA, Borodin PM. Heteromorphism of “homomorphic” sex chromosomes in two Anole species (Squamata, Dactyloidae) revealed by synaptonemal complex analysis. (doi: 10.1159/000460829) Cytogenet Genome Res 151: 89-95, 2017

  31. Volleth M, Son NT, Wu Y, Li Y, Yu W, Lin L-K, Arai S, Trifonov V, Liehr T, Harada M. Comparative chromosomal studies in Rhinolophus formosae and R. luctus from China and Vietnam: elevation of R. l. lanosus to species rank. (doi: 10.3161/15081109ACC2017.19.1.003) Acta Chiropterologica 19(1): 41-50, 2017

  32. Giovannotti M, Trifonov VA, Paoletti A, Kichigin IG, O’Brien PCM, Kasai F, Giovagnoli G, Ng BL, Ruggeri P, Nisi Cerioni P, Splendiani A, Pereira JC, Olmo E, Rens W, Caputo Barucchi V, Ferguson-Smith MA. New insights into sex chromosome evolution in anole lizards (Reptilia, Dactyloidae). (doi: 10.1007/s00412-016-0585-6) Chromosoma 126(2): 245-260, 2017

  33. Kubicova E, Trifonov V, Borovecki F, Liehr T, Rincic M, Kosyakova N, Hussein SS. First molecular cytogenetic characterization of murine malignant mesothelioma cell line AEl7 and in silico translation to the human genome. (doi: 10.2174/1574893611666160606164459) Curr Bioinform 12(1): 11-18, 2017

  34. Rajičić M, Romanenko SA, Karamysheva TV, Blagojević J, Adnađević T, Budinski I, Bogdanov AS, Trifonov VA, Rubtsov NB, Vujošević M. The origin of B chromosomes in yellow-necked mice (Apodemus flavicollis) - Break rules but keep playing the game. (doi: 10.1371/journal.pone.0172704) PLoS ONE  12(3): e0172704, 2017

  35. Dyomin AG, Danilova MI, Mwacharo JM, Masharsky AE, Panteleev AV, Druzhkova AS, Trifonov VA, Galkina SA. Mitochondrial DNA D-loop haplogroup contributions to the genetic diversity of East European domestic chickens from Russia. (doi: 10.1111/jbg.12248) J Anim Breed Genet 134(2): 98-108, 2017

  36. Lisachov AP, Trifonov VA, Giovannotti M, Ferguson-Smith MA, Borodin PM. Immunocytological analysis  of  meiotic  recombination  in  two  anole  lizards  (Squamata, Dactyloidae). (doi: 10.3897/CompCytogen.v11i1.10916) Comp Cytogen 11(1): 129-141, 2017 

  37. Druzhkova AS, Makunin AI, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Ovodov ND, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Complete mitochondrial genome of an extinct Equus (Sussemionus) ovodovi specimen from Denisova cave (Altai, Russia). (doi: 10.1080/23802359.2017.1285209) Mitochondrial DNA Part B 2(1): 79-81, 2017

  38. Yano CF, Bertollo LAC, Ezaz T, Trifonov V, Sember A, Liehr T, Cioffi MB. Highly conserved Z and molecularly diverged W chromosomes in the fish genus Triportheus (Characiformes, Triportheidae). (doi: 10.1038/hdy.2016.83) Heredity 118: 276-283, 2017

  39. Yang F, Trifonov V, Ng BL, Kosyakova N, Carter NP. Generation of paint probes from flow-sorted and microdissected chromosomes. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 63-79 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_6)

  40. Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Rens W. FISH with and without COT1 DNA. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 123-132 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_11)

  41. Галкина СА, Демин АГ, Пантелеев АВ, Дружкова АС, Трифонов ВА, Григорьева НВ. Перспективы и методика анализа ДНК ископаемых костей домашней курицы, обнаруженных при археологических раскопках. В кн. Ладога и проблемы древной и средневековой истории северной Евразии. СПб: Нестор-История, 2016. С. 118-124

