Отдел разнообразия и эволюции геномов

Сектор хромосомных патологий

Юдкин Дмитрий Владимирович
Заведующий сектором

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Юдкин Дмитрий Владимирович зав. сектором совместитель кбн dimatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpgscopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Лемская (Ситникова) Наталья Анатольевна нс кбн lemnatatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Грищенко Ирина Владимировна мнс совместитель   framiraatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Дольский Александр Алексеевич мнс совместитель   dolskiy [dot] alexatmcb [dot] nsc [dot] ru

Бывшие сотрудники:

Бобокова Туяна Сергеевна, кмн
Галанина Екатерина Максимовна
Колесникова Ирина Станиславовна, кбн
Телепова Алена Сергеевна

Публикации: 

  1. Pavlova SV, Biltueva LS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Shchinov AV, Abramov AV, Rozhnov VV. First cytogenetic analysis of lesser gymnures (Mammalia, Galericidae, Hylomys) from Vietnam. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27207Comp Cytogen 12(3): 361-372, 2018

  2. Lemskaya NA. A modified protocol for highly efficient EBV-mediated immortalization of human B lymphocytes from small volumes of peripheral blood serum. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.10.002) Egypt J Med Hum Genet 19(3): 221-223, 2018

  3. Колесникова ИС, Тулупов АА, Дольский АА, Лемская НА, Савелов АА, Петровский ЕД, Антонов АА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Сергеева ИГ, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная экспрессия рРНК у пациента с интеллектуальной недостаточностью и семейным случаем хромосомы 13р+. (doi: 10.20538/1682-0363-2018-1-243-253Бюллетень сибирской медицины 17(1): 243-253, 2018

  4. Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Kolesnikova IS, Yudkin DV. Robertsonian translocation 13/14 associated with rRNA genes overexpression and intellectual disability. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.11.002Egypt J Med Hum Genet 19(2): 141-145, 2018

  5. Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Graphodatsky AS, Galanina EM, Yudkin DV. Alteration of rRNA gene copy number and expression in patients with intellectual disability and heteromorphic acrocentric chromosomes. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.08.010Egypt J Med Hum Genet 19(2): 129-134, 2018

  6. Telepova AS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Yudkin DV. X-derived marker chromosome in patient with mosaic Turner syndrome and Dandy-Walker syndrome: a case report. (doi: 10.1186/s13039-017-0344-2Mol Cytogenet 10: 43, 2017

  7. Dolskiy AA, Pustylnyak VO, Yarushkin AA, Lemskaya NA, Yudkin DV. Inhibitors of histone deacetylases are weak activators of the FMR1 gene in Fragile X syndrome cell lines. (doi: 10.1155/2017/3582601Hindawi BioMed Res Int 2017: 3582601, 2017

  8. Исанова ЕР, Петровский ЕД, Савелов АА, Юдкин ДВ, Лемская НА, Дольский АА, Тулупов АА. Исследование нейрональной активности головного мозга у пациентов с синдромом ломкой х-хромосомы методом функциональной МРТ. Rus Electron J Radiol (REJR) 7(3): 23-30, 2017

  9. Biltueva LS, Prokopov DY, Makunin AI, Komissarov AS, Kudryavtseva AV, Lemskaya NA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Romanenko SA, Gladkikh OL, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Genomic organization and physical mapping of tandemly arranged repetitive DNAs in sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.1159/000479472Cytogenet Genome Res 152: 148-157, 2017

  10. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Larkin DM, Farré M, Kukekova AV, Johnson JL, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Roelke-Parker ME, Bellizzi J, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3390/genes8090216Genes 8(9): 216, 2017

  11. Бобокова ТС, Лемская НА, Колесникова ИС, Юдкин ДВ. Метод молекулярно-цитогенетической визуализации ломкого сайта FRAXA. (doi: 10.1134/S0026893317040069Мол Биол 51(4): 704-709, 2017

  12. Dolskiy AD, Kolesnikova IS, Yudkin DV. 5-Azadeoxycitidine and Trichostatin A in FMR1 gene reactivation. (doi: 10.19080/IJCSMB.2017.01.555573Int J Cell Sci & Mol Biol 1(5): 555573, 2017

  13. Galanina EM, Tulupov AA, Lemskaya NA, Korostyshevskaya AM, Maksimova YV, Shorina AR, Savelov AA, Sergeeva IG, Isanova ER, Grishchenko IV, Yudkin DV. A female patient with FMR1 premutation and mosaic X chromosome aneuploidy and two sons with intellectual disability. (doi: 10.1159/000453060Mol Syndromol 8: 110-114, 2017

