Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Терлецкий Александр Витальевич нс кбн terletskyatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна мнс    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаб.    
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Титов Сергей Евгеньевич снс совм. кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна нс совм. кбн juliaveratmcb [dot] nsc [dot] ru
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совм. кбн  
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Иванов Михаил Константинович нс совм. кбн  
        Ковынев Игорь Борисович нс совм. кбн  
      eLIBRARY_logo.png Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм. кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Маслов Константин Анатольевич ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Гришко Екатерина Олеговна
Гунбин Константин Владимирович
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна
Сердюкова Ольга Станиславовна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Титов СЕ, Лукьянов СА, Козорезова ЕС, Деменков ПС, Сергийко СВ, Веряскина ЮА, Воробьев СЛ, Слепцов ИВ, Гостимский АВ. Валидация дооперационной диагностики злокачественных опухолей щитовидной железы с помощью молекулярного классификатора. (doi: 10.37469/0507-3758-2022-68-6-741-751) Вопросы онкологии 68(6): 741-751, 2022

  2. Mikhailova AG, ... Gunbin K, Popadin K. A mitochondria-specific mutational signature of aging: increased rate of A > G substitutions on the heavy strand (doi: 10.1093/nar/gkac779) Nucleic Acids Res 50(18): 10264-10277, 2022

  3. Титов СЕ. Молекулярный тест для дооперационной диагностики узловых образований щитовидной железы. Наука и технологии Сибири 4(7): 35-38, 2022

  4. Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Гацкая СС, Люсиков ОМ, Гордей ИА. Молекулярно-цитогенетические методы, направленные на создание эффективной технологии получения гибридов тритикале и секалотритикум. Наука и технологии Сибири 4(7): 78-82, 2022

  5. Казачков ЕЛ, Семенов ЮА, Веряскина ЮА, Казачкова ЭА, Чижовская АВ. Профиль экспрессии ряда микроРНК в плаценте при своевременных и преждевременных родах. (doi: 10.31549/2542-1174-2022-6-1-22-37) Journal of Siberian Medical Sciences 6(1): 22-37, 2022

  6. Veryaskina YA, Titov SE, Zhimulev IF. Reference genes for qPCR-based miRNA expression profiling in 14 human tissues. (doi: 10.1159/000524283) Med Princ Pract 31: 322-332, 2022

  7. Рябинин ВА, Акимов ИА, Синяков АН, Пичко НП, Иванов МК. Диагностика рекомбинантной формы вируса гепатита С RF1_2k/1b с использованием микрочипа, функционирующего по принципу “много зондов/один спот”. (doi: 10.31857/S0132342322010092) Биоорганическая химия 48(1): 109-114, 2022

  8. Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF. The profile of microRNA expression in bone marrow in non-Hodgkin’s lymphomas. (doi: 10.3390/diagnostics12030629) Diagnostics 12(3): 629, 2022

  9. Veryaskina YuA, Titov SE, Ivanov MK, Ruzankin PS, Tarasenko AS, Shevchenko SP, Kovynev IB, Stupak EV, Pospelova TI, Zhimulev IF. Selection of reference genes for quantitative analysis of microRNA expression in three different types of cancer. (doi: 10.1371/journal.pone.0254304) PLoS ONE 17(2): e0254304, 2022

  10. Elisafenko EA, Evtushenko EV, Vershinin AV. The origin and evolution of a two-component system of paralogous genes encoding the centromeric histone CENH3 in cereals. (doi: 10.1186/s12870-021-03264-3) BMC Plant Biol 21: 541, 2021

  11. Vershinin AV, Lux T, Gundlach H, Elisafenko EA, Keilwagen J, Mayer KFX, Spannagl M. The gene and repetitive element landscape of the rye genome. In: "The Rye Genome" (Rabanus-Wallace MT, Stein N, Eds), Springer, pp 117-133, 2021 (doi: 10.1007%2F978-3-030-83383-1_8)

  12. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Schubert V, Houben A, Vershinin AV. Expression of two rye CENH3 variants and their loading into centromeres. (doi: 10.3390/plants10102043) Plants 10(10): 2043, 2021

  13. Сергийко СВ, Лукьянов СА, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Романчишен АФ, Гостимский АВ, Казачков ЕЛ, Пастернак ИА. Прогностические возможности молекулярно-генетического тестирования для оценки риска рецидива папиллярного рака щитовидной железы у детей. (doi: 10.37469/0507-3758-2021-67-4-511-517) Вопросы онкологии 67(4): 511-517, 2021