  42. Lisachov AP, Trifonov VA, Giovannotti M, Ferguson-Smith MA, Borodin PM. Meiotic synapsis and recombination in two Anolis species (Dactyloidae, Reptilia). Chromosome Res 24(Suppl 1): S24-S25, 2016

  43. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Chromosome organization features of the grey whale (Cetacea). Chromosome Res 24(Suppl 1): S28, 2016

  44. Trifonov  VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Prokopov DY, Vorobieva NV, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of Sturgeon genomes. Cytogenet Genome Res 148: 103, 2016

  45. Beklemisheva  V, Perelman P, Lemskaya N, Kulemzina A, Proskuryakova A, Burkanov V, Graphodatsky A. Refinement of the ancestral Carnivore karyotype based on comparative chromosome painting of Pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). Cytogenet Genome Res 148: 105, 2016

  46. Gladkikh OL, Romanenko SA, Lemskaya NA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Kovalskaya JM, Smorkatcheva AV, Golenishchev FN, Perelman PL, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Rapid karyotype evolution in Lasiopodomys involved at least two autosome – sex chromosome translocations. (doi: 10.1371/journal.pone.0167653) PLoS ONE 11(12): e0167653, 2016

  47. Kichigin IG, Giovannotti M, Makunin AI, Ng BL, Kabilov MR, Tupikin AE, Barucchi VC, Splendiani A, Ruggeri P, Rens W, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolutionary dynamics of Anolis sex chromosomes revealed by sequencing of flow sorting-derived microchromosome-specific DNA. (doi: 10.1007/s00438-016-1230-z) Mol Genet Genomics 291: 1955-1966, 2016

  48. Trifonov VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Stanyon R, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of acipenseriform genomes. (doi: 10.1007/s00412-016-0609-2) Chromosoma 125: 661-668, 2016

  49. Makunin AI, Kichigin IG, Larkin DM, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Yang F, Proskuryakova AA, Vorobieva NV, Chernyaeva EN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Contrasting origin of B chromosomes in two cervids (Siberian roe deer and grey brocket deer) unravelled by chromosomespecific DNA sequencing. (doi: 10.1186/s12864-016-2933-6) BMC Genomics 17: 618, 2016

  50. Kuznetsova IS, Ostromyshenskii DI, Komissarov AS, Prusov AN, Waisertreiger IS, Gorbunova AV, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Podgornaya OI. LINE-related component of mouse heterochromatin and complex chromocenters’ composition. (doi: 10.1007/s10577-016-9525-9) Chromosome Res 24: 309-323, 2016

  51. Sessions SK, Bizjak Mali L, Green DM, Trifonov V, Ferguson-Smith M. Evidence for sex chromosome turnover in Proteid salamanders. (doi: 10.1159/000446882) Cytogenet Genome Res 148: 305-313, 2016

  52. Montiel EE, Badenhorst D, Lee LS, Literman R, Trifonov V, Valenzuela N. Cytogenetic insights into the evolution of chromosomes and sex determination reveal striking homology of turtle sex chromosomes to amphibian autosomes. (doi: 10.1159/000447478) Cytogenet Genome Res 148: 292-304, 2016

  53. Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Comparative chromosome map and heterochromatin features of the gray whale karyotype (Cetacea). (doi: 10.1159/000445459) Cytogenet Genome Res 148: 25-34, 2016

  54. Bian C,... Trifonov V,... Shi Q. The Asian arowana (Scleropages formosus) genome provides new insights into the evolution of an early lineage of teleosts. (doi: 10.1038/srep24501) Sci Repts 6: 24501, 2016

  55. Vij S,... Trifonov V,...Orbán L. Chromosomal-level assembly of the Asian seabass genome using long sequence reads and multi-layered scaffolding. (doi: 10.1371/journal.pgen.1005954) PLoS Genet 12(4): e1005954, 2016

