Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория хромосомной инженерии

Демаков Сергей Анатольевич
внс

Curriculum Vitae

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Демаков Сергей Анатольевич внс дбн demakovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Волкова Елена Игоревна снс кбн volkatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенкова Наталья Григорьевна снс кбн anataatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Андреенков Олег Владимирович снс кбн andreenkovatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Шварц Мария Борисовна мнс   berkaevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Сафонкина Мария Викторовна ст. лаб.    
        Силютина Наталья Юрьевна ст. лаб.    
        Корнеева Любовь Алексеевна ст. лаб.    
        Тихомиров Савелий Алексеевич ст. лаб.-иссл. совм.    

Бывшие сотрудники:

Богуславский Денис Анатольевич
Гончарова Алла Анатольевна
Зыкова Татьяна Юрьевна, кбн
Николаев Дмитрий Алексеевич		 Панкова Татьяна Евгеньевна
Попова Ольга Олеговна
Прудникова Мария Максимовна
Сидоренко Дарья Сергеевна, кбн

Направления исследований: 
  • Молекулярно-генетическая организация междисков политенных хромосом
  • Механизмы, обеспечивающие декомпактное состояние и функционирование междисков
  • Генетические факторы, вовлеченные в регуляцию высших уровней организации интерфазного хроматина

Публикации: 

  1. Volkova EI, Dorogova NV, Andreyenkov OV, Tikhomirov SA, Demakov SA. New mutations in the 5′ region of the Notch gene affect Drosophila melanogaster oogenesis. (doi: 10.3390/jdb10030032) J Dev Biol 10(3): 32, 2022

  2. Andreyenkov OV, Volkova EI, Andreyenkova NG, Demakov SA. Using the CRISPR/Cas9 system for dissection of functional sites of the Notch gene in Drosophila melanogaster. In: "Notch Signaling Research" (Jia D Ed.) Methods in Molecular Biology 2472: 1-14, 2022. Humana, New York, NY (doi: 10.1007/978-1-0716-2201-8_1)

  3. Literák I, Škrábal J, Karyakin I, Andreyenkova N, Vazhov S. Black kites on a flyway between Western Siberia and the Indian Subcontinent. (doi: 10.1038/s41598-022-09246-1) Sci Reports 12(1): 5581, 2022

  4. Карякин ИВ, Николенко ЭГ, Шнайдер ЕП, Зиневич ЛС, Пуликова ГИ, Андреенкова НГ, Бартошук К, Хорват М, Юхаш Т, Проммер М. Развитие ветроэнергетики в восточном Казахстане угрожает мигрирующим орлам. (doi: 10.19074/1814-8654-2021-43-108-213) Пернатые хищники и их охрана 43: 108-213, 2021

  5. Andreyenkova NG, Karyakin IV, Starikov IJ, Sauer-Gürth H, Literák I, Andreyenkov OV, Shnayder EP, Bekmansurov RH, Alexeyenko MN, Wink M, Zhimulev IF. Phylogeography and demographic history of the black kite Milvus migrans, a widespread raptor in Eurasia, Australia and Africa. (doi: 10.1111/jav.02822) J Avian Biol 52(10): e02822, 2021 

  6. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулёв ИФ, Богомолова ИН, Равкин ЮС, Цыбулин СМ, Кашинская ЮО, Штоль ДА. Инвазии ястребиной совы в лесостепь Западной Сибири. (doi: 10.19074/1814-8654-2020-40-116-124) Пернатые хищники и их охрана 40: 116-124, 2020

  7. Levitsky VG, Zykova TYu, Moshkin YuM, Zhimulev IF. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in Drosophila interphase chromosomes. (doi: 10.3390/ijms21239282) Int J Mol Sci 21(23): 9282, 2020

  8. Жимулев ИФ, Антоненко ОВ, Деева ЕА, Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Цыбулин СМ, Богомолова ИН, Равкин ЮС, Зыкова ТЮ, Кашинская ЮО, Романов КВ, Сысоев БА, Шнайдер ЕП, Штоль ДА, Машков ВЕ, Жимулев ЕИ, Карякин ИВ. Встречи птиц, редких для Новосибирского Академгородка и его окрестностей на Правобережье Оби (Новосибирская область). Русский орнитологический журнал 29(1959): 3611-3631, 2020