  14. Ivanov MK, Titov SE, Dzyubenko VV, Glushkov SA, Krasilnikov SE, Mansurova AS, Malek AV, Berlev IV, Prisyazhnaya TS, Kuleshova SV, Hodkevich AA, Lancuhaj YA, Dimitriadi TA, Agletdinov EF. Detection of cervical lesions and cancer in air-dried cytologic smears by combined analysis of mRNA and miRNA expression levels. (doi: 10.1016/j.jmoldx.2021.01.016) J Mol Diagn 23(5): 541-554, 2021

  15. Titov SE, Poloz TL, Veryaskina YA, Anishchenko VV. Cytological and molecular diagnosis of Hürthle cell thyroid tumors: Analysis of three cases. (doi: 10.3892/mco.2021.2311) Mol Clin Oncol 15(1): 149, 2021

  16. Konnikova MR, Cherkasova OP, Nazarov MM, Vrazhnov DA, Kistenev YV, Titov SE, Kopeikina EV, Shevchenko SP, Shkurinov AP. Malignant and benign thyroid nodule differentiation through the analysis of blood plasma with terahertz spectroscopy. (doi: 10.1364/BOE.412715) Biomed Opt Express 12(2): 1020-1035, 2021

  17. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Мудунов АМ, Доброхотова ВЗ, Козорезова ЕС, Воробьев СЛ, Важенин АВ, Романчишен АФ, Вабалайте КВ, Вилкова АС, Тимофеева НИ, Ильина ТЕ. Новые возможности дооперационной диагностики анапластического рака щитовидной железы (doi: 10.17650/2222-1468-2021-11-1-34-40) Опухоли головы и шеи 11(1): 34-40, 2021

  18. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ковынев ИБ, Федорова СС, Поспелова ТИ, Жимулёв ИФ. микроРНК при миелодиспластическом синдроме. (doi: 10.32607/actanaturae.11209) Acta Naturae 13(2): 4-15, 2021

  19. Titov SE, Kozorezova ES, Demenkov PS, Veryaskina YA, Kuznetsova IV, Vorobyev SL, Chernikov RA, Sleptsov IV, Timofeeva NI, Ivanov MK. Preoperative typing of thyroid and parathyroid tumors with a combined molecular classifier. (doi: 10.3390/cancers13020237) Cancers 13(2): 237, 2021

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0014 (122011400181-7) Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Elisafenko EA, Evtushenko EV, Vershinin AV. Tracing the origin and evolution of the locus containing paralogous CENH3 genes in cereals. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 144-145

  2. Evtushenko E, Elisafenko E, Gatskaya S, Vershinin A. CENH3 gene duplication leads to heterogeneous organization of centromeric chromatin in rye. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 602-603

  3. Koroleva AG, Maximova NV, Sapozhnikova YuP, Timoshkin OA, Zaytseva EP, Sitnikova TYa, Evtushenko EV, Vershinin AV, Sukhanova LV, Glyzina OYu, Kirilchik SV. Telomere biology of Baikal hydrobionts. (doi: 10.31951/2658-3518-2020-A-4-614) Limnology and Freshwater Biology 3(4, SI:7VBC): 614-615, 2020

  4. Титов СЕ, Иванов МК, Веряскина ЮА, Деменков ПС, Шевченко СП, Катанян ГА, Лукьянов СА. Выявление злокачественных опухолей щитовидной железы в мазках с неопределенным цитологическим заключением с помощью молекулярного классификатора. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 112

  5. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Воронцова ЕВ, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 270

  6. Абикеева ТА, Иванов МК, Дзюбенко ВВ. Выявление метилироваения генома вируса папилломы человека 16 типа для ранней диагностики тяжелых интраэпителиальных неоплазий и рака шейки матки. Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2020. с. 367-369. ISBN 978-5-4437-1114-0

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Гацкая С. CENH3 gene duplication leads to heterogeneous organization of centromeric chromatin in rye. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  2. Веряскина ЮА. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020", 25-28 июня 2020, Санкт-Петербург

  3. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Вершинин АВ. Структура центромер и эволюция. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  5. Титов СЕ. МикроРНК - молекулярные маркеры онкологических заболеваний. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  6. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  7. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

  • John Innes Centre, Norwich, UK
    Мобильные элементы гороха

Патенты: 

  • Титов СЕ, Лукьянов СА, Сергийко СВ, Веряскина ЮА. Способ дооперационной дифференциальной диагностики анапластического рака щитовидной железы. Патент на изобретение №2759128. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 09.11.2021

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Памятный знак "За труд на благо города"

Вершинин АВ (2013)

Отдел регуляции генетических процессов