  56. Utsunomia R, Silva DM, Ruiz-Ruano FJ, Araya-Jaime C, Pansonato-Alves JC, Scacchetti PC, Hashimoto DT, Oliveira C, Trifonov VA, Porto-Foresti F, Camacho JP, Foresti F. Uncovering the ancestry of B chromosomes in Moenkhausia sanctaefilomenae (Teleostei, Characidae). (doi: 10.1371/journal.pone.0150573) PLoS One 11(3): e0150573, 2016

  57. Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, Graphodatsky AS. The ancestral carnivore karyotype as substantiated by comparative chromosome painting of three pinnipeds, the walrus, the steller sea lion and the Baikal seal (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.1371/journal.pone.0147647) PLoS ONE 11(1): e0147647, 2016

  58. Romanenko SA, Lemskaya NA, Trifonov VA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Bulatova NSh, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Genome-wide comparative chromosome maps of Arvicola amphibius, Dicrostonyx torquatus, and Myodes rutilus. (doi: 10.1007/s10577-015-9504-6) Chromosome Res 24: 145-159, 2016

  59. Куслий МА, Дружкова АС, Попова КО, Воробьева НВ, Макунин АИ, Юрлова АА, Тишкин АА, Миняев СС, Трифонов ВА, Графодатский АС, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Цитология 58: 304-308, 2016

  60. Кичигин ИГ, Андреюшкова ДА, Побединцева МА, Трифонов ВА. Многообразие типов генетического определения пола лучеперых рыб (Actinopterygii). Цитология 58: 405-411, 2016

  61. Romanenko SA, Biltueva LS, Serdyukova NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Gladkikh OL, Lemskaya NA, Interesova EA, Korentovich MA, Vorobieva NV, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Segmental paleotetraploidy revealed in sterlet (Acipenser ruthenus) genome by chromosome painting. (doi: 10.1186/s13039-015-0194-8) Mol Cytogenet 8: 90, 2015

  62. Trifonov VA, Paoletti A, Caputo Barucchi V, Kalinina T, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M. Comparative chromosome painting and NOR distribution suggest a complex hybrid origin of triploid Lepidodactylus lugubris (Gekkonidae). (doi: 10.1371/journal.pone.0132380) PLoS ONE 10(7): e0132380, 2015

  63. Дружкова АС, Воробьева НВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Древняя ДНК: итоги и перспективы (к 30-летию начала исследований). Генетика 51: 627–643, 2015

  64. Romanenko SA, Perelman PP, Trifonov VA, Serdyukova NA, Li T, Fu B, O’Brien PCM, Ng BL, Nie W, Liehr T, Stanyon R, Graphodatsky AS, Yang F. A first generation comparative chromosome map between guinea pig (Cavia porcellus) and humans. (doi: 10.1371/journal.pone.0127937) PLoS ONE 10(5): e0127937, 2015

  65. Weise A, Kosyakova N, Voigt M, Aust N, Mrasek K, Löhmer S, Rubtsov N, Karamysheva TV, Trifonov VA, Hardekopf D, Jančušková T, Pekova S, Wilhelm K, Liehr T, Fan X. Comprehensive analyses of white-handed gibbon chromosomes enables access to 92 evolutionary conserved breakpoints compared to the human genome. (doi: 10.1159/000381764) Cytogenet Genome Res 145: 42-49, 2015

  66. Pokorná MJ, Trifonov VA, Rens W, Ferguson-Smith MA, Kratochvíl L. Low rate of interchromosomal rearrangements during old radiation of gekkotan lizards (Squamata: Gekkota). (doi: 10.1007/s10577-015-9468-6) Chromosome Res 23: 299-309, 2015