  14. Gladkikh OL, Romanenko SA, Lemskaya NA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Kovalskaya JM, Smorkatcheva AV, Golenishchev FN, Perelman PL, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Rapid karyotype evolution in Lasiopodomys involved at least two autosome – sex chromosome translocations. (doi: 10.1371/journal.pone.0167653PLoS ONE 11(12): e0167653, 2016

  15. Trifonov VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Stanyon R, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of acipenseriform genomes. (doi: 10.1007/s00412-016-0609-2Chromosoma 125: 661-668, 2016

  16. Tchurikov NA, Yudkin DV, Gorbacheva MA, Kulemzina AI, Grischenko IV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Kravatsky YuV, Kretova OV. Hot spots of DNA double-strand breaks in human rDNA units are produced in vivo. (doi: 10.1038/srep25866Sci Reports 6: 25866, 2016

  17. Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Comparative chromosome map and heterochromatin features of the gray whale karyotype (Cetacea). (doi: 10.1159/000445459Cytogenet Genome Res 148: 25-34, 2016

  18. Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, Graphodatsky AS. The ancestral carnivore karyotype as substantiated by comparative chromosome painting of three pinnipeds, the walrus, the steller sea lion and the Baikal seal (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.1371/journal.pone.0147647PLoS ONE 11(1): e0147647, 2016

  19. Romanenko SA, Lemskaya NA, Trifonov VA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Bulatova NSh, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Genome-wide comparative chromosome maps of Arvicola amphibius, Dicrostonyx torquatus, and Myodes rutilus. (doi: 10.1007/s10577-015-9504-6Chromosome Res 24: 145-159, 2016

  20. Romanenko SA, Biltueva LS, Serdyukova NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Gladkikh OL, Lemskaya NA, Interesova EA, Korentovich MA, Vorobieva NV, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Segmental paleotetraploidy revealed in sterlet (Acipenser ruthenus) genome by chromosome painting. (doi: 10.1186/s13039-015-0194-8Mol Cytogenet 8: 90, 2015

  21. Lemskaya NA, Kartavtseva IV, Rubtsova NV, Golenishchev FN, Sheremetyeva IN, Graphodatsky AS. Chromosome polymorphism in Microtus (Alexandromys) mujanensis (Arvicolinae, Rodentia). (doi: 10.1159/000439096Cytogenet Genome Res 146: 238-242, 2015

  22. Юдкин ДВ, Лемская НА, Грищенко ИВ, Дольский АА. Изменение состава хроматина при экспансии тринуклеотидного повтора CGG в гене fmr1Молекулярная биология 49: 205-211, 2015

  23. Yudkin D, Hayward B, Aladjem MI, Kumari D, Usdin K. Chromosome fragility and the abnormal replication of the FMR1 locus in Fragile X syndrome. (doi: 10.1093/hmg/ddu006Hum Mol Genet 23: 2940-2952, 2014

Публикации старше 5 лет

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

0310-2018-0011 Изучение разнообразия геномов человека и животных. Графодатский АС

Гранты РФФИ

18-04-00826 Оценка частоты и характеристика хромосомных аберраций в выборке пациентов с интеллектуальной недостаточностью и аутизмом. Лемская НА

18-34-00336 Исследование влияния активной транскрипции на экспансию повтора (CGG)n в культуре клеток человека. Грищенко ИВ

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Юдкин ДВ, Грищенко ИВ, Максимова ЮВ, Шорина АР. Молекулярная структура 5’нетранслируемой области гена FMR1 и тяжесть симптомов у пациентов с синдромом ломкой Х-хромосомы. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 194

  2. Пурвиньш ЯВ, Юдкин ДВ, Грищенко ИВ. Исследование влияния активной транскрипции на экспансию (ЦГГ)n повторов нормальной длины в модельных линиях иммортализованных В-лимфоцитов пациентов с синдромом ломкой Х-хромосомы. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 161-162

  3. Лемская НА, Телепова АС, Романенко СА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Юдкин ДВ. Маркерные хромосомы, выявленные у пациентов с интеллектуальной недостаточностью. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 132

  4. Грищенко ИВ, Пурвиньш ЯВ, Юдкин ДВ. Исследование влияния активной транскрипции на экспансию увеличенного повтора (ЦГГ)n в культуре клеток человека. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с.114-115