  9. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Применение CRISPR/Cas9 для получения в геноме Drosophila melanogaster направленных делеций и введения сайта интеграции из системы attP/attB фага ФС31. В кн. Методы редактирования генов и геномов (отв. ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ВВ Власов). Новосибирск: Издательство СО РАН, 2020, гл. 8, с. 117-131

  10. Khoroshko VA, Pokholkova GV, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.3390/genes11040417) Genes 11(4): 417, 2020

  11. Demakova OV, Demakov SA, Boldyreva LV, Zykova TYu, Levitsky VG, Semeshin VF, Pokholkova GV, Sidorenko DS, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes. (doi: 10.1007/s00412-019-00728-2) Chromosoma 129(1): 25-44, 2020

  12. Literák I, Skyrpan M, Andreyenkova NG. A mixed pair of black and red kites in ukraine, including DNA analysis of hybrid offspring. (doi: 10.2478/s11756-019-00268-1) Biologia 75: 115-120, 2020

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0014 (122011400181-7) Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Гранты РНФ

23-24-00185 (123020800025-1) Генетическая история и экологические риски для мигрирующих хищных птиц восточной Азии на примере черного коршуна. Андреенкова НГ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Демаков СА, Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Шварц МБ, Тихомиров СА, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Применение систем направленного редактирования генома в изучении структурнофункциональной организации интерфазных хромосом Drosophila. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 39

  2. Шальнова МА, Андреенкова НГ, Карякин ИВ, Шнайдер ЕП, Жимулев ИФ. Разработка морфометрических формул для полевого определения пола птенцов некоторых хищных птиц в Алтае-Саянском регионе. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 108-111. ISBN: 978-5-907349-09-4

  3. Андреенкова НГ, Андреенков ОВ, Карякин ИВ, Стариков ИЮ, Литерак И, Винк М, Жимулев ИФ. Распространение и демографическая история подвидов черного коршуна. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 126-129. ISBN: 978-5-907349-09-4

  4. Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулев ИФ, Урусов ЛВ. Гнездование соколообразных и совообразных в искусственных гнездовьях в Новосибирской области. В сборнике Хищные птицы в ландшафтах северной Евразии. Современные вызовы и тренды. Материалы VIII Международной конференции Рабочей группы по хищным птицам Северной Евразии, посвященной памяти АИ Шепеля. Тамбов, 2020. с. 283-287. ISBN: 978-5-907349-09-4

  5. Жимулев ИФ, Демаков СА. Хромосома 2018. Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 127-128, 2019

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Демаков СА. Применение систем направленного редактирования генома в изучении структурно-функциональной организации интерфазных хромосом Drosophila. Юбилейная конференция "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века". 3-8 октября 2022, Москва

  2. Andreyenkov OV. Directed formation of deletions in Notch regulatory region using CRISPR-Cas-mediated targeted genome editing method. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  3. Andreyenkova NG. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  4. Zykova TYu. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  5. Демаков СА. Методы генетической коррекции у дрозофилы. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  6. Зыкова ТЮ. Организация промоторов повсеместно активных генов. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  7. Zykova T. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus, June 19-22, 2017, Nizhny Novgorod, Russia

  8. Zykova T. Molecular and genetic organization of chromatin in the composition of Drosophila interphase chromosomes. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  9. Sidorenko D. A combined method for mapping polytene chromosome binding pattern in the fourth microchromosome of Drosophila melanogaster. 13th International conference on Drosophila heterochromatin, June 4-10, 2017, Cagliari, Italy

  10. Демаков СА. Современные методы изучения геномов эукариот. Обзорные лекции для студентов, аспирантов, молодых ученых и преподавателей Курганского государственного университета. 10-11 апреля 2017, Курган

  11. Zykova TYu. Chromosomal organization of Drosophila genome. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis – 2016", November 25, 2016, Novosibirsk

  12. Zykova T. Structural and genetic domains of interphase chromosomes in Drosophila melanogaster. 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology (CMCB-2016), April 25-28 2016, Dalian, China

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

Fordham University, New York, NY, USA
Генетический анализ гена дрозофилы – гомолога гена восприимчивости рака предстательной железы у человека

Награды: 

Премия РАН имени НК Кольцова

Демаков СА (2021)

Медаль и премия Европейской академии (Academia Europaea) для молодых ученых

Зыкова ТЮ (2012)

Премия СО РАН для молодых ученых им. ДК Беляева

Зыкова ТЮ (2012)

Памятный знак "За труд на благо города"

Волкова ЕИ, Корнеева ЛА (2013)

Отдел регуляции генетических процессов