  67. Avila F, Baily MP, Merriwether DA, Trifonov VA, Rubes J, Kutzler MA, Chowdhary R, Janečka J, Raudsepp T. A cytogenetic and comparative map of camelid chromosome 36 and the minute in alpacas. (doi: 10.1007/s10577-014-9463-3) Chromosome Res 23: 237-251, 2015

  68. Fan X, Supiwong W, Weise A, Mrasek K, Kosyakova N, Tanomtong A, Pinthong K, Trifonov VA, de Bello Cioffi M, Grothmann P, Liehr T, de Oliveira EHC. Comprehensive characterization of evolutionary conserved breakpoints in four New World Monkey karyotypes compared to Chlorocebus aethiops and Homo sapiens. (doi: 10.1016/j.heliyon.2015.e00042) Heliyon 1(3): e00042, 2015

  69. Biltueva L, Kulemzina A, Vorobieva N, Perelman P, Kochneva M, Zhidenova A, Graphodatsky A. A new case of an inherited reciprocal translocation in cattle: rcp(13;26)(q24;q11). (doi: 10.1159/000368950) Cytogenet Genome Res 144: 208-211, 2014

  70. Makunin AI, Dementyeva PV, Graphodatsky AS, Volobujev VT, Kukekova AV, Trifonov VA. Genes on B chromosomes of vertebrates. (doi: 10.1186/s13039-014-0099-y) Mol Cytogenet 7: 99, 2014

  71. Fan X, Sangpakdee W, Tanomtong A, Chaveerach A, Pinthong K, Pornnarong S, Supiwong W, Trifonov VA, Hovhannisyan GG, Aroutiounian RM, Liehr T, Weise A. Molecular cytogenetic analysis of Thai southern pig-tailed macaque (Macaca nemestrina) by multicolor banding. Proc Yerevan State University. Chem Biol 1: 46-50, 2014 

  72. Fan X, Sangpakdee W, Tanomtong A, Chaveerach A, Pinthong K, Pornnarong S, Supiwong W, Trifonov V, Hovhannisyan G, Loth K, Hensel C, Liehr T, Weise A. Comprehensive molecular cytogenetic analysis of Barbary macaque (Macaca sylvanus).  Biol J Armenia 66(1): 98-102, 2014

  73. Cioffi MB, Liehr T, Trifonov V, Molina WF, Bertollo LAC. Independent sex chromosome evolution in lower vertebrates: A molecular cytogenetic overview in the Erythrinidae fish family. (doi: 10.1159/000354039) Cytogen Genome Res 141: 186-194, 2013

  74. Kosyakova N, Hamid AB, Chaveerach A, Pinthong K, Siripiyasing P, Supiwong W, Romanenko S, Trifonov V, Fan X. Generation of multicolor banding probes for chromosomes of different species. (doi: 10.1186/1755-8166-6-6) Mol Cytogen 6: 6, 2013

  75. Parise-Maltempi PP, da Silva EL, Rens W, Dearden F, O'Brien PCM, Trifonov V, Ferguson-Smith MA. Comparative analysis of sex chromosomes in Leporinus species (Teleostei, Characiformes) using chromosome painting. (doi: 10.1186/1471-2156-14-60) BMC Genetics 14: 60, 2013

  76. Trifonov VA, Dementyeva PV, Larkin DM, O’Brien PCM, Perelman PL, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Transcription of a protein-coding gene on b-chromosomes of the siberian roe deer (Capreolus pygargus). (doi: 10.1186/1741-7007-11-90) BMC Biology 11: 90, 2013

  77. Leibiger C, Kosyakova N, Mkrtchyan H, Glei M, Trifonov V, Liehr T. First molecular cytogenetic high resolution characterization of the NIH 3T3 cell line by murine multicolor banding. (doi: 10.1369/0022155413476868) J Histochem Cytochem 61: 306-312, 2013

  78. Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes. (doi: 10.1371/journal.pgen.1003429) PLoS Genet 9(4): e1003429, 2013