  5. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 63

  6. Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maximova YuV, Shorina AR, Graphodatskiy AS, Yudkin DV. Altered rRNA levels in possible connection to intellectual disability. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 36-37

  7. Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution and Ancestral Carnivore Karyotype refinement revealed by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 5-6

  8. Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromo-some painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748Comp Cytogen 12(3): 306-307, 2018
  9. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748) ​Comp Cytogen 12(3): 307-308, 2018 

  10. Колесникова ИС, Дольский АА, Лемская НА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная активность амплифицированных генов рибосомной РНК на хромосоме 13 у ребенка с умственной отсталостью: исследование семейного случая. Молекулярная диагностика 2017. Сборник трудов IХ Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Москва, 2017. с. 76-77

  11. Isanova E, Petrovskiy E, Savelov A, Yudkin D, Tulupov A. Resting-state fMRI study of patients with fragile X syndrome. (doi :10.1088/1742-6596/886/1/012007J Phys Conf Series 886: 012007, 2017

  12. Антонов АА, Исанова ЕР, Савелов АА, Юдкин ДВ, Тулупов АА. Исследование нарушений структуры белого вещества головного мозга у пациентов с синдромом ломкой Х-хромосомы. Лучевая диагностика и терапия 2: 45, 2017

  13. Исанова ЕР, Савелов АА, Петровский ЕД, Юдкин ДВ, Тулупов АА. Возможности функциональной магниторезонансной томографии в оценке нейрональной активности у пациентов с синдромом ломкой Х-хромосомы. Лучевая диагностика и терапия 2: 52, 2017

  14. Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Chromosome organization features of the grey whale (Cetacea). Chromosome Res 24 (Suppl 1): S28, 2016

  15. Trifonov  VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Prokopov DY, Vorobieva NV, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of Sturgeon genomes. Cytogenet Genome Res 148: 103, 2016

  16. Beklemisheva  V, Perelman P, Lemskaya N, Kulemzina A, Proskuryakova A, Burkanov V, Graphodatsky A. Refinement of the ancestral Carnivore karyotype based on comparative chromosome painting of Pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). Cytogenet Genome Res 148: 105, 2016

Доклады: 
  1. Yudkin DV. Molecular structure of 5' untranslated region of FMR1 gene and symptoms severity in Fragile X syndrome patients. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  2. Kolesnikova I. Alteration of rRNA expression levels in patients with intellectual disability and enlarged p-arms on acrocentric autosomes. International mini-conference “Chromosomes and mitosis – 2017”, December 8, 2017, Novosibirsk

  3. Юдкин ДВ. Молекулярные основы синдрома Мартина-Белл. Новые направления нейробиологии и нейровизуализации, 26-27 ноября 2015, Новосибирск

  4. Yudkin DV. Chromosome fragile sites visualization. Personalised Health EMBL/Stanford Conference, 16-19 November 2015, Heidelberg, Germany

  5. Юдкин ДВ. Экспансия повторов как причина наследственных заболеваний. VIII Всероссийский с международным участием Конгресс молодых ученых-биологов "Симбиоз – Россия 2015", 5-9 октября 2015, Новосибирcк

  6. Юдкин ДВ. Chromosome fragility and abnormal replication in FMR1 locus in fragile X syndrome patients. Международная конференция Хромосома-2015, 24-28 августа 2015, Новосибирск

  7. Юдкин ДВ. Исследование причин ломкости хромосом у пациентов с синдромом ломкой Х-хромосомы. OpenBIO, 7-8 октября 2014, Кольцово, Новосибирская обл.

  8. Юдкин ДВ. Молекулярно-цитогенетические исследования ломкости хромосом при синдроме Мартина-Белл. Фундаментальные науки – медицине, 16-20 сентября 2013, Новосибирск

  9. Лемская НА. Сравнительная цитогенетика десяти видов полевок рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia). Международная конференция Хромосома-2009, 31 августа-6 сентября 2009, Новосибирск

  10. Lemskaya NA. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). 11th International Conference Rodens et Spatium on Rodent Biology. 24-28 июля 2008, Мышкин, Россия

Международное сотрудничество: 

National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, Bethesda, MD, USA
Исследования синдрома ломкой Х-хромосомы

Награды: 

Премия для молодых ученых Генетического общества США (Genetic Society of America)

Юдкин ДВ (2005)

Премия мэрии города Новосибирска в сфере науки и инноваций

Лемская НА (2018)
Грищенко ИВ (2018)