  79. Druzhkova AS, Thalmann O, Trifonov VA, Leonard JA, Vorobieva NV, Ovodov ND, Graphodatsky AS, Wayne RK. Ancient DNA analysis affirms the canid from Altai as a primitive dog. (doi: 10.1371/journal.pone.0057754) PLoS ONE 8(3): e57754, 2013

  80. Макунин АИ, Трифонов ВА. Современные методы анализа добавочных хромосом. Цитология 55: 148–152, 2013

  81. Кичигин ИГ, Трифонов ВА. Структура генома и определение пола чешуйчатых (Squamata). Цитология 55: 253-258, 2013

  82. Косякова Н, Трифонов В, Романенко С, Мкртчан Х, Графодатский А, Лир Т. Многоцветный бэндинг хромосом мыши. Цитология 55: 259-260, 2013

Публикации старше 5 лет

Действующие гранты: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2018-0011 Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Гранты РНФ

18-44-04007 Полиплоидная организация геномов и эволюция осетровых (Acipenseridae). Трифонов ВА

Завершенные гранты

Избранные доклады: 

  1. Trifonov V. Evolutionary sex chromosome translocations in amniotes. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  2. Beklemisheva V. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, June 9-12, 2018, Saint-Petersburg, Russia

  3. Трифонов ВА. Курс лекций "Фундаментальные и прикладные аспекты сравнительной геномики". Красноярский государственный медицинский университет им. проф. ВФ Войно-Ясенецкого Минздрава России, май 2018

  4. Trivonof V. Whole genome duplications in vertebrate evolution. 11th European Cytogenetics Conference, 1-4 July 2017, Florence, Italy

  5. Трифонов В. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  6. Андреюшкова Д. Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  7. Прокопов Д. Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  8. Побединцева М. Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальных геномов. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 18-23 июня 2017, Новосибирск

  9. Трифонов ВА. Сравнительная геномика осетровых: эволюционный и прикладной аспекты. Международная конференция "Водные экосистемы Сибири и перспективы их использования", 22-24 ноября 2016, Томск

  10. Побединцева МА. Генетическое разнообразие осетровых (Acipenseridae) в Обь- Иртышском бассейне. Международная конференция "Водные экосистемы Сибири и перспективы их использования", 22-24 ноября 2016, Томск

  11. Прокопов ДЮ. Разработка молекулярно-цитогенетических маркеров для идентификации хромосом осетровых. Международная конференция "Водные экосистемы Сибири и перспективы их использования", 22-24 ноября 2016, Томск

  12. Beklemisheva V. Refinement of the ancestral carnivore karyotype based on the comparative chromosome painting of pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). 21st International Chromosome Conference. 10-13 July 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  13. Trifonov V. Evolutionary plasticity of sturgeon genomes. 21st International Chromosome Conference. 10-13 July 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

  14. Trifonov VA. Application of molecular cytogenetic technologies for the study of sex chromosomes. Meeting intended to facilitate design of strategies to study the impact of mitonuclear incompatibilities in the diversification of animals. 14-16 October 2015, University of A Coruña, Spain

  15. Трифонов ВА. Геномика определения пола позвоночных. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  16. Побединцева МА. Генетический анализ стерляди Acipenser ruthenus в бассейне реки Обь. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  17. Кичигин ИГ. Изучение половых хромосом ящериц рода Anolis с помощью новых биоинформатических методов. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  18. Трифонов ВА. Эволюционная геномика осетровых (Acipenseridae). Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  19. Кичигин ИГ. Эволюция половых хромосом в роде анолисов (Anolis). Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  20. Трифонов ВА. Эволюция половых хромосом и определения пола у позвоночных. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, 3-5 сентября 2014, Новосибирск

  21. Trifonov VA. Molecular composition and evolution of cervid B chromosomes. 3rd B-Chromosome Conference, 7-9 April 2014, Gatersleben, Germany

  22. Trifonov VA. Amplification of genes on mammalian B chromosomes. The 19th International Chromosome Conference. 2-6 September 2013, Bologna, Italy

  23. Трифонов В. Изучение эволюции половых хромосом рептилий с помощью высокопроизводительного секвенирования хромосомспецифичных библиотек. Международная конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике". 21-25 июля 2013, Новосибирск

  24. Трифонов ВА. Recent technical advances in molecular cytogenetics. Лекция в Университете штата Сан Паулу, кампус Риу Клару, Бразилия, ноябрь 2012

  25. Трифонов ВА. Хромосомная эволюция рептилий. Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  26. Билтуева ЛС. Хромосомная эволюция насекомоядных (Eulipotyphla). Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  27. Беклемишева ВР. Молекулярная цитогентика семейства виверровых (Viverridae). Международная конференция Хромосома-2012, 2-7 сентября 2012, Новосибирск

  28. Biltueva LS. Karyotype evolution of Eulipotyphla. The genome homology of Sorex species revealed by comparative chromosome painting and banding data. VIth European Congress of Mammology, 19-23 July 2011, Paris, France

  29. Trifonov VA. Amplification of genes on mammalian B chromosomes. Second Conference of Brazilian Cytogenetics, 28-30 August 2011, Aguas de Lindoia, Brazil

  30. Трифонов ВА. Добавочные хромосомы, сегментные дупликации и эволюция. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  31. Воробьева НВ. Генотипирование ископаемой ДНК Capreolus pygargus Денисовой пещеры; Филогенетические взаимоотношения с современными популяциями. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  32. Билтуева ЛС. Сравнительная цитогенетика насекомоядных. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  33. Беклемишева ВР. Сравнительный хромосомный анализ белкообразных грызунов и зайцеобразных. Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  34. Trifonov VA. Isolation and analysis of coding sequences from B-chromosomes of the Red Fox (Vulpes vulpes) and Siberian Roe Deer (Capreolus pygargus). 2nd Congress of the International Cytogenetics and Genome Society and Digital Scientific UK Users Group Meeting, 25-29 June 2006, Canterbury, UK

  35. Biltueva L. Karyotypic relationships in the Insectivora. The 8th Meeting of the International Sorex araneus Cytogenetic Committee (ISACC). 8-12 August 2008, York, UK

Международное сотрудничество: 

  1. Центр сравнительной геномики, Университет Кэмбриджа, Великобритания
    Изучение кариотипической эволюции и половых хромосом рептилий

  2. Национальный институт рака, Фредерик, США
    Сравнительная геномика млекопитающих

  3. Корнельский университет, Итака, США
    Сравнительная геномика

  4. Университет Северной Каролины, Чапел Хилл, США
    Сравнительная геномика

  5. Институт генетики человека, Йена, ФРГ
    Сравнительная геномика

  6. Музей истории природы, Париж, Франция
    Сравнительная геномика

  7. Университет Флоренции, Италия
    Сравнительная геномика

  8. Политехнический университет Марке, Анкона, Италия
    Исследование половых хромосом

  9. Институт зоологии, Куньминь, КНР
    Сравнительная геномика

  10. Морской и рыболовный институт провинции Чжэцзян, Чжэцзянский океанический университет, Китай
    Исследование половых хромосом

  11. Университет штата Сан-Пауло, кампус Рио-Карло, Сан-Пауло, Бразилия
    Цитогенетика неотропических рыб

  12. Университет Вюрцбурга, ФРГ
    Организация геномов и эволюция осетровых

  13. Институт биологических исследований "Синиша Станкович”, Белград, Югославия
    Исследование добавочных хромосом

Награды: 

Звание “Лучший аспирант РАН”

Дементьева ПВ (2011)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Трифонов ВА (2008)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Трифонов ВА (2007)

Премия РАН для молодых ученых им. ВЕ Соколова

Трифонов ВА (2005)

Отдел регуляции генетических